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王梦筠

作品数：2 被引量：2H指数：1
供职机构：复旦大学更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇医药卫生

主题

  • 2篇易感
  • 2篇易感性
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇单核苷酸多态...
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇研究进展及展...
  • 1篇遗传易感
  • 1篇遗传易感性
  • 1篇直肠
  • 1篇直肠癌
  • 1篇全基因
  • 1篇全基因组
  • 1篇全基因组关联...
  • 1篇胃癌
  • 1篇结直肠
  • 1篇结直肠癌
  • 1篇基因

机构

  • 2篇复旦大学

作者

  • 2篇王梦筠
  • 1篇蔡三军
  • 1篇魏庆义

传媒

  • 1篇现代肿瘤医学
  • 1篇中国癌症防治...

年份

  • 1篇2024
  • 1篇2019
共 2 条 记 录，以下是 1-2
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排序方式：
华东地区早发胃癌特异性分子标志物的多组学整合分析
2024年
目的:寻找早发胃癌特异性标志基因,并探究标志基因遗传变异与华东地区早发胃癌发病风险的关联。方法:研究利用多个胃癌组学研究中东亚人群数据,从拷贝数变异(copy number aberrations,CNAs)和转录组差异表达(differentially expressed genes,DEGs)两个水平整合分析早发胃癌特异的候选基因。通过单因素和多因素Logistic回归评估候选基因表达与早发胃癌的关联,通过亚组分析评估不同亚型之间的关联强度。通过逐步回归筛选早发胃癌标志基因,以构建预测模型。收集华东地区原发性早发胃癌和癌旁组织的临床样本,并使用实时荧光定量PCR验证标志基因的表达差异。另外,使用华东地区1086例原发胃癌和1062例健康对照的全基因组关联芯片数据,通过多因素Logistic回归分别在早发组和晚发组中评估了早发胃癌标志基因区间及其上下游20 kb的单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与胃癌发病风险的关联,通过假阳性报告概率(false positive report probability,FPRP)检验筛选出显著关联的位点,并利用基因表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTL)分析SNPs对基因表达的顺势调控情况。结果:多组学数据整合CNAs和DEGs分析发现6个早发胃癌特异性的候选基因,其中BUD31、POLI和SETBP1的表达水平与胃癌早发相关。分层分析显示,这些关联在Ⅲ/Ⅳ期胃癌和印戒细胞癌中更显著。进一步的逐步回归分析表明,将POLI和SETBP1纳入预测模型显著优于仅纳入胃癌常见突变CDH1的模型(曲线下面积area under curve,AUC_(new)=0.733,AUC_(previous)=0.683,P=0.03)。qRT-PCR结果与前期一致,显示在早发胃癌组织中,POLI和SETBP1表达均显著低于癌旁组织(P_(POLI)=0.049,PSETBP1=0.002)。基因芯片关联研究结果显示,SETBP1 rs7235777 C>A变异与EOGC的风险升高相关(OR_(adj)=1.67,95%CI=1.21~2.13,P_(adj)=0.002,FPRP_(0.1)=0.059),但与晚发胃癌发病风险无�
李竞娆丁诗韵武文汇毛嘉宁郑吉王梦筠张若昕
关键词：遗传易感性
结直肠癌全基因组关联分析研究进展及展望被引量：2
2019年
2018年全球有超过180万人罹患结直肠癌,严重影响人类健康。目前认为,结直肠癌的发生发展是遗传因素和环境因素共同作用的结果。其遗传因素目前尚不明确,已发表的全基因组关联分析研究(genome-wide association study,GWAS)已经发现了数十个遗传易感位点和区域。本文将对既往结直肠癌GWAS研究进行综述,讨论GWAS研究的优缺点,探讨GWAS的发展前景。
屈晓飞王梦筠蔡三军魏庆义
关键词：结直肠癌全基因组关联分析单核苷酸多态性易感性
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