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基于生物信息学数据库分析CENP-A在膀胱癌中的表达及临床意义
2024年
目的探讨着丝粒蛋白A(CENP-A)在膀胱癌患者中的表达和临床意义。方法从高通量基因表达(GEO)数据库、癌症基因组图谱(TCGA)数据库、GEPIA在线数据库及UALCAN数据库中提取膀胱癌相关的RNA测序数据,检测CENP-A基因在膀胱癌组织和癌旁组织中的表达情况。从TCGA数据库中纳入191例临床病理参数完整的膀胱癌病例资料,根据CENP-A表达量将其分为高表达组(95例)和低表达组(96例)。分析CENP-A基因表达水平与膀胱癌患者临床病理参数的相关性以及与膀胱癌患者预后的相关性。结果在GEO数据库中选取GSE13507数据集,得到1112个差异基因,高表达(logFC为正)的数目有281个,低表达(logFC为负)的数目有831个,其中CENP-A及其伴侣分子HJURP均为高表达(P<0.05)。对TCGA数据库中的406例mRNA Seq数据进行差异基因筛选,得到了1736个差异表达基因,高表达(logFC为正)的数目有854个,低表达(logFC为负)的数目有882个,其中CENP-A为高表达。GEPIA、UALCAN数据库分析结果显示,与正常膀胱组织相比,膀胱癌组织中CENP-A mRNA表达水平升高,差异有统计学意义(均P<0.05)。TCGA数据库分析结果显示,膀胱癌组织中的CENP-A表达水平与膀胱癌患者的年龄、性别、肿瘤浸润程度、淋巴结转移、病理分期均无相关性(均P>0.05),而与肿瘤远处转移有相关性(P<0.05)。单因素分析结果显示,年龄、肿瘤浸润程度、淋巴结转移、远处转移、病理分期均能作为膀胱癌潜在的预后因素(均P<0.05)。多因素Cox模回归分析结果显示,年龄是影响膀胱癌患者预后的独立因素(P<0.05)。结论CENP-A在膀胱癌组织中表达上调且与膀胱癌患者的远处转移情况相关,可能成为膀胱癌精准分子诊断的潜在靶基因,在其诊断治疗和预后判断中发挥重要的作用。
翟雨晴汪煜琳曹文静原江水张宗亮
关键词:膀胱肿瘤远处转移
Aurora B promotes the CENP-T–CENP-W interaction to guide accurate chromosome segregation in mitosis
2024年
Accurate chromosome segregation in mitosis depends on kinetochores that connect centromeric chromatin to spindle microtubules.Centromeres are captured by individual microtubules via a kinetochore constitutive centromere-associated network(CCAN)during chromosome segregation.CCAN contains 16 subunits,including CENP-W and CENP-T.However,the molecular recognition and mitotic regulation of the CCAN assembly remain elusive.Here,we revealed that CENP-W binds to the histone fold domain and an uncharacterized N-terminal region of CENP-T.Aurora B phosphorylates CENP-W at threonine 60,which enhances the interaction between CENP-W and CENP-T to ensure robust metaphase chromosome alignment and accurate chromosome segregation in mitosis.These findings delineate a conserved signaling cascade that integrates protein phosphorylation with CCAN integrity for the maintenance of genomic stability.
Wei LiuZhen DouChunyue WangGangyin ZhaoFengge WuChunli WangFelix AikhionbareMingliang YeDivine Mensah SedzroZhenye YangChuanhai FuZhikai WangXinjiao GaoXuebiao YaoXiaoyu SongXing Liu
关键词:MITOSISKINETOCHOREPHOSPHORYLATION
CENP-A在HPV感染宫颈癌中的表达及作用机制研究
汪煜琳
Moa1与CENP-C和Rec8的相互作用及其在裂殖酵母减数分裂中的功能
2024年
减数分裂特异性调控分子Moa1定位到着丝粒受到动粒蛋白CENP-C的调控,同时Moa1参与黏连蛋白Rec8介导的着丝粒区域姐妹染色单体的黏连。为了研究这些蛋白质之间的相互作用,本研究利用酵母双杂交实验(yeast two-hybrid assay)测定分析了Moa1和CENP-C、Rec8之间的相互作用,并通过在Moa1中定点突变鉴定了与CENP-C和Rec8相互作用所需的一些氨基酸残基。实验结果表明,Moa1和CENP-C的相互作用对于Moa1参与调节姐妹动粒的单极附着很重要。然而,双杂交实验中与Rec8相互作用所需的Moa1的S143和T150突变没有显示出Moa1或Rec8功能的显著缺陷。这表明氨基酸残基的突变可能不足以干扰体内Moa1和Rec8之间的相互作用,需要进一步的研究来确定Moa1和Rec8的相互作用域。本研究揭示了影响减数分裂同源染色体分离的Moa1氨基酸位点,为减数分裂的染色体分离机制提供更深入的理解。
闵羽倪子涵马玲玲渡边嘉典
关键词:减数分裂动粒
着丝粒蛋白A在宫颈癌组织中的表达及临床意义
2024年
目的:分析着丝粒蛋白A(centromere protein A,CENP-A)在宫颈癌中的表达情况,与临床病理参数相关性及临床意义。方法:GEPIA和HPA数据库分析CENP-A基因及蛋白在宫颈癌组织中的表达情况;免疫组化检测宫颈癌中CENP-A蛋白的表达水平,分析其与临床病理参数之间的关系;使用Linked Omics数据库寻找与CENP-A共表达基因,分析CENP-A可能参与宫颈癌发生发展的信号通路。结果:生物信息学分析显示宫颈癌组织中CENP-A基因和蛋白的表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05);免疫组化结果显示宫颈癌组织CENP-A蛋白表达水平显著高于癌旁组织(P<0.05),且与患者的肿瘤分期及浸润程度相关。通过基因共表达分析,KIF2C、CDC20、FAM72B等基因与CENP-A表达呈正相关,PARM1、ABCA9和SYNE1等基因与CENP-A表达呈负相关(FDR<0.05),CENP-A基因参与了细胞周期、DNA复制等途径。结论:CENP-A在宫颈癌组织中高表达,与宫颈癌的预后以及发生发展相关。
汪煜琳曹文静翟雨晴原江水宋卫青
关键词:宫颈癌免疫组化生物信息学分析
CENP-B抗体介导卵母细胞异常受精机制的研究
田雨晴
着丝粒蛋白CENP-M小分子抑制剂cenpemlin及其制备方法与应用
本发明公开了着丝粒蛋白CENP‑M小分子抑制剂cenpemlin及其制备方法与应用。本发明通过解析CENP‑M与CENP‑L精细结构的蛋白位面信息,靶向筛选到小分子化合物cenpemlin。生物化学与细胞学实验结果均表明...
姚雪彪刘行杨丰瑞马明明
细胞分裂调控重要着丝粒蛋白CENP-N靶向抑制剂Cenpenlin及其应用
本发明公开了细胞分裂调控重要着丝粒蛋白CENP‑N靶向抑制剂Cenpenlin及其应用。式I所示化合物在制备具有如下功能的产品中的应用:1)着丝粒蛋白CENP‑N靶向抑制剂;2)影响染色体正常排列及延迟有丝分裂进程的试剂...
姚雪彪刘行高新娇马明明
FOXM1与CENP-A在骨肉瘤化疗耐药中的关系及其作用机制
2023年
目的探讨CENP-A是否参与骨肉瘤细胞化疗耐药及与叉头框蛋白M1(forkhead box M1,FOXM1)的调控关系。方法采用Western blot法检测骨肉瘤亲本细胞(HOS、U2OS)、顺铂耐药细胞(HOS/R、U2OS/R)和稳定FOXM1过表达细胞(HOS/FOXM1、U2OS/FOXM1)中CENP-A蛋白表达。转染siRNA后检测CENP-A蛋白表达;运用CCK-8细胞增殖实验观察siRNA敲低CENP-A后耐药骨肉瘤细胞对顺铂敏感性的影响;FOXM1抑制剂RCM1处理后检测CENP-A蛋白表达。Kaplan-Meier法分析GEPIA数据库中CENP-A表达与患者预后的关系,Spearman相关性分析CENP-A和FOXM1两者之间的关系。结果骨肉瘤顺铂耐药细胞中CENP-A蛋白表达比亲本细胞明显升高(0.52±0.03 vs 0.92±0.01,0.33±0.02 vs 1.12±0.01),FOXM1过表达细胞中CENP-A表达较空载体对照亦明显增高;在骨肉瘤顺铂耐药和FOXM1过表达细胞中转染siRNA-CENP-A后,CENP-A蛋白表达均明显降低(0.84±0.01 vs 0.60±0.02,0.98±0.01 vs 0.41±0.01)。转染siRNA敲低CENP-A后,骨肉瘤耐药细胞和FOXM1过表达细胞对顺铂的耐药性明显降低。10μmol/L RCM1 FOXM1抑制剂处理耐药细胞和FOXM1过表达细胞后,CENP-A蛋白表达均明显下降。生物信息学分析发现CENP-A高表达组患者总生存期显著低于低表达组(P<0.01)。Spearman相关性分析发现CENP-A和FOXM1表达呈正相关(r=0.79)。结论FOXM1可能通过调控CENP-A参与骨肉瘤化疗耐药,为骨肉瘤化疗耐药治疗策略提供新的理论基础。
黄宇航尹诗源李雨晴尹玉蔡永萍
关键词:骨肉瘤化疗耐药CENP-AFOXM1顺铂
Sgo1 interacts with CENP-A to guide accurate chromosome segregation in mitosis
2023年
Shugoshin-1(Sgo1)is necessary for maintaining sister centromere cohesion and ensuring accurate chromosome segregation during mitosis.It has been reported that the localization of Sgo1 at the centromere is dependent on Bub1-mediated phosphorylation of histone H2A at T120.However,it remains uncertain whether other centromeric proteins play a role in regulating the localization and function of Sgo1 during mitosis.Here,we show that CENP-A interacts with Sgo1 and determines the localization of Sgo1 to the centromere during mitosis.Further biochemical characterization revealed that lysine and arginine residues in the C-terminal domain of Sgo1 are critical for binding CENP-A.Interestingly,the replacement of these basic amino acids with acidic amino acids perturbed the localization of Sgo1 and Aurora B to the centromere,resulting in aberrant chromosome segregation and premature chromatid separation.Taken together,these findings reveal a previously unrecognized but direct link between Sgo1 and CENP-A in centromere plasticity control and illustrate how the Sgo1–CENP-A interaction guides accurate cell division.
Fengge WuHameed AkbarChunyue WangXiao YuanZhen DouMcKay MullenLiwen NiuLiang ZhangJianye ZangZhikai WangXuebiao YaoXiaoyu SongXing Liu
关键词:MITOSISCENTROMEREKINETOCHORECENP-A