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基因进化的同义与非同义替代计算及统计检验的比较分析被引量：24: 2006年; 基因氨基酸编码区的核苷酸具有不同替代速率.同义替代不引起氨基酸改变,它们基本是中性替代速率;非同义替代引起氨基酸变化,替代速率常常比同义替代速率低.非同义(或同义)替代速率定义为单位时间(如1年)内或者一个世代内1个非同义(或同义)位点上发生替代的数目,用符号dN(或dS)来表示.生物体内发生的非同义突变大多数属于有害突变,只有少数是中性突变或有利突变.对有害的非同义突变来说,dN-dS<1;而对于有利的非同义突变来说,dN-dS>1.仅仅通过比较dN和dS还不能确定是否就一定受到选择作用,还必须用统计学的方法来检验它们的真实性和可靠性.计算dN和dS的方法有多种,常见的是4种:N-G模型、改进的N-G模型、Li-Wu-Luo模型和P-B-Li模型.4种方法从不同的角度计算编码区核苷酸的dN,dS值,它们各有特点,适合不同基因的计算.对dN,dS值进行统计检验的方法也有多种,常见的方法有5种:Z检验、Tajima’s D检验F、u and Li检验、HKA检验和MK检验.这5种检验方法也各有特点,适合不同基因dN,dS值的检验.; 李易; 关键词：核苷酸

精神分裂症易感基因GULP1与中国人群大脑容量的相关性研究: 2009年; 精神分裂症是一种复杂的精神疾病,全世界约有1%的人患有这种疾病。以往的研究发现精神分裂症患者的脑容量比正常人小,且一些精神分裂症易感的DNA序列多态性也同时与脑的结构异常有关,这与精神分裂症的神经发育假说是吻合的。最近研究发现人的GULP1基因的两个SNP(rs2004888和rs4522565)与精神分裂症显著相关。为了研究这两个精神分裂症易感的SNP是否也符合神经发育假说,我们检测了791个正常人的这两个SNP的基因型并测量它们的脑容量,相关性分析发现这两个SNP和脑容量无关,说明GULP1的精神分裂症易感性存在更加复杂的机制。; 施晓东王金凯李易罗雄剑张卫宿兵; 关键词：精神分裂症脑容量 SNP

化学专业生物辅修课程内容改革的尝试: 2001年; 　　自80年代末期开始,我省师范高等专科学校化学专业普遍开设了生物辅修课程.其原因是师专化学专业学生多数在乡镇一级中学任教,他们通常需兼教中学生物课程.长期以来,开设的生物辅修课一直是<植物学>、<动物学>和<人体解剖生理学>三门课程.所用教材也一直取自大学生物专业的相关教材.……; 李易

蛋白质分子进化过程中氨基酸替代数估计和距离测度的统计方法被引量：1: 2005年; 氨基酸替代数的估计是测定蛋白质分子间进化距离的基本统计方法,是研究蛋白质分子进化的基础.估计氨基酸替代数和测定两个氨基酸序列间进化距离的统计方法分别是p距离、PC距离和Г距离的计算模型.同时,本文还对各个模型的特点作了比较.; 李易王云波; 关键词：分子进化进化距离

恒河猴大脑前额叶cDNA文库的构建被引量：2: 2006年; 为筛选出与认知、记忆相关的脑部表达基因及基因家族,利用TRIzol试剂从恒河猴大脑前额叶组织抽提总RNA,再用纯化试剂盒从总RNA中成功纯化出mRNA。按照Stratagene公司的cDNASynthesisKit(200401)、ZAP-cDNASynthesisKit(200400)和ZAP-cDNAGigapackⅢGoldCloningKit(200450)三个试剂盒的操作说明,构建了恒河猴大脑前额叶组织的cDNA文库。文库总库容为2·0×106克隆;绝大多数的cDNA插入片段≥0·5kb,平均长度≈1·0kb;cDNA片段与噬菌体载体重组率为97·3%。文库各项指标均达要求,为克隆大脑PFC区表达基因、测定基因编码区序列、揭示具有多种剪切组合模式等提供了可靠资源,也为相关基因表达调控的研究提供了方便。; 李易黄薇张新宿兵; 关键词：恒河猴 CDNA文库

云南僰人源流的父系和母系遗传研究被引量：3: 2006年; 对云南人32份男性DNA样本进行Y染色体单倍型以及mitochondrialDNA(mtDNA)单倍型分析,结果发现云南人的父系和母系遗传组分都表现出典型的南方人群的遗传特征。由人的数据结合已经发表的东亚人群的Y染色体和mtDNA单倍型(haplotype)数据进行MultidimensionalScaling(MDS)分析,结果表明,在MDS分布图中人群体的Y染色体单倍型和mtDNA单倍型都与南方人群聚在一起。这一结果支持人的遗传族源为东亚南方人群后裔,与考古学的推论相一致。结合历史和考古学证据来探讨人的起源和史前迁移,为揭开“人悬棺”这种独特的考古文化的起源和史前传播提供遗传学的研究证据。; 石宏李易罗虹吉学平宿兵; 关键词：僰人悬棺葬 Y染色体 MTDNA

基因进化过程中核苷酸替代模型的比较分析被引量：3: 2006年; DNA序列中核苷酸替代数的估计是测定基因间进化距离的数学统计方法,是研究基因进化的基础.由于DNA分子包含多种序列区域等原因,核苷酸序列的替代模式比较复杂.最基本的核苷酸序列替代模型是p-距离模型J、ukes-Cantor模型、Kimura两参数模型.在此基础上衍生出其它一系列模型,如Tajima-Nei模型、Tamura模型、Tamura-Nei模型等.这些数学模型在拟合DNA序列进化的真实度时各有特点.这些模型中都假定各个位点的核苷酸替代速率一致,但实际情况并非完全如此,而是核苷酸的替代速率近似地遵循Г分布.; 李易王云波; 关键词：基因进化进化距离

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李易