曹以诚
- 作品数：64 被引量：153H指数：5
- 供职机构：华南理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技基础条件平台建设计划广州市科技攻关项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术化学工程更多>>
- 基于环介导等温扩增技术的EB病毒基因快速诊断试剂盒
- 基于环介导等温扩增技术的EB病毒基因快速诊断试剂盒，涉及生物检测试剂领域。它是由一套引物、DNA聚合酶、反应液、裂解液(1)和裂解液(2)、显色液、阳性对照液组成，所说的一套引物是由二对引物组成，其序列为：外引物1：GC...
- 聂国辉肖德明王大平付林徐小平陈洵杜正平李心晖石磊曹以诚
- 文献传递
- 黄曲霉毒素B1致癌毒性相关基因的生物信息学分析被引量：11
- 2013年
- 黄曲霉毒素是广泛存在于食品中的对人类危害最大的、最常见的霉菌毒素,其中黄曲霉毒素B1是致癌毒性最强的一种。为了筛选与黄曲霉毒素B1致癌作用密切相关的基因,利用生物信息学技术对从GEO数据库中下载的三组相关的人基因组芯片实验数据集作系统的聚类分析,并对候选基因进行初步的数据库检索。首先选取数据集中表达比值相差2倍以上的基因做聚类分析,然后对聚集结果中表达趋势最为接近的差异基因作生物信息学数据库的检索,最后发现KRT15、PCNA、MMP1等多条基因与黄曲霉毒素B1关系紧密。通过对三组基因组芯片数据的生物信息学分析,找出了多条可能是黄曲霉毒素B1致癌毒性相关的关键基因,为进一步研究黄曲霉毒素诱导癌症发生、发展的具体机理提供了新的思路。
- 李力曹以诚区镜深毛小帆
- 关键词：黄曲霉毒素致癌物基因表达谱
- 纤维素酶分子人工进化的生物信息学研究
- 纤维素酶在食品、医药、轻纺工业中已被广泛应用,更是生物能源战略目标中将生物质材转化为可供酒精发酵用糖的关键环节。结合生物信息学分子设计和分子生物学开发的纤维素人工分子进化,势在必行。目前已知的314个纤维素酶信息的专用关...
- 曹以诚杜正平潘敏尧王艳宣董守斌
- 关键词：纤维素酶生物信息学蛋白质工程
- 文献传递
- 共表达siRNA和hIL-12的新型乙肝多表位DNA疫苗的研究被引量：3
- 2008年
- 目的:构建含有靶向乙肝表面抗原(HBsAg)基因的siRNA、乙肝复合多表位抗原基因和hIL-12共质粒表达的新型DNA疫苗,并在HepG2细胞中检测siRNA的效果以及各基因的表达。方法:设计并合成复合多表位HBV抗原基因,将其与增强型绿色荧光蛋白(EGFP)基因融合克隆进真核表达载体pVAX1的多克隆位点中,同时将带CMV启动子的完整hIL-12表达单元克隆进载体的BspHI位点之间,再设计并合成乙肝siRNA表达单元,将其克隆进载体的MluI位点之间,得到真核三元共表达重组质粒pVAX1-siHB-HB-EGFP-hIL12。以该重组质粒瞬时转染人肝癌细胞系HepG2,通过EGFP的荧光标记观察多表位抗原的表达,以ELISA测定培养细胞上清中hIL-12的表达,以rtPCR检测siRNA对HBsAg基因的沉默效果。结果:经酶切鉴定和测序证实共表达siRNA、hIL-12的HBV多表位DNA疫苗构建成功。转染细胞中检测到绿色荧光,证实抗原表达;转染后48hhIL-12的检出量为1289pg/ml细胞上清,72h检出量为1712pg/ml细胞上清;转染后HBsAg表达量明显降低,证实siRNA效果良好。结论:成功构建乙肝复合多表位抗原基因与siRNA、hIL-12共质粒表达的DNA疫苗,并能在真核细胞中有效表达抗原与hIL-12基因,而且siRNA对HBsAg显示出明显的沉默效果,为进一步研究该复合型DNA疫苗抗HBV的治疗效果打下基础。
- 黄镜贤曹以诚杜正平陶嫦立杨化强
- 关键词：乙型肝炎DNA疫苗多表位抗原SIRNA
- Humicola insolens EGV的同源分析及分子改造设计
- 纤维素酶的研究过去主要集中在菌种选育和酶的定向进化，随着大量纤维素酶的基因被克隆和三维结构的测定使得纤维素酶的分子理性改造变为现实。EGV是家族45的一个中性酶，在纺织工业中有广泛的利用，过去已经对它的耐碱性，蛋白酶敏感...
- 陈晓曦曹以诚杜正平曾炳佳
- 关键词：纤维素酶同源分析分子改造生物信息学分子模拟
- 文献传递
- 水稻光周期敏感性的遗传和幼穗分化前后同工酶的变化
- 曹以诚
- 关键词：水稻光周期敏感幼穗分化同工酶
- 环介导等温扩增快速检测EBV DNA对鼻咽癌诊断的意义被引量：1
- 2008年
- 目的:建立环介导等温扩增技术快速检测EB病毒的方法,为鼻咽癌的早期诊断提供辅助手段。方法:利用煮沸法快速提取样品中病毒DNA,使用环介导等温扩增技术检测EB病毒特异基因片段,在等温条件下于1 h内完成检测过程。结果:环介导等温扩增技术在对33份临床标本的检测中显示了较高的特异性,较现有的PCR技术更加简便快速,能在等温条件下进行,不需复杂的仪器设备,检测成本大大降低。结论:本研究为鼻咽癌临床检测提供了一个快速简便的新辅助方法。
- 聂国辉董洪松何贵华徐小平石磊曹以诚陈洵
- 关键词：鼻咽肿瘤环介导等温扩增EB病毒
- 结合RNAi技术的三重表达HCV DNA疫苗的构建及其在HepG2细胞中的表达被引量：1
- 2008年
- 目的:构建多表位抗原基因、hIL-12、小分子干扰RNA(siRNA)共质粒表达的新型复合丙型肝炎DNA疫苗并在HepG2细胞中表达。方法:设计并合成复合多表位丙肝抗原基因,将其与加强型绿色荧光蛋白(EGFP)基因融合克隆进真核表达载体pVAX1的多克隆位点中;利用pVAX1载体上卡那霉素抗性基因与复制起始位点之间的非功能区域,将带CMV启动子的hIL-12表达单元克隆进该区域的BspH I位点中;同时将8组针对丙肝的siRNA表达单元分别克隆进载体复制起始位点下游非功能区域的MluI位点上,构建三重表达的HCV DNA疫苗pVAX1-HC-EGFP-hIL12-siRNA。以该重组质粒转染人肝癌细胞系HepG2,通过EGFP的荧光标记观察多表位抗原的表达;以靶向EGFP的siRNA做为对照验证siRNA的表达及其干扰效果;ELISA测定培养细胞上清中hIL-12的表达。结果:经酶切鉴定和测序证实三重表达的复合HCV DNA疫苗构建成功。在转染细胞中检测到绿色荧光,证实抗原表达;靶向EGFP的siRNA亦能显著抑制EGFP的表达;转染后48 h hIL-12的检出量为1 289 ng/L细胞上清,72 h检出量为1 712 ng/L细胞上清。结论:成功地构建多表位抗原基因、hIL-12和siRNA共质粒表达的丙肝DNA疫苗,并能在真核细胞中有效表达抗原基因、hIL-12并介导RNA干扰效应。为进一步研究该DNA疫苗抗HCV的免疫治疗和基因治疗效果打下基础。
- 杨化强曹以诚杜正平卓敏黄镜贤李新建石川张珍武
- 关键词：DNA疫苗多表位抗原SIRNA
- 三类整合酶基因(intⅠ)的简并引物PCR方法建立及应用被引量：20
- 2005年
- 目的 建立一种筛选第一、二和三类整合酶基因 (intⅠ )的简并引物PCR方法 ,并对临床菌株进行整合子筛选和分类。方法 用梯度PCR方法确定PCR反应的最适退火温度 ,并对 1 6株临床标本进行PCR扩增 ,通过对阳性PCR扩增产物的限制性内切酶分析进行整合子分类。结果 根据梯度PCR结果确定最适退火温度为 4 6℃。应用简并引物PCR法检测 1 6株临床分离株 ,其中 8株阳性 ,经酶切分类后确定其中 4株只含有第一类整合酶基因 ,有 3株含有第二类整合酶基因 ,1株同时含有第一类和第二类整合酶基因。结论 建立了一种同时筛选第一、二和三类整合子的方法 ,实际检测显示其可行性 ,为全面细致研究整合子介导的细菌耐药提供了一种快速、简便的方法。
- 李心晖石磊杨维青曹以诚张宏梅尹晓琳郑美萍
- 关键词：PCR方法PCR法检测PCR反应整合子临床菌株
- 靶向TTF-1的siRNA腺相关病毒载体组装验证
- 2012年
- 为了解决靶向TTF-1的siRNA导入肺腺癌细胞的问题,设计了3条靶向NCI-H1975细胞TTF-1基因的siRNA,并将其分别构建到腺相关病毒上.在293细胞中装配病毒,收获病毒原初液后进行超滤浓缩、层析柱纯化,测定病毒滴度.重组病毒感染肺腺癌细胞系NCI-H1975,通过Western-Blot实验检测siRNA效果,利用凋亡实验验证细胞生物学效应.Western-Blot实验测得siRNA有较好的干扰效果,凋亡实验测得肺腺癌细胞NCI-H1975产生了凋亡,从而证明具有感染性的靶向TTF-1的siRNA腺相关病毒载体组装成功.
- 高强曹以诚杨磊
- 关键词：TTF-1腺相关病毒小分子干扰RNA
