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运用二代测序技术确认PCR-SSOP法检出的HLA罕见等位基因: 2023年; 目的:确认PCR-序列特异性寡核苷酸探针(SSOP)法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果样本的HLA真实基因型。方法:对HLA高分辨组织配型血样采用PCR-SSOP法检出的4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常和3例模棱两可结果进一步采用PCR-直接测序分型(SBT)技术和二代测序(NGS)技术复检确认。结果:采用PCR-SSOP方法检出4例磁珠探针HLA基因分型结果格局异常的样本,加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示,样本1的HLA-A分型结果与已知基因型不完全匹配,NGS分析显示,该等位基因与同源性最接近的等位基因A*31:01:02:01在第2外显子154位G>A变异,导致28位编码氨基酸由缬氨酸变为蛋氨酸(p.Val28Met),样本2的HLA-C结果为C*03:119, 06:02,样本3的HLA-C结果为C*03:03, 07:137,样本4的HLA-B结果为B*55:02,55:12。采用PCR-SSOP方法检出3例模棱两可结果样本,加做SBT及NGS两种方法复检后结果显示,样本5的HLA-B结果为B*15:58, 38:02,样本6的HLA-DRB1结果为DRB1*04:05, 14:101,样本7的HLA-DQB1结果为DQB1*03:34,05:02。其中等位基因C*03:119、C*07:137和DRB1*14:101均未收录于中国造血干细胞捐献者资料库的常见及确认等位基因(CWD)表2.4版本。结论:PCR-SSOP法磁珠探针HLA基因分型结果格局异常提示可能为HLA罕见等位基因或新等位基因,需要测序验证。; 钟显信巫望达全湛柔高素青; 关键词：HLA 等位基因

流式磁珠PCR-SSOP方法HLA基因分型可疑结果的确认分析被引量：3: 2016年; 目的对PCR-SSOP方法未明确HLA分型结果的可疑样本进一步分型,并分析原因。方法对采用PCRSSOP方法进行HLA分型出现的131例可疑样本采用LABScan3D分型方法进行检测。对于3D分型仍不能确定的样本采用PCR-SBT分型方法进行检测。结果 131例可疑样本分析,其中87例LABScan3D分型方法可确定分型结果,余下的44例采用PCR-SBT获得分型结果,3种分型方法检测结果在低分水平上是完全一致的。结论 LABScan3D分型方法在PCR-SSOP的基础上进一步发展,可代替其进行大量样本的HLA分型,但是仍有引物探针的局限,不能代替SBT的地位。; 康轶青刘铮张丽马茹杜鹃杨贺才胡迎春张伯伟; 关键词：人类白细胞抗原

流式磁珠PCR-SSOP法漏检2例HLA-A位点罕见基因型的原因分析被引量：7: 2011年; 目的对采用流式磁珠PCR-SSOP法复核2例HLA-A位点罕见基因型,查找分析原因。方法对2 688例HLA-A、B、DRB1SBT基因分型结果中43例罕见型结果,采用流式磁珠PCR-SSOP法复核,查找差异,确定分型,并分析差异结果原因。结果 2例罕见基因型在流式磁珠PCR-SSOP法同一批号03A高分试剂中均有1组磁珠假阳性,造成HLA-A位点罕见基因型漏检。2例罕见基因型在流式磁珠PCR-SSOP法同一批号004高分试剂检测结果与SBT结果一致。结论 HLA罕见基因型不能轻易排除,应用多种方法复核,保证HLA基因分型结果的准确。; 章旭林凤秋李剑平; 关键词：PCR-SSOP SBT HLA-A

DNA芯片技术与PCR-SSOP流式仪技术HLA检测结果比较被引量：1: 2007年; 目的比较DNA芯片技术与PCR-SSOP流式分析仪技术HLA检测结果。方法采用DNA芯片技术对已用PCR-SSOP流式分析仪技术检测并质检合格的15000份骨髓库标本中按2%随机抽检的样品300人份及PCR-SSOP流式分析仪技术中出现的基因型分不开标本424人份进行HLA分型检测。结果300份随机抽检样品DNA芯片技术复检结果完全正确,PCR-SSOP流式分析仪技术分不开的基因型DNA芯片技术全部检出了确切结果。结论DNA芯片技术具有更高的分辨率,可以满足HLA分型检测的质量要求。; 赵磊张伯伟马茹杜娟王艺芳; 关键词：DNA芯片 HLA

PCR-SSOP并Southern杂交检测实验室筛选耐氧氟沙星结核分枝杆菌的研究: 2004年; 目的探讨PCR-SSCP并Southern杂交检测耐氧氟沙星(OFLX)结核分枝杆菌的可行性，并探索结核分枝杆菌对OFLX敏感与耐药的界限。方法 ①体外诱导筛选耐OFLX的自然突变株，并检测OFLX对这些耐药株的最低抑菌浓度(MIC)和最低杀菌浓度(MBC)；②扩增结核分枝杆菌的gyrA基因(包括H37Rv、H37Ra、临床分离的OFLX敏感株及体外诱导筛选的耐OFLX的菌株)并对此扩增产物进行单链构象多态性(SSCP)分析及Southern杂交，以判定应用该技术的效果。结果经PCR-SSCP及Southern杂交检测，85株体外诱导的自然耐OFLX菌株，均检测到gyrA基因突变。研究发现．在OFLX 10μg／ml这一点上，明显地存在着一个耐OFLX结核分枝杆菌对OFLX敏感与耐药并存的交叉区。结论PCR-SSCP合并Southern杂交可清晰地区分OFLN敏感与耐药株。本研究结果显示，以10μg／ml为界作，为判别耐OFLX的标准是适宜的。; 张健源王甦民李传友田苗张旭霞赵冰李卫民赵雁林邱云青马玙; 关键词：结核分枝杆菌 SOUTHERN杂交 MBC 敏感株 PCR-SSOP

应用PCR-SSOP技术对陕西克山病人HLA-DRB1基因分型的研究被引量：1: 2003年; 目的　了解陕西克山病人HLA -DRB1基因多态性的特征。方法　应用PCR -SSOP技术对 118例克山病人进行HLA -DRB1基因分型。结果　鉴定了克山病人HLA -DRB1位点的 10种等位基因 ,其中高频率分布的有DR15、DR4、DR9。结论　提供了一套比较完整准确的陕西克山病人DRB1等位基因的基因频率 ,对群体遗传和疾病关联研究具有参考意义。; 牛小麟王亚萍张洪波朱建宏魏瑾董新; 关键词：克山病 HLA-DRBL 基因分型基因多态性

应用PCR-SSOP技术进行大样本脐血HLA基因分型的探讨被引量：1: 2003年; 目的:探讨一种高效、快速、准确、省力并能批量检测HLA基因分型的方法。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)反向杂交技术对天津地区汉族健康新生儿脐血HLA-A、B、DR位点进行中低分辨基因分型。结果:共检出72种HLA-Ⅰ、Ⅱ类特异性抗原,其中A位点抗原检出19种;B位点抗原检出40种;DR位点抗原检出13种。结论:PCR-SSOP是一种结果相对准确稳定、操作简便快速、适用于脐血库等进行大样本分型检测HLA多态性的分子生物学技术。; 梁晓岚杨丛林燕丽谢云富王晓静邱录贵; 关键词：HLA抗原 HLA基因分型脐血

反向PCR-SSOP技术行HLA-AB分型与临床应用被引量：7: 2001年; 建立快速、准确的DNA分型技术并用于临床移植前HLA AB配型 ,以弥补血清学分型技术的局限性。采用反向聚合酶链反应序列特异寡核苷酸探针杂交技术 (反向PCR SSOP)进行DNA分型 ,可检出HLA A( 0 10 1- 80 0 1)和B( 0 70 2 1- 82 0 1)等等位基因。结果表明 ,发现利用反向PCR SSOP技术对所有样本分型均获成功 ,无假阳性和假阴性结果出现 ;美国洛杉矶加州大学 (UCLA)质控细胞DNA分型结果与UCLA公布的测序结果一致 ;血清学与基因分型相比 ,血清学结果HLA A错检率 6 .4 %和HLA B错检率为 7.4 %。 2例白血病病人分别有一个HLA抗原血清学方法不能检出。结论提示 ,反向PCR SSOP技术用于HLA分型分辨率高 ,简单快速 ,结果直观、准确 ,分型结果较血清学方法更加精确 ,可适用于临床应用。; 冯明亮季芸马俊陆琼稽月华张工梁杨颍; 关键词：移植手术

116例脐血PCR-SSP和PCR-SSOP的HLA-DR分型结果分析被引量：1: 2001年; 汤雪薇廖灿黄以宁谢杏梅; 关键词：脐血 PCR-SSP PCR-SSOP 脐血移植

单克隆抗体法、PCR-SSP法及PCR-SSOP法在HLA-DR分型中的比较: 2001年; 毕熲廖灿陈连周傅茜陈规划; 关键词：单克隆抗体 HLA-DR

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