何谦 作品数:15 被引量:15 H指数:2 供职机构: 西安交通大学医学院第二附属医院 更多>> 发文基金: 陕西省国际科技合作计划 陕西省自然科学基金 国家杰出青年科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
胆汁酸肝肠循环与胆固醇结石形成关系的研究 胆汁酸由肝细胞通过主动转运分泌入胆汁, 进入小肠后大部分胆汁酸在回肠末端重吸收入血,通过门静脉返回肝脏。经过肝细胞加工转化后,连同新合成的初级胆汁酸一起又分泌入小肠。胆汁酸如此在肠和肝之间往复循环的过程,称为胆汁酸的肠肝... 何谦 张雪梅 王香玲 赵丽华关键词:胆固醇结石 胆汁酸 肝肠循环 基于TCGA数据库构建三阴性乳腺癌预后相关的ceRNA调控网络及分析 被引量:2 2023年 目的通过分析癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库构建三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)预后相关的竞争性内源性核糖核酸(competitive endogenous RNA,ceRNA)调控网络。方法从TCGA数据库中下载TNBC lncRNA表达RNAseq数据,对TNBC患者的mRNA,miRNA和lncRNA进行差异表达分析,并进一步行生存分析,得到与乳腺癌有明显差异表达同时也对生存有相关性的mRNA,miRNA和lncRNA。同时构建lncRNA-miRNA-mRNA相关ceRNA调控网,再对生存相关lncRNA所相关的mRNA进一步功能富集和注释,并构建蛋白质互作网络最终用关键基因通过人类蛋白质图谱(the human protein atlas,HPA)数据库进行验证。结果在TCGA中共找到TNBC差异表达mRNA 2331个、差异miRNA 100个和差异lncRNA 1269个。ceRNA调控网中的mRNA在细胞黏附、唾液分泌和血小板活化、用于IgA产生的肠道免疫网络、补体和凝血级联反应等信号通路中明显富集。生存分析中,1个差异mRNA(NMUR1),1个差异表达miRNA(hsa-miR-6832-3p),2个差异表达的lncRNA(AC104809,LINC01297)的表达量均与TNBC患者的预后相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。最后利用HPA数据库对NMUR1蛋白水平和生存分析验证,NMUR1的高表达患者的总生存期显著高于NMUR1低表达组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论成功构建了促进TNBC发生发展的lncRNA-miRNA-mRNA调控网络,筛选得到生存相关的差异mRNA,miRNA和lncRNA为TNBC发病机制的研究和诊疗生物标志物的探索提供参考依据。 肖姗姗 李越 周艳阳 何谦关键词:三阴性乳腺癌 2型糖尿病合并冠心病患者血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)变化及其与PCI术后近期主要不良心血管事件的相关性 2025年 目的探讨2型糖尿病(T2DM)合并冠心病(CHD)患者血清低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)/高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)比值、脂蛋白(a)[Lp(a)]变化及其与经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术后近期主要不良心血管事件(MACE)的相关性。方法选取2022年9月-2023年6月西安交通大学第二附属医院心血管内科收治的T2DM合并CHD患者120例为观察组,并根据PCI术后近期是否发生MACE将T2DM合并CHD患者分为预后不良亚组29例和预后良好亚组91例。另选取同期医院单纯CHD患者65例为对照组,采用酶法测定血清LDL-C、HDL-C水平,免疫比浊法测定血清Lp(a)水平;Pearson法分析血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)水平与Gensini评分的相关性;多因素Logistic回归分析T2DM合并CHD患者PCI术后近期MACE的影响因素;受试者工作特征(ROC)曲线分析血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)水平对T2DM合并CHD患者PCI术后近期MACE的预测价值。结果观察组血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)水平高于对照组(t/P=6.594/<0.001、11.369/<0.001);Pearson分析结果显示,T2DM合并CHD患者血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)水平均与Gensini评分呈正相关(r/P=0.751/<0.001,0.744/<0.001);PCI术后随访12个月,T2DM合并CHD患者MACE发生率为24.17%(29/120)。预后不良亚组Gensini评分、血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)水平高于预后良好亚组(t/P=3.939/<0.001、4.413/<0.001、4.333/<0.001);多因素Logistic回归分析显示,Gensini评分高、LDL-C/HDL-C比值高、血清Lp(a)水平高为T2DM合并CHD患者PCI术后近期MACE的独立危险因素[OR(95%CI)=5.298(3.259~8.614)、4.817(2.914~7.963)、4.855(2.852~8.264)];血清LDL-C/HDL-C比值、Lp(a)水平及二者联合预测T2DM合并CHD患者PCI术后近期MACE的曲线下面积(AUC)分别为0.765、0.737、0.930,二者联合的AUC大于两指标单独预测(Z/P=20.093/<0.001、18.651/<0.001)。结论T2DM合并CHD患者LDL-C/HDL-C比值、血清Lp(a)水平异常高表达,且分别与Gensini评分呈正相关,二者联合可有效预测T2DM合并CHD 尹佳锋 宋琳岚 董炜 张妮 韩婕 何谦关键词:2型糖尿病 冠心病 主要不良心血管事件 陕西地区RhD阴性儿童患者Rh表型分布特征研究 被引量:2 2020年 目的了解陕西地区RhD阴性儿童血型表型的多态性,为儿童输血提供科学安全的参考依据。方法随机选取2018年9月~2019年4月于西安交通大学附属儿童医院就诊的59582例儿童血细胞检测标本,采用试管法检测RhD抗原。筛选的RhD阴性标本用间接抗人球蛋白法进行确认,并调查其C,c,E,e抗原表现型频率。结果检出RhD阴性儿童269例,Du 2例,陕西地区儿童患者RhD阴性率为4.48‰,其中男性147例,女性120例。不同性别的RhD阴性儿童患者的ABO血型构成比不全相同。继续深入分析2019年1~4月期间就诊的儿童患者中,91例确认的RhD阴性标本ccee的表型频率为46.15%(42/91),Ccee为40.66%(37/91),ccEe为6.59%(6/91),CCee为4.40%(4/91),CcEe为1.10%(1/91)和ccEE为1.10%(1/91)。结论陕西地区RhD阴性儿童患者中,B型男性人群多于女性,A型女性人群多于男性。Rh表现型以ccee和Ccee为主,CcEe和ccEE表型频率最低,Rh血型表型分布研究对促进临床儿童输血安全具有重要意义。 刘静娟 李越 何谦 周晓艳 尹阳 肖姗姗关键词:儿童 RHD阴性 乳腺癌中HPV16E6、E7和细胞特异性增强子的检测 乳腺癌是严重危害女性健康的恶性肿瘤.其发病率在逐年上升。目前有关乳腺癌发生确切的原因和机理还不完全清楚,研究认为它是由多种致病因素共同作用导致的。人乳头瘤病毒特别是高危HPV16病毒是一种肿瘤相关病毒,HPV16感染与乳... 何谦关键词:HPV16E6 病毒癌基因 乳腺癌 细胞特异性 增强子 靶向prohibitin基因的shRNA真核表达载体上调凋亡因子caspase3/8 何谦 赵丽华基于TCGA数据库筛选微小RNA(miRNA)用于原发性乳腺癌早期诊断的生物信息学分析 被引量:3 2021年 目的基于肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库筛选微小RNA(miRNA)用于原发性乳腺癌的早期诊断。方法从TCGA上下载原发性乳腺癌miRNA表达数据,将癌症组与正常组比较获得差异表达miRNA。用miRwalk2.0软件分析差异miRNA的靶基因。在c-Bioportal数据库中筛选出原发性乳腺癌突变发生率大于5%的突变基因。分析差异miRNA作用的靶基因与乳腺癌高频突变基因之间的关系,得到备选miRNA,将备选miRNA与乳腺癌前20名差异表达的miRNA求交集,得到目标miRNA,将目标miRNA做受试者工作曲线(ROC曲线)分析。结果TCGA数据包含原发性乳腺癌组织1075例,正常对照乳腺组织95例,共有1870条miRNA的表达数据。共得到差异表达显著miRNA 129个(P<0.05),其中乳腺癌组织中表达升高至3倍以上的miRNA 90个,下调至1/3的miRNA 39个,预测到相对应18413个靶基因,筛选出原发性乳腺癌突变基因12个。18413个靶基因中包含12个高频基因,此12个基因是差异miRNA的靶基因同时也是高频基因,故将此12个基因对应的63个miRNA作为备选miRNA。将备选miRNA与乳腺癌前20名差异表达的miRNA求交集得到目标miRNA 6个:hsa-mir-4732,hsamiR-486,hsa-miR-592,hsa-miR-449b,hsa-miR-187和hsa-miR-196a,将这6个miRNA构建ROC曲线(P<0.05),预测其作为肿瘤标志物的诊断能力。结论基于TCGA数据库的生物信息学方法可简便而可靠地筛选目标miRNA进行后续研究,有较高的参考价值。 尹阳 孙巨军 李越 李欣 何谦关键词:原发性乳腺癌 生物信息学分析 基于生物信息学的Prohibitin在乳腺癌中的表达及意义 2019年 目的通过生物信息学高通量多组学数据库分析浸润性乳腺癌组织中prohibitin(PHB)的表达及其临床意义。方法下载TCGA和METABRIC乳腺癌数据,应用多种工具比较癌组织和癌旁组织中PHB表达情况,并分析PHB表达与乳腺癌患者临床病理特征及预后之间的相关性,进行PHB蛋白互相作用预测及功能分析。结果 PHB在多种癌组织中较癌旁组织高表达,乳腺癌中PHB基因突变和表达量改变比例较高;PHB基因表达对于乳腺癌具有良好的诊断效能(P<0.01);PHB表达与乳腺癌患者ER受体、HER2、PAM50分型、肿瘤纯度等指标有关(P<0.05)。生存分析表明,乳腺癌PHB高表达是影响乳腺癌的独立危险因素(P<0.01)。HRAS、KSR1、ARAF与PHB相互作用且相关性较高,在乳腺癌组织中可见表达改变。结论 PHB在乳腺癌、卵巢癌等多种癌组织中表达升高,并且PHB高表达明显影响乳腺癌患者预后,PHB基因表达对乳腺癌的诊断效能较好,可作为乳腺癌诊断、预后的潜在标志物。 李越 周晓艳 刘佳丽 袁晓红 何谦关键词:乳腺癌 PROHIBITIN 预后 生物信息学 对不同系统偏差评估和比对的几点看法 在不同的检测系统上进行测定时,除了仪器应使用配套的校准物定期校正,每天有质量控制系统监控外,还应对日间精密度进行考查。可选用质控品作为盲样,若不同检测系统的日间标准差s低于1/3 CLIA'88规定的允许误差范围,可保证... 何谦 王香玲 赵丽华Prohibitin表达及对乳腺癌细胞系MCF-7抑制生长的机制研究 被引量:1 2020年 目的该研究从细胞水平研究了抗增殖蛋白(prohibitin)高表达在乳腺癌细胞中的生物学功能,并研究其抑制MCF-7生长的分子机制。方法使用基因重组法构建pEGFP-PHB重组质粒,脂质体瞬时转染乳腺癌细胞系MCF-7,real time-PCR和Western Blotting验证其高表达后,检测细胞生物学功能。包括:MTT(噻唑蓝)法检测细胞生长、流式细胞仪检测细胞周期与凋亡、肿瘤相关基因P53,Bcl-2,ERBB2及E2F-1的检测和Transwell小室侵袭实验。两样本差异比较采用t检验,多样本差异采用单因素方差分析。结果MTT显示PHB高表达组在转染24,48和72h对细胞生长的抑制率分别为20.98%,14.93%和62.94%,差异有统计学意义;流式细胞仪检测细胞分裂周期,phb高表达G1期无差异,S期降低,G2期增加;凋亡检测中,高表达组细胞总凋亡率为33.67%±8.68%,阴性对照组的凋亡率12.13%±3.76%,空白对照组凋亡率为6.99%±2.33%,高表达组细胞凋亡率高于对照组,差异有统计学意义(F=18.992,P=0.003);PHB高表达时,肿瘤相关蛋白P53和ERBB2的表达量高于对照组(t=4.590,P=0.044;t=9.489,P=0.011),Bcl-2表达降低,差异有统计学意义(t=7.143,P=0.019),E2F-1蛋白各组间差异无统计学意义(t=2.175,P=0.162);PHB高表达组细胞侵袭能力低于对照组,差异有统计学意义(t=3.221,P=0.01;t=4.057,P=0.003)。结论PHB高表达抑制S期DNA的合成,阻滞细胞于G2/M期,增加细胞凋亡率,抑制肿瘤细胞MCF-7的生长。其与肿瘤相关蛋白P53和ERBB2的增高,Bcl-2表达的降低紧密相关。 周晓艳 李越 何谦 袁晓红 张海宝关键词:乳腺癌 增殖 凋亡