陈连福
- 作品数：6 被引量：15H指数：1
- 供职机构：华中农业大学植物科学技术学院应用真菌研究所更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金湖北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 香菇基因组De novo测序与分析揭示了其独特的降解木质纤维素的能力
- 对香菇单核体菌株W1-26进行了基因组测序和De novo组装,获得了大小为39-Mb的基因组序列。香菇基因组中的重复序列以LTR为主,其总含量达到基因组序列长度的9.88%。12,936个基因模型得到了预测,其中94....
- 陈连福边银丙龚钰华肖扬周雁
- 关键词：基因组测序香菇基因预测功能注释
- 文献传递
- 基于生物信息学的食用菌种质资源评价与创新
- 食用菌产业链的上游在于优良品种的选育。尤其随着工厂化技术和规模在食用菌产业中的不断进步和扩大,对适宜于工厂化生产菌株的选育也需要加大重视和加快进度。当前以基因组学为基础的生物信息学发展速度越来越快,各食用菌相关的多组学数...
- 陈连福边银丙
- 关键词：食用菌种质资源生物信息学生物学性状
- SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征被引量：15
- 2014年
- 以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小。在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多。对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位。
- 周雁范秀芝陈连福边银丙
- 关键词：黑木耳毛木耳转录组简单重复序列基序
- 基于核糖体DNA和gpd基因片段的木耳属系统发育分析
- 利用ITS、18S rDNA和28S rDNA及gpd基因片段对木耳属(Auricularia)34个菌株进行分子系统发育分析，结果显示木耳属为单起源属.在4个基因片段联合构建的系统发育树中，黑木耳和皱木耳菌株分别单独聚...
- 范秀芝李黎陈连福肖扬边银丙
- 关键词：木耳属RDNARDNA内含子
- 多组学揭示香菇木质纤维素酶基因表达调控机制
- 香菇(Lentinula edodes)作为一种典型的白腐真菌,主要通过分泌到胞外的木质纤维素酶,以水解酶机制和氧化酶机制降解纤维素。香菇'武香1号'单孢菌株W1-26 De novo基因组测序和组装首先获得完成,得到了...
- 龚钰华陈连福蔡英丽王刚正胡悦李军平边银丙
- 关键词：香菇基因组蛋白质组转录组
- 文献传递
- 香菇基因组分析与受纤维素诱导相关基因研究
- 对香菇单核菌株W1-26使用Illumina Hiseq 2000测序平台进行了基因组测序。使用ALLPATHS-LG等软件进行了基因组组装,得到340条scaffolds序列,其总长度为41.8 Mb,Scaffold...
- 陈连福龚钰华蔡英丽边银丙
- 关键词：基因组转录组香菇ILLUMINA分子钟
- 文献传递
