洪捷 作品数:11 被引量:26 H指数:3 供职机构: 江苏省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 江苏省医学重点学科基金 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 更多>>
江苏省首例人感染猪种布鲁菌的分子诊断及特征分析 2020年 目的鉴定人感染猪种布鲁菌,掌握其生物及分子特征,为布鲁菌病的防控提供依据。方法自江苏省首例人感染猪种布鲁菌患者体内分离布鲁菌菌株,采用血清凝集试验进行血清分型;采用普通PCR方法进行布鲁菌特异性基因bcsp-31检测;采用AMOS-PCR方法进行分型序列IS-711鉴定;采用多重PCR方法进行种及生物型鉴定,对wboA基因扩增产物进行测序,并构建系统发育树;采用多位点序列分析(multilocus sequence analysis,MLSA)进行分子分型分析,并与参考菌株进行聚类分析。结果通过血清凝集试验及PCR方法,确认该菌为猪种布鲁菌生物3型。wboA基因测序后,参考序列聚类分析发现与生物3型猪种布鲁菌str.686(CP007719)最为接近。MLSA分型为ST17型(1-6-4-1-5-3-5-2-4)。结论江苏省首次发现人感染猪种布鲁菌生物3型,MLSA分型为ST17型。今后在该地区进行人间布鲁菌病防控的同时,还应积极与畜牧兽医部门合作,加强生猪的检疫、免疫等防治措施。 谈忠鸣 汪秀斌 周伟忠 董晨 周璐 洪捷 钱慧敏 胡建利 鲍倡俊关键词:多重PCR 无菌部位分离65株金黄色葡萄球菌耐药情况及耐药机制 被引量:1 2019年 目的研究无菌部位分离的金黄色葡萄球菌(金葡菌)对红霉素、克林霉素耐药率及耐药机制。方法微量肉汤稀释法检测金葡菌3种抗生素的最小抑菌浓度以及克林霉素诱导试验,采用PCR检测4种耐药基因。结果65株金葡菌中,共检出耐甲氧西林金葡菌(MRSA)35株,甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)30株,MRSA检出率为53.8%;对红霉素、克林霉素耐药率分别为67.7%、33.8%;MRSA的红霉素、克林霉素耐药率均高于MSSA,差异有统计学意义(P值均<0.05)。克林霉素诱导耐药率为95.5%。耐药基因ermC携带率最高,MRSA携带耐药基因数高于MSSA。结论无菌部位分离的金葡菌对红霉素和克林霉素耐药率较高,且MRSA比MSSA携带有更多的耐药基因。 洪捷 周璐 孔筱筱 顾玲 董晨 钱慧敏 谈忠鸣关键词:金黄色葡萄球菌 克林霉素 诱导耐药 分子分型 2018年江苏省人感染布鲁氏菌分离株分子特征分析 被引量:2 2020年 目的掌握江苏省2018年人感染布鲁氏菌主要流行株的种型和基因型。方法运用普通PCR及AMOS多重PCR确认分离株的生物种型;采用多位点序列分型(Multilocus sequence analysis,MLSA)和多位点串联重复序列分析(Multiple-locus variable number tandem repeat analysis,MLVA)鉴定基因型,并与国内外流行株进行聚类分析。结果2018年共分离到56株布鲁氏菌,MLSA分型显示一株菌为猪种布鲁氏菌ST(Sequence type)17型,其他均为羊种布鲁氏菌ST8型。MLVA将56株菌分为47个基因亚型(46个羊种,1个猪种),聚类显示羊种布鲁氏菌全部为“东地中海簇”。结论2018年江苏省人感染布病主要为“东地中海簇”的ST8型羊种布鲁氏菌,并首次发现一例人感染ST17型猪种布鲁氏菌。 谈忠鸣 汪秀斌 周伟忠 董晨 周璐 洪捷 钱慧敏 胡建利 鲍倡俊关键词:布鲁氏菌病 羊种布鲁氏菌 江苏省2016—2021年临床分离铜绿假单胞菌耐药及基因组特征分析 2024年 目的了解江苏地区临床分离的铜绿假单胞菌耐药情况及基因特征。方法收集2016—2021年江苏地区各哨点医院临床分离的铜绿假单胞菌,采用肉汤稀释法对分离株进行10类19种抗菌药物的敏感性测定,对分离株行全基因组测序并多位点序列分型,综合抗菌药物耐药性数据库(CARD)扫描分析耐药基因。结果2016—2021年通过致病菌识别网12个市的哨点医院收集患者分离的铜绿假单胞菌101株。药敏试验结果显示,全部菌株对共计6类8种抗菌药物全部耐药,包括酰胺醇类抗生素氯霉素、磺胺类的复方磺胺甲口恶唑、头孢菌素类的头孢噻肟和头孢唑林、四环素类的四环素、青霉素类的氨苄西林及氨苄西林/舒巴坦以及β-内酰胺类的阿莫西林/克拉维酸;45.54%的分离株为碳青霉烯类耐药菌株,对亚胺培南、美罗培南两种碳青霉烯类抗生素的耐药率已分别达45.54%、39.60%;耐10种以上抗生素的菌株达63.36%;共发现35种耐药表型,其中1株菌对19种抗菌药物广泛耐药,耐药谱为AMC-AM-SAM-CZ-CTX-C-TE-SXT的菌株最多(31.69%,32株)。多位点序列分析发现75个ST型,聚类发现ST 262处于中心点,并遗传进化出11个亚型或分支。全基因组扫描发现6类18种抗菌药物耐药基因,crp P基因的携带情况与表型完全一致。结论2016—2021年江苏地区临床分离的铜绿假单胞菌耐药情况严重,两种碳青霉烯类抗生素的耐药率、耐10种以上抗生素的菌株比例高于国内其他省份,应引起高度重视。 聂俊伟 周璐 瞿志鹏 洪捷 鲍倡俊 谈忠鸣关键词:铜绿假单胞菌 全基因组测序 耐药基因 多位点序列分型 新型冠状病毒检测技术规范 第16部分:核酸数字PCR法 本文件适用于新冠病例、一般人群和重点人群的生物样本,包括口咽拭子、鼻咽拭子、血标本、肛拭子等,以及其他需要检测的样本的核算数字PCR检测 洪捷 林婧 蒋云宇 周恺 周连 王慎骄 朱立国 王尚君 范宇宸 朱宝立 王雅琦 李家琛 董嘉 祝令香 王楠江苏地区不同来源空肠弯曲菌菌株毒力基因分布 被引量:7 2015年 目的了解江苏地区不同来源空肠弯曲菌菌株毒力基因的分布。方法根据已知的特异引物,运用PCR技术,检测空肠弯曲菌菌株6个与毒力相关基因(cadF、virB11、cdtB、csrA、ggt、cst-Ⅱ)分布情况。结果 6个毒力基因,在31株空肠弯曲菌菌株中的分布呈现不同情况。cdtB、cadF和csrA的检出率均为100.0%;cst-Ⅱ为48.4%;ggt为3.2%;31株菌株中均未检出virB11基因。结论毒力基因cadF、cdtB、csrA、ggt、cst-Ⅱ在江苏地区的空肠弯曲菌中均有分布。 洪捷 马恺 谈忠鸣关键词:空肠弯曲菌 毒力基因 检出率 江苏地区A群链球菌耐药及分子特征研究 被引量:2 2021年 目的研究江苏省A群链球菌的耐药性、耐药基因和分子分型的特征联系。方法收集2016年-2018年全省A群链球菌50株,采用微量肉汤稀释法测定12种抗生素最小抑菌浓度,采用PCR方法检测7种不同的耐药基因和转座子Tn916,并采用emm分型、多位点序列分型(MLST)和sof分型方法进行分子分型。结果 50株GAS对四环素、红霉素和克林霉素耐药率较高,对其他9种抗生素均敏感。耐药基因tet M、erm B及转座子Tn916携带率较高,未发现携带tet L的菌株,其他耐药基因携带率较低。emm分型分为5个emm型别,MLST分型分为5个ST型,有25株菌株可以扩增出sof基因,分为3个OF型。引起猩红热的GAS其耐药率、耐药种数和耐药基因携带数均高于引起其他症状的GAS(P <0.05)。主要分子型别之间(emm1和emm12,ST28和ST36,OF可分型和OF不可分型)其转座子Tn916携带率有差异。结论江苏地区GAS对四环素、红霉素和克林霉素耐药率较高,以携带耐药基因tet M和erm B为主,菌株主要emm型别为emm1和emm12,主要ST型别为ST28和ST36,主要OF型为12。 洪捷 谈忠鸣 许可 黄昊頔 李楚楚关键词:A群链球菌 耐药性 转座子 分子分型 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱快速鉴定猪链球菌分离株 被引量:5 2020年 目的评估基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术在猪链球菌快速鉴定中的可行性。方法采用MALDI-TOF-MS法,对江苏省分离的40株猪链球菌及感染后临床症状类似的肺炎链球菌、猩红热链球菌、牛链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌分离株进行分析,评估方法的特异性。分别在脱纤维羊血平板、普通营养琼脂平板及猪链球菌选择性平板上培养24、48、72、120h,鉴定后对结果进行描述分析。结果猪链球菌分离株40株主要为血清2型(占95.0%),分离自病人标本(占75.0%)。以MALDI-TOF-MS法分析,主要离子峰为2667.450、4133.787、4421.894、5968.847、8269.519、9335.019、10990.488、15055.203Da,峰谱稳定,鉴定准确率为100.0%。肺炎链球菌、猩红热链球菌、牛链球菌、金黄色葡萄球菌、流感嗜血杆菌、肺炎克雷伯菌分离株鉴定结果均为阴性。在3种平板上培养24、48、72h,猪链球菌分离株均能被MALDI-TOF-MS准确鉴定。结论建立的MALDI-TOF-MS法具有快速、精准、成本低的优点,可替代Vitek 2、PCR等方法或作为相互验证方法,在有条件的机构应用。 谈忠鸣 周伟忠 董晨 钱慧敏 洪捷 周璐 孔筱筱 胡建利 鲍倡俊关键词:猪链球菌 精胺与β-内酰胺类抗生素对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的协同抗菌功能探讨 被引量:2 2021年 目的研究外源性精胺与β-内酰胺类抗生素联用时对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylo-coccusaureus,MRSA)的抗菌效果。方法收集5株临床MRSA菌株,通过分析全基因组测序结果,进行多位点序列分型和耐药基因预测,并通过纸片扩散法和微量肉汤稀释法,评估精胺和β-内酰胺类抗生素单用/联用时的抗菌效果。结果精胺对MRSA具有一定的抗菌作用,5株菌株有效最小抑菌浓度值均为2mmol/L。精胺与苯唑西林、头孢西丁联合应用时,5株菌株MIC值均出现大幅度下降,显著提高2种药物抗菌效果。结论精胺可显著削弱MRSA对传统β-内酰胺类抗生素抵抗能力,其合理使用有望提高传统β-内酰胺类抗生素使用效果。 李楚楚 洪捷 谈忠鸣 孔筱筱 朱立国 鲍倡俊关键词:耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 精胺 Β-内酰胺类抗生素 抗菌效果 江苏地区空肠弯曲菌多位点序列分型和毒力基因分析 被引量:8 2017年 目的了解江苏地区空肠弯曲菌分离株的病原学特征。方法用PCR方法扩增6个毒力基因(cadF、virB11、cdtB、csrA、ggt和cst-Ⅱ)和MLST的7个管家基因并测序,通过PubMLST数据库比对获得菌株ST型,用E-test法测定细菌的耐药表型。结果在31株空肠弯曲菌分离株中,cdtB、cadF和csrA基因的携带率均为100.0%;cst-Ⅱ为48.4%;ggt为3.2%;未检出virB11基因。31株菌可分为21个ST型,其中10个为首次发现。31株菌对环丙沙星、四环素和红霉素的耐药率分别为64.5%、51.6%和6.5%,未发现对庆大霉素耐药的菌株。结论江苏地区分离的空肠弯曲菌菌株的ST型呈多样性,人和鸡分离株中的优势毒力基因谱分布相似,对红霉素较敏感,而对喹诺酮类药物具有较高的耐药性。 洪捷 马恺 顾玲关键词:空肠弯曲菌 多位点序列分型 耐药性 毒力基因