高文超 作品数:19 被引量:45 H指数:3 供职机构: 中山大学附属第三医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
丙型肝炎病毒核心蛋白通过活化stat3通路促进肝癌细胞上皮间质转化的研究 被引量:2 2015年 目的探讨丙型肝炎病毒核心蛋白(HCVc)对肝癌细胞信号转导子和转录激活子3(stat3)通路及上皮间质转化(EMT)的影响。方法将含HCVc基因序列的重组质粒p EGFP-N3-HCVc转染人肝癌细胞Hep G2,Real-Time PCR和Western blotting检测HCVc、总stat3、磷酸化stat3(p-stat3)及EMT指标蛋白E-cadherin、Vimentin、Snail的表达,划痕实验及Transwell实验检测细胞迁移和侵袭情况。结果划痕实验及Transwell实验结果显示,过表达HCVc可增强Hep G2细胞的迁移和侵袭能力;stat3通路抑制剂AG490处理可抑制Hep G2细胞的侵袭能力。RT-PCR和Western blotting结果显示,过表达HCVc后,Hep G2细胞中p-stat3、Vimentin及Snail在表达升高,E-cadherin表达下降;AG490处理可下调p-stat3、Vimentin及Snail表达,增强E-cadherin表达。结论 HCVc可活化stat3通路促进肝癌细胞上皮间质转化,增强肝癌细胞的迁移和侵袭能力。 周嘉嘉 陈汝福 邓小耿 高文超 郑上游 程帝 周泉波 张杰关键词:病毒核心蛋白质类 肝炎 丙型 STAT3 上皮间质转化 白念珠菌Mdr1基因生物信息学分析 2017年 目的:探讨白念珠菌多重耐药基因(Mdr1)DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质。方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Mdr1基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析。结果:Mdr1 DNA中无内含子,Mdr1 mRNA中含有多个调控元件和腺苷酸化位点、AU富集区,对二级结构分析显示,Mdr1 mRNA全长序列可形成棒状结构。蛋白质的理化性质分析显示MDR1蛋白稳定系数为37.14,提示MDR1蛋白较为稳定。Target P 1.1和Signal P 4.1预测结果显示MDR1蛋白不含有线粒体定位序列和分泌信号肽。SWISS-MODEL 3D建模,MDR1蛋白质的3D结构类似于通道管状形态。Motif Scan分析结果显示,MDR1蛋白第116-557个氨基酸构成主要协同转运蛋白超家族,TMHMM预测在此范围内含有12个跨膜区间,为跨膜蛋白。结论:Mdr1基因的表达可能受其它基因的调控,MDR1蛋白为主要协同转运蛋白超家族成员,其功能域或为潜在的药物靶点。 何泰龙 高文超 孙瑶 黄家敏 黄丽林 张静 张云青 李美荣 尹颂超 黄怀球关键词:白念珠菌 MDR1基因 生物信息学 申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析 被引量:1 2018年 目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸。Target P和MotifScan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点。TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽。结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物。 黄家敏 李玉哲 高文超 吴晓雁 孙瑶 黄丽林 张静 李美荣 胡南 旷翠娥 刘佳庆 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 生物信息学 白念珠菌Hog1基因DNA、mRNA、蛋白的生物信息学分析 2016年 目的:探讨白念珠菌Hogl基因DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质。方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Hogl基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析。结果:白念珠菌Hogl基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前654~704bp,转录起始位点为编码区起始位点前663bp,Hogl基因并无内含子。Hogl基因mRNA中未发现核糖体结合位点等功能性RNA序列,RNA二级结构分析显示,HoglmRNA形成稳定的回文结构。蛋白质的理化性质分析显示,Hogl蛋白稳定系数为35.67。TargetP1.1和SignalP4.1预测结果显示,Hogl基因不存在线粒体定位序列、分泌信号肽及跨膜区域。Motif分析显示Hogl具有MAPK活性,其活性位点可能为第189—181个氨基酸(TRY)。Hogl蛋白序列在各物种间呈渐进式进化、较为保守,尤其在MAPK功能域附近。结论:白念珠菌Hogl基因的DNA和mRNA序列无常见功能域,可能主通过其蛋白质发挥作用。Hogl蛋白是MAPK家族成员,其MAPK活性位点(第189—181个氨基酸TRY)或为潜在的药物靶点。 梅碧琪 张静 乐秀 高文超 黄丽林 何泰龙 孙瑶 陈垦 黄怀球关键词:白念珠菌 生物信息 SF-36中文版健康状况调查表评价鼻咽癌疗后长期存活者适用性研究 被引量:16 2010年 下载PDF阅读器目的 评价美国SF-36中文版健康状况调查表用于鼻咽癌疗后长期存活者的适用性.方法 85例鼻咽癌疗后长期存活者通过电话或信访方式完成评价,相关分析、信度分析和因子分析等统计方法用于评价SF-36中文版的信度和效度.结果 分半信度为0.92,各领域克朗巴赫系数α均〉0.7,说明信度较好且各领域间有较好区分度.每个条目跟相关领域的相关系数都达到或接近0.5,并且各条目与所属领域相关系数均高于该条目与其他领域的相关系数,说明量表有较好的内容效度和区分效度.量表共提取6个主成分,基本反映了量表8个领域,累计方差贡献率为71.4%.8个领域提取2个公共因子,解释73.3%变异.SF-36中文版判别效度较好,能区分鼻咽癌患者和正常人群的生存质量.结论 SF-36中文版易于完成,具有较好的信度和效度,可应用于鼻咽癌疗后长期存活者生存质量的评价. 伍勇 胡伟汉 刘国龙 刘四红 高文超 谭嘉琦 陈耀铭 蔡修宇 王芳 葛楠 毛平申克孢子丝菌SPDS基因的生物信息学分析及分子克隆 被引量:1 2013年 [目的]分析预测申克孢子丝菌cDNA中编号为Locus_ 168_Contig_1序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征,并进行分子克隆.[方法]利用NCBI及Expasy网站提供的BLASTx、SignalIP、InterPro Scan等生物信息学软件分析其序列,判断其是否为全长编码序列、同源序列名称,并分析其结构、定位及功能等;将其中的全长编码区利用PCR方法进行扩增后克隆到pET-30a(+)载体,测序验证.[结果]该序列是亚精胺合成酶(SPDS)的同源基因,全长序列为1062 bp,包含完整的编码区190 ~1 062 bp,编码291个氨基酸,在GenBank中,其与粗糙脉孢菌的SPDS基因同源性最高,达88%.理化性质预测其编码蛋白疏水性高;无质体、线粒体等定位序列,不存在跨膜螺旋结构,为非分泌型蛋白.进化树分析结果显示与粗糙脉孢菌同源性最高;PCR扩增及测序结果证实目的基因成功克隆进入pET-30a(+)质粒.[结论]获得申克孢子丝菌SPDS的基因及蛋白结构、功能特点,构建了其重组表达质粒,将为进一步明确其在孢子丝菌病中的致病作用奠定理论基础. 袁立燕 黄怀球 张静 冯佩英 高文超 李玉哲 张晓辉 黄丽林关键词:申克孢子丝菌 生物信息学 分子克隆 抗癌新药NSC319726对卵巢癌基因表达影响的研究 目的研究抗癌新药NSC319726对卵巢癌基因表达的影响。方法下载GEO数据库中,NSC319726对卵巢癌细胞系TOV112D影响的数据,进行生物信息学分析。结果 NSC319726上调卵巢癌细胞246个基因、下调19... 邓燕红 乐秀 高文超关键词:卵巢癌 生物信息学分析 胰岛素促进胰腺癌细胞SW1990吸收钠离子机制的研究 被引量:1 2013年 目的为解释新发糖尿病合并胰腺癌预后差的现象,本研究拟探讨胰岛素影响胰腺癌细胞钠代谢的分子机制。方法在高糖DMEM中培养胰腺癌细胞SW1990,用不同浓度胰岛素刺激细胞,在不同时间检测培养上清中Na+浓度,分析Na+随胰岛素浓度和时间变化的规律。同时检测胰岛素对血清和糖皮质激素诱导的蛋白激酶1(SGK1)的影响,并分析其中的信号通路。结果胰岛素刺激SW1990细胞后,培养上清中Na+浓度下降(P<0.05),SGK1蛋白表达量增加(P<0.05),且Na+浓度的下降幅度与SGK1蛋白水平相关(r=0.715,P<0.01);胰岛素处理后乙酰化修饰关键基因CREBBP和EP300表达明显上调(P<0.05)。结论胰岛素可促进胰腺癌细胞吸收钠离子,与SGK1基因的表达水平相关,其中乙酰化修饰可能发挥一定作用。 宋亚东 高文超 陈汝福 何贤英 周泉波 林青 周雨 曾兵 余敏 李志花关键词:胰岛素 胰腺癌 钠离子 SGK1 乙酰化 申克孢子丝菌4Hppd基因结构功能的生物信息学分析 2020年 目的:初步预测及分析申克孢子丝菌(Sporothrix schenckii,Ss.)对羟苯基丙酮酸双加氧酶基因(4Hppd)编码蛋白的结构和生物学功能特征。方法:应用生物信息学在线工具预测分析Ss.4Hppd编码蛋白的理化性质及功能特征。结果:Ss.4Hppd基因编码蛋白含对羟苯基丙酮酸双加氧酶保守域,由477个氨基酸构成,理论分子量为52.0 kD,等电点为5.98,半衰期较长,该蛋白为非分泌蛋白,定位于线粒体中。其二级结构以无规则卷曲及α-螺旋为主,另外还存在乙二醛酶功能域及丰富的磷酸化位点,与其他致病真菌同源蛋白有较高的相似度。结论:预测Ss.4HppD位于线粒体中,具有乙二醛酶功能域结构功能特点及丰富修饰位点,可为其表达、晶体结构分析及小分子抑制剂开发提供参考。 吴晓雁 张静 黄家敏 孙瑶 黄晓雯 高文超 吴榕 陈三妹 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 生物信息学分析 生存质量对鼻咽癌长期生存者预后的影响 被引量:2 2010年 目的 分析生存质量对鼻咽癌长期生存者预后的影响.方法 1999年至2000年接受治疗并于2003年7月前无瘤生存的192例鼻咽癌患者纳入研究.患者于2003年7至8月接受生存质量测定.测定量表包括健康状况调查量表(SF-36)(中文版)和包含14个症状的自觉症状评价量表.随访时间2.67~9.55年,中位随访7.95年.分析生存质量以及社会人口学和临床因素对预后的影响.结果 单因素分析表明,生存质量对无瘤生存和总生存有影响.多因素分析表明,记忆力下降是无瘤生存的独立预后因素,张口困难、头痛和年龄是总生存的独立预后因素,生存质量越好、年龄越小者预后越佳,而其他社会人口学和临床因素未发现预后价值.结论 生存质量是影响鼻咽癌长期生存者预后的重要因素,随访时应常规评价患者的生存质量. 伍勇 胡伟汉 刘国龙 刘四红 林焕新 毛平 高文超 谭嘉琦 陈耀铭 蔡修宇 王芳 葛楠关键词:鼻咽肿瘤 预后