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许莹修

作品数：4 被引量：2H指数：1
供职机构：江苏省农业科学院更多>>
发文基金：江苏省农业科技自主创新基金更多>>
相关领域：农业科学更多>>

合作作者

文献类型

  • 2篇专利
  • 1篇期刊文章
  • 1篇会议论文

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 3篇基因
  • 3篇基因组
  • 3篇基因组序列
  • 2篇信息构建
  • 2篇生物基因
  • 2篇生物基因组
  • 2篇串联重复序列
  • 1篇逆转座
  • 1篇逆转座子
  • 1篇全基因
  • 1篇全基因组
  • 1篇全基因组序列
  • 1篇染色
  • 1篇染色体
  • 1篇转座
  • 1篇转座子
  • 1篇马铃薯
  • 1篇枚举法
  • 1篇进化分析
  • 1篇PURIFY...

机构

  • 4篇江苏省农业科...

作者

  • 4篇许莹修
  • 4篇杜建厂

传媒

  • 1篇基因组学与应...
  • 1篇第六届全国生...

年份

  • 1篇2016
  • 2篇2014
  • 1篇2013
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
生物基因组串联重复序列的整体评估和挖掘方法
本发明提供了一种生物基因组串联重复序列的整体评估和挖掘方法，包括以下步骤：利用枚举法的计算机程序构建重复序列的核心序列库，作为重复序列扫描的基础；用核心序列库在整个基因组进行串联重复序列信息扫描，确定核心序列产生的串联重...
许莹修杜建厂
文献传递
马铃薯(Solanum tuberosum L.)全基因组水平上LTR-逆转座子的鉴定与进化分析被引量：2
2013年
LTR-逆转座子是构成基因组特别是植物基因组的重要组分。它们在寄主基因组的进化过程中起到重要作用。马铃薯是重要的经济作物和粮食作物,其全基因组序列的公布为进一步研究其遗传组成和演化提供了基础。本文以马铃薯全基因组序列为材料,用结构分析和同源比对的方法分离得到9 318个完整的LTR-逆转座子,7 281个非完整(truncated)LTR-逆转座子元件和3 657个solo LTR元件。进一步研究表明,gypsy类转座子在距今两百万年(million years ago,MYA)时转座活性被抑制,而copia类元件活跃至今。马铃薯和番茄比较基因组学的研究表明,LTR-逆转座子序列变异率为18.73%,远高于基因序列的7.37%和CDS序列的5.01%。
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关键词：基因组序列马铃薯
Young but not Relatively Old Retrotransposons Are Preferentially Located in Gene-rich Euchromatic Regions in Tomato Plants
Background: LTR-retrotransposons (LTR-RTs) are the major DNA components of flowering plants.They are generally...
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关键词：SPECIFICITYPURIFYINGRETROTRANSPOSONTOMATO
生物基因组串联重复序列的整体评估和挖掘方法
本发明提供了一种生物基因组串联重复序列的整体评估和挖掘方法，包括以下步骤：利用枚举法的计算机程序构建重复序列的核心序列库，作为重复序列扫描的基础；用核心序列库在整个基因组进行串联重复序列信息扫描，确定核心序列产生的串联重...
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