孙忠民
- 作品数：20 被引量：30H指数：3
- 供职机构：中国科学院海洋研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金NSFC-广东联合基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学环境科学与工程轻工技术与工程更多>>
- 一种浒苔种群的线粒体分子标记引物及其应用
- 本发明属于藻类分子标记技术领域，具体涉及一种浒苔种群的线粒体分子标记引物及其应用。线粒体分子标记引物，所述引物在鉴别浒苔种群的高分辨率线粒体分子标记(rps2‑trnL基因间隔区序列)中的应用。本发明方法可检测藻体样品，...
- 高大海孙忠民黄超华
- 文献传递
- 一种鉴定浒苔近缘种的引物对、DNA条形码及其应用和检测方法
- 本发明属于藻类分子标记技术领域，具体涉及一种鉴定浒苔近缘种DNA条形码的引物对、DNA条形码及其应用和检测方法。鉴定浒苔近缘种的引物对，上游引物序列：5’GCTGACATACCATCACGATAGT 3’(SEQ ID ...
- 高大海孙忠民姚建亭
- 文献传递
- 中国近海外来囊藻(Colpomenia peregrina)种群遗传多样性研究被引量：3
- 2020年
- 外来囊藻(Colpomeniaperegrina)是一种在潮间带分布广泛的褐藻,它能附着在牡蛎壳上进行跨海区扩散,因而是研究生物多样性变动和生物地理格局形成的良好模型。外来囊藻在中国沿海虽有分布,但关于其种群遗传多样性和分化研究的报道尚为空白。本研究采集了中国近海13个外来囊藻种群样本。通过扩增301条线粒体cox3序列,发现了26个单倍型;通过重建单倍型网络图和基于最大似然法与贝叶斯法重建系统进化树,发现外来囊藻种内遗传多样性较高, 13个种群划分为3个遗传世系,其中浙江南麂列岛的7个种群组成遗传世系A,辽宁和山东的样本则分化为遗传世系B和C。中国近海外来囊藻的这种种群遗传结构可能源于更新世末次盛冰期黄渤海、东海边缘海的环境变化和海平面的大幅下降。遗传世系A具有的较高单倍型多样性,其原因可能是南麂列岛独特的地理位置和潮间带环境的共同作用。
- 宋小含孙忠民胡自民段德麟
- 三种海氏藻(Haslea)的形态学与分子系统学研究
- 海氏藻(Haslea)隶属于硅藻纲(Bacillariophyceae)、舟形藻目(Naviculales)、舟形藻科(Naviculaceae)，是潮间带常见的底栖硅藻，也是唯一具有蓝色色素的硅藻类群。
- 李宇航陈旭淼孙忠民徐奎栋
- 关键词：舟形藻底栖硅藻分类学
- 一种鉴定浒苔近缘种的引物对、DNA条形码及其应用和检测方法
- 本发明属于藻类分子标记技术领域，具体涉及一种鉴定浒苔近缘种DNA条形码的引物对、DNA条形码及其应用和检测方法。鉴定浒苔近缘种的引物对，上游引物序列：5’GCTGACATACCATCACGATAGT 3’(SEQ ID ...
- 高大海孙忠民姚建亭
- 铜藻的分类地位、生物地理分布以及2016年底黄海漂浮铜藻源头的初步分析被引量：10
- 2018年
- 通过对我国沿海多次野外实地考察以及文献报道,对铜藻进行了分类地位及生物地理分布特征介绍。结合分子数据,目前由过去单一的狭义铜藻Sargassum horneri和线形马尾藻Sargassumfilicinum结合而成广义铜藻。其生物地理分布区系由西北太平洋扩大到东北太平洋的有限区域。根据我国沿海铜藻底栖和漂浮种群的发生季节变化,初步判断我国可能存在2个以上的底栖铜藻种群:春季成熟型、夏季成熟型和/或秋季成熟型。结合铜藻的自然生境、底栖分布区系以及海流等水文资料,本文对2016年底黄海漂浮铜藻种群的源头进行了初步分析,其最可能地域源头为渤海海峡区及其邻近水域,最可能的种群来源为夏季成熟型。
- 黄冰心丁兰平秦松付晚涛陆勤勤刘正一庞云龙李晓丽孙忠民
- 关键词：区系种群
- 利用叶绿体基因组大单拷贝区的单核苷酸多态位点鉴定紫薇属和马尾藻属植物被引量：8
- 2022年
- 由于植物的种间和属间存在或多或少的形态相似性,用于植物分类的有价值的形态性状数量有限。DNA短片段提供的信息量少,只能区分有限数量的植物种。精确鉴定和数字化管理全球植物,仍然是极其具有挑战性的难题。本文报道,在一个核苷酸分子水平上精确鉴定紫薇属植物的新方法。叶绿体基因组的大单拷贝区的单核苷酸多态位点,作为关键的分子性状用于编制分子分类检索表。为了达到简化和精确鉴定的目的,回避使用如下3类基因组DNA区域的分子性状,即gap区域、poly结构区域及简单重复序列区域。本研究对于紫薇属植物的分类修订、数字化管理、保护和利用具有重要价值。海洋植物大型藻类马尾藻科马尾藻属的9个种/变种也可以用同样的方法成功鉴定,表明我们的方法不仅适用于高等植物的鉴定,也适用于低等植物藻类。
- 索志立顾翠花左云娟杨志荣孙忠民杨强发靳晓白
- 关键词：紫薇属马尾藻属叶绿体基因组
- 褐藻匍扇藻属的分类学研究
- 褐藻网地藻目网地藻科匍扇藻属(Lobophora J.Agardh)藻类广泛分布于热带和亚热带海域,是珊瑚礁生态系统的重要组成部分,Algaebase (http：//algaebase.org/)中有5种记录.然而,该...
- 孙忠民
- 中国沿海浒苔类的多样性及分子系统学研究
- 浒苔类是中国沿海常见的绿藻类群之一，属于石莼目(Ulvales)石莼科(Ulvaceae)石莼属(Ulva)。该类群的大部分种类具有药用和食用的经济价值，另一方面，某些种类的爆发性增殖所引发的“绿潮”，成为广泛关注的海洋...
- 高大海孙忠民
- 关键词：多样性分子系统学近缘种分子标记
- 黄海铜藻形态特征和遗传多样性研究
- 2023年
- 为研究黄海漂浮铜藻的来源以及藻体特征,在北黄海、南黄海和青岛近岸采集漂浮铜藻,并对长岛海域定生铜藻开展调查研究。结果表明,漂浮和定生铜藻的植株形态呈现不同的季节性变化,11月两者的叶片和气囊形态差别不大,4-6月形态分化明显,表现为定生铜藻的叶片和气囊继续生长,而漂浮铜藻呈衰败趋势;漂浮铜藻的生殖托数量远低于定生铜藻,且较细短。同时,本文利用核基因(ITS2)和线粒体基因片段(cox3、rnl-atp9、rpl5-rps3和cob-cox2)研究铜藻样本的遗传多样性,结果显示,ITS2序列共发现2个多态性位点、5种基因型,线粒体基因片段共发现9个多态性位点、5个单倍型;不同地理群体间以及漂浮和定生群体间的遗传距离与群体内遗传距离差异不显著,表明该海域漂浮和定生铜藻可能来自相同的遗传群体。
- 刘永娟袁超屈佩肖洁孙忠民张学雷
- 关键词：单倍型
