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棉花无腺体近等基因系差异表达基因分析被引量：4: 2015年; 为了揭示棉花腺体发育的分子机制,本研究利用RNA-Seq对棉花无腺体性状近等基因系Z12/Z12YW的幼嫩叶片进行转录组测序,寻找差异表达基因。转录组测序结果表明,与有腺体棉Z12相比,无腺体棉Z12YW中共有306个基因表达发生变化,其中282个基因下调,24个基因上调。差异表达基因GO(Gene ontology)功能注释显示,细胞组分、胞外基质组分的功能变化以及细胞杀伤生物学过程在腺体形成过程中发挥重要作用;COG(Cluster of orthologous groups)功能和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路显著性富集发现,棉酚等萜烯物质的合成主要受甲羟戊酸途径上游基因的表达调控。此外,本研究共筛选到13个差异表达转录因子,可能在腺体发育和棉酚合成过程中发挥关键作用。; 姜鹏飞陆才瑞邹长松程海亮杨文翠冯晓旭张友平王巧连宋国立; 关键词：腺体近等基因系转录组

棉花茎秆无腺体基因gl1的精细定位及棉酚腺体发育相关基因筛选: 棉花不仅是世界上重要的纤维植物、油料植物，而且是仅次于大豆的重要植物蛋白源。然而，由于一般栽培棉品种的种子和植株具有棉酚腺体，其中含有对人和单胃动物有毒的棉酚及其衍生物，腺体的存在已成为棉籽开发利用的最大障碍。另一方面，...; 陆才瑞; 关键词：棉花

陆地棉耐盐相关基因GhERF79的克隆与分析被引量：4: 2013年; 利用RACE-PCR技术克隆陆地棉ERF基因的全长cDNA,命名为GhERF79,该cDNA长度为980 bp,含有一个完整的ORF(Open reading frame)为756 bp,编码251个氨基酸的多肽;亚细胞定位显示该基因表达产物定位于细胞核中,生物信息学分析表明GhERF79属于ERF转录因子家族内的A-1亚族。Real-time PCR分析结果表明,GhERF79的表达受盐胁迫和植物激素诱导,该基因在耐盐材料中9806中的诱导表达水平显著高于盐敏感材料中棉所12;外源激素ABA(Abscisic acid)、ET(Ethylene)、MeJA(Methyl jasmonate)可以显著诱导GhERF79的表达,推测其可能在棉花响应盐胁迫途径中发挥重要功能。; 王洁琳邹长松陆才瑞王巧莲宋国立; 关键词：陆地棉盐胁迫 ERF 克隆

棉花ISAP标记开发及其分子标记遗传连锁图谱构建: 本研究参照了前人对其它物种的分析结果对植物内含子边界序列进行分析，得到植物内含子边界两端的一致序列，并利用此序列开发出一种新的分子标记ISAP。利用ISAP标记和SRAP标记以中棉所36×海岛棉海7124的69个F<,2...; 陆才瑞; 关键词：棉花分子标记遗传连锁图谱; 文献传递

与亚洲棉光籽突变体DPL972中光籽基因紧密连锁的SSR分子标记的开发与应用（英文）: 2016年; 对棉纤维相关性状基因的克隆及遗传分析可为阐明纤维形成机制奠定良好基础。以野生型材料DPL971及其光籽突变体DPL972为亲本构建F2群体,其中光籽与毛籽性状分离比符合3∶1,表明突变体DPL972中的光籽基因为显性单基因(将其命名为Ga Fzl)。结合棉花基因组数据,合成1567对SSR(Simple sequence repeat)引物,覆盖了A组13条染色体,标记多态性分析和群体连锁分析发现在染色体A08上存在15对与光籽基因Ga Fzl连锁的标记,其中最近的标记为SSR82,遗传距离为6.6 c M。本实验完成了Ga Fzl基因的染色体初步定位,开发了15个与其连锁的SSR标记,为下一步图位克隆奠定了基础。; 冯晓旭邹长松陆才瑞程海亮张友平Mkulama A P Mtawa王巧连宋国立; 关键词：GA SSR 连锁图

与棉花隐性芽黄基因v1紧密连锁的SSR标记及其应用: 本发明公开了与棉花隐性芽黄基因v1紧密连锁的SSR标记及其应用。本发明提供了用于鉴定芽黄棉花的成套引物，所述SSR标记VS2的引物对VS2由序列表序列1和序列2所示的单链DNA组成；所述SSR标记V...; 宋国立张友平左东云王巧连陆才瑞程海亮冯晓旭杨秋红; 文献传递

高通量测序技术结合正向遗传学手段在基因定位研究中的应用被引量：15: 2015年; 传统的利用正向遗传学方法的基因定位一般是通过构建遗传连锁图谱进行的,该过程步骤繁琐、耗时耗力,很多情形下定位精确度低、区间大。随着高通量测序技术的快速发展以及测序成本的不断降低,多种简单快捷的利用测序手段定位基因的方法被开发出来,包括对突变体基因组直接测序定位、突变体材料构建混池测序定位和遗传分离群体测序构建图谱定位等,还可以对转录组和部分基因组进行测序定位。这些方法可以在核苷酸水平鉴定突变位点,并已推广到复杂的遗传背景中。近期报道的一些测序定位甚至是在不依赖于参考基因组序列、遗传杂交和连锁信息的情况下完成的,这使得很多非模式物种也能开展正向遗传学研究。本文就这些新技术及其在基因定位中的应用进行了综述。; 陆才瑞邹长松宋国立; 关键词：高通量测序基因定位

基于10个棉花腺体相关材料转录组的EST-SSR标记开发被引量：5: 2015年; 棉花是重要的经济作物,但有毒棉酚的存在,使棉子得不到充分的利用,所以低酚棉育种是棉花育种的重要内容之一。色素腺体是棉酚的储存器官,开发功能型分子标记,加密棉花遗传图谱对色素腺体和其他重要性状相关基因的研究具有重要作用。本试验以10个有腺体和无腺体材料转录组信息为基础开发EST-SSR标记,在12895条1 kb以上的Unigene中共搜索到1546个SSR位点,发生频率和平均距离分别是11.99%和15.99 kb。得到的EST-SSR中,二碱基和三碱基重复是主要的重复类型,分别占30.85%和48.97%,AT/TA和GAA/CTT分别是二碱基和三碱基的优势重复类型。对长度≥20 bp的SSR共设计合成了56对引物,在这10个材料中进行检测,能扩增出清晰条带的有38对,占67.86%,其中呈多态性的有9对,占23.68%,并对其所在的Unigene功能和表达量进行了初步分析。本研究进一步证明了棉花EST-SSR标记开发的可行性,并且为棉花高密度遗传图谱和腺体相关基因的研究奠定了基础。; 程海亮陆才瑞邹长松余道乾姜鹏飞杨文翠张友平王巧连宋国立; 关键词：棉花色素腺体

与棉花显性无腺体基因Gl2e紧密连锁的SSR标记及其应用: 本发明公开了与棉花显性无腺体基因Gl2e紧密连锁的SSR标记及其应用。所述SSR标记为BS4、BS5和BS6；所述SSR标记BS4的引物对BS4由序列表序列1和序列2所示的单链...; 宋国立陆才瑞程海亮黄娟邹长松张友平王巧连余道乾姜鹏飞杨文翠; 文献传递

获得植物内含子序列扩增多态性的方法及其专用引物: 本发明公开了一种获得植物内含子序列扩增多态性的方法及其专用引物。获得植物内含子序列扩增多态性的专用引物，由正向引物和反向引物组成，所述正向引物和反向引物均由18个核苷酸组成，正向引物的核苷酸序列为5′－NNNNNNNNN...; 喻树迅陆才瑞范术丽宋美珍马淑娟; 文献传递

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陆才瑞