杨前勇
- 作品数：6 被引量：2H指数：1
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- 中国地方犬基因组遗传多样性及其选择信号分析
- 家犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征。近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗...
- 杨前勇
- 关键词：SNP进化关系拷贝数变异候选基因
- 犬血管性假血友病研究进展
- 血管性假血友病(vWD)是一种遗传性的出血障碍,在人和犬中比较常见。vWD的一个共性就是血管性假血友病因子(vWF)的数量或质量的异常,这就表现为血小板功能异常和出血时间延长。vWF是一种大分子量的多聚体糖蛋白,当机体受...
- 叶俊华杨前勇张国生舒邓群
- 关键词：致病机制血小板
- 文献传递
- 中国地方犬基因组遗传多样性及其选择信号分析的概要
- 2018年
- 家犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征。近年来,越来越多的研究人员利用高密度SNP芯片和全基因组重测序技术,开展了西方犬种的起源、进化、遗传多样性以及影响表型相关的基因研究,并取得了重要进展,但还未见中国地方犬的遗传多样性、群体结构、进化关系、基因组结构变异和选择信号等研究。
- 杨前勇
- 关键词：候选基因基因组信号分析CNV
- 利用犬170 K高密度SNP芯片检测16个中国地方犬种全基因组拷贝数变异被引量：1
- 2017年
- 旨在解析中国地方犬全基因组拷贝数变异(CNV)分布情况,为分析CNV对犬表型变异的影响提供前期基础。本研究采集了16个来自中国不同地方犬品种和9头罗威纳犬共计185头犬的血液样品,使用血液DNA提取试剂盒提取DNA,利用犬170KSNP芯片和PennCNV软件对中国地方犬进行全基因组范围内的CNV分析。参照Illumina芯片标准操作流程进行芯片扫描和基因分型。将质控后的SNP参考PennCNV软件使用说明书,设定分析参数进行CNV检测分析。从分析结果中随机挑选8个CNV区间(CNVRs)使用实时定量PCR进行验证。利用BioMart以及DAVID软件进行基因和功能注释分析。结果表明,在185个个体中共发现了477个CNV,这些CNV随机分布在38条常染色体上,合并后可以得到220个CNVR,总长度约占犬整个基因组序列的1.25%,平均长度为142.24kb。在220个CNVR中,115个为缺失,74个为重复,31个为缺失/重复CNVR。此外,笔者发现53个CNVR为潜在的中国地方犬品种特异性CNVR。在基因和功能注释中,本研究共发现162个基因位于所检测到的CNVR内,这些基因主要富集的功能类别是嗅觉受体活动,嗅觉的感知,对化学刺激物的感知,感官知觉和神经系统过程。这些结果解析了中国地方犬基因组结构变异分布情况,将有助于进一步研究CNV与犬表型变异的关联性。
- 刘晨龙杨前勇陈浩黄晓畅陈从英
- 关键词：拷贝数变异基因组
- 地方品种遗传多样性和群体结构的分析与统计方法被引量：1
- 2017年
- 遗传多样性是生物多样性的核心,开展遗传多样性调查和群体结构的分析是开发利用本土动物群体的基础,本文根据最新的统计方法,列举了遗传多样性调查的遗传参数,详细阐述了群体遗传结构的分析方法的优缺点,群体分化指数的统计和选择信号扫荡,为我国动物地方品种的群体遗传多样性分析和功能基因定位提供了方法支持。
- 杨前勇
- 关键词：系统发生树
- 犬基因组结构和多态性研究进展
- 2019年
- 家犬是最早被驯化的家养动物,通过选择进化和培育,世界上注册的已有超过400多个犬品种,每个品种都具有独特的生理、行为和形态特征。利用高密度芯片技术进行犬全基因组多态性分析,并通过基因组多态信息扫描定位功能基因成为热点,总结和综述了犬基因组结构变异和多态信息的研究进展,为开展家犬基因组学研究提供新的方法和思路。
- 杨前勇
- 关键词：基因芯片起源进化
