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耿立英: 作品数：92 被引量：210H指数：8; 供职机构：河北科技师范学院更多>>; 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目河北省自然科学基金博士科研启动基金更多>>; 相关领域：农业科学文化科学生物学理学更多>>

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我国驴生长激素(GH)基因序列、分子进化及其多态性的研究: 朱文进苏咏梅关学敏吴建华耿立英高山林杨彩然刘玉芹陈娟刘谢荣刘延玉史洪梅张孟杰; 1．任务来源：河北省自然科学基金资助项目，项目编号：C2007000739。2．应用领域和技术原理：2.1应用领域畜牧科学。2.2技术原理生长激素(GrowthHormone，GH)是大脑垂体前叶分泌的一种多肽类激素，对...; 关键词：; 关键词：生长激素基因序列

中国驴种GH基因遗传多样性及其系统分化研究: 关学敏朱文进苏咏梅东方阳杨晓玲杨晴邹亚学杜金友秦玲耿立英齐艳玲蔡爱军; 该项目来自河北省秦皇岛市科技局科技支撑项目，课题编号：201001A155，该研究成果的简要技术说明如下：1、根据NCBI发表的中国矮马、牛等物种的GH基因组DNA序列，经DNAMAN进行同源比对后，利用Primer3在...; 关键词：

驴生长激素(GH)基因序列及其生物信息学分析: 关学敏朱文进杨晴苏咏梅东方阳杨晓玲耿立英齐艳玲蔡爱军; 该项目来自河北省教育厅高等学校科学技术研究指导项目，课题编号：Z2010137，该研究成果的简要技术说明如下：1、克隆出驴的生长激素基因全序列1928bp，驴GH基因的cDNA编码的是216个氨基酸的前体蛋白，包括26个...; 关键词：; 关键词：生长激素基因序列

鸡TLR3、TLR4和TLR21单核苷酸多态性的生物信息分析被引量：2: 2018年; 试验旨在筛选鸡TLR3、TLR4和TLR21基因中的功能性nsSNPs。利用SIFT、PolyPhen-2、PANTHER、PMut和PROVEAN五种软件方法分析引起的氨基酸替换nsSNPs是否可能影响基因的功能。进一步对三个基因氨基酸序列进行翻译后修饰位点及进化位点保守性的预测,使用easymodeller和SWISS-MODEL构建了其野生型及突变型蛋白质的空间结构,并计算突变前后的RMSD。结果表明:TLR3的K240T、T767S、D849N,TLR4的F427V、K714R和TLR21的T455A、Y553H、L602P、W926S可能严重影响蛋白质的结构功能。; 张健郝文文刘路张传生王亚琪张欢欢耿立英李祥龙; 关键词：同源建模

鸡IFIT5基因编码区多态性及生物信息学分析被引量：1: 2021年; 为探究鸡IFIT5基因多态性,预测其蛋白质的结构并分析功能特征,采用PCR技术对IFIT5的CDS进行扩增,并结合多种生物信息学等方法对蛋白的理化性质及蛋白结构功能进行系统性预测分析。结果显示:通过PCR成功克隆了IFIT5外显子2的CDS区域,测序结果为1 411 bp;经分析得到完整的IFIT5 CDS区为1 440 bp,共编码479个氨基酸,测序比对结果准确。IFIT5蛋白为不稳定的、小分子的、非分泌型的亲水蛋白,且具有磷酸化和糖基化位点;二级结构主要以α-螺旋为主,结构域以TPR结构域为主。研究发现了12个SNP,其中SNP1(g.405 G>A)和SNP9(g.1 124 G>A)在原鸡为A,在家鸡中已固定为G;只有SNP8(g.110 8 A>G)和SNP12(g.1 273 A>G)位点具有中度多态性,其他位点是低度。12个SNP位点中存在4个nsSNP位点(D370N、Y375C、N402K和G425R)。其中D370N、Y375C和N402K位点被预测为有害性位点;并且D370N和N402K突变可能改变相关氨基酸的氢键数目和蛋白的高级结构,进而影响蛋白的结构和功能。这些nsSNP位点,特别是D370N和N402K可尝试作为鸡先天免疫的候选分子标记,为遗传资源的保护及抗病性分子育种提供理论依据。; 张贝孟婕任一帆杨晴巩静张传生耿立英李祥龙; 关键词：多态性蛋白质结构生物信息学分析

不同鸡种mtDNA D-loop区的遗传多样性研究被引量：2: 2018年; 为更好地保护和利用太行鸡、坝上长尾鸡和北京油鸡遗传资源,阐明其遗传多样性及分化关系,采用PCR产物直接测序法,测定了3个鸡种的138个个体mtDNA D-loop全序列。结果显示:在所测定的mtDNA D-loop序列中,共检测到70个变异位点(包括31个单一位点突变和39个简约信息位点),组成49种单倍型。群体内序列间核苷酸平均差异数为9.179,核苷酸多样性为0.0075±0.0002,平均单倍型多样性为0.960±0.006。太行鸡、坝上长尾鸡和北京油鸡的单倍型数分别为24、21和14个,均有品种特异的单倍型。邻接树显示3个鸡种与红原鸡聚为一簇,与灰原鸡分开。Network结构图显示,3个鸡群体可划分到A、B、C、E和Y共5个世系分支中。结果表明,3个地方鸡遗传多样性丰富,群体间存在明显遗传分化;太行鸡和坝上长尾鸡在一定程度上受到商品鸡血统的影响。; 张健郝文文张传生樊路杰耿立英李祥龙; 关键词：北京油鸡 MTDNA

基于全基因组重测序分析坝上长尾鸡遗传多样性与保种效果: 2024年; 本研究旨在通过全基因组重测序技术分析坝上长尾鸡群体遗传多样性,评估其保种效果,以更好地保护和利用该遗传资源。研究采用基因组全测序技术检测37只坝上长尾鸡和40只巴布考克B380的基因组变异,通过群体遗传多样性、连续纯合子片段(Runs of Homozygosity,ROH)分布特征及连续不平衡衰减分析,对坝上长尾鸡保种效果进行综合评估。结果显示,37只坝上长尾鸡个体共检测到11 382 746个高质量SNPs位点,平均观察杂合度为0.410±0.208,平均期望杂合度为0.344±0.130,与巴布考克B380相比,坝上长尾鸡群体基因组内连锁不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)程度较低且遗传多样性较为丰富(P<0.001)。坝上长尾鸡群体平均状态同源(Identity by State,IBS)遗传距离为0.755,亲缘关系G矩阵结果与IBS距离矩阵结果一致,均显示坝上长尾鸡部分个体间亲缘关系较近(P<0.001);与巴布考克B380相比,坝上长尾鸡个体间平均遗传距离较大(P<0.001)。37只坝上长尾鸡个体共检测到7 002个基因组ROH,ROH平均长度为0.47 Mb,基于ROH的平均近交系数为0.458,表明坝上长尾鸡个体间存在一定程度的近交积累。本研究表明,与巴布考克B380相比,坝上长尾鸡群体遗传多样性较为丰富,但个体间存在近交风险,应加强选配以确保坝上长尾鸡品种资源的可持续性发展。; 张夕霏葛华梁赵然钱治民任敏鹏王彩彤张传生耿立英李祥龙

一种鉴别鸡群对沙门氏菌易感性的SNP位点、筛选及应用: 本发明公开了一种鉴别鸡群对沙门氏菌易感性的SNP位点，所述SNP位点为TLR1A基因第2443位T/C变异和TLR4基因第1147位T/C变异；其中，第2443位T/C变异所在的特征序列为：TATAACCCAA[T/C]...; 耿立英孟婕张传生张夕霏周泽宇李祥龙

解析大学生逃课现象被引量：3: 2009年; 高校逃课是当前高等教育中面临的尴尬问题。导致高校学生逃课的原因很多,学生逃课后的去向也很多,本文针对不同的逃课原因进行分析,希望能够改革教育体制中存在的问题,从根本上解决学生逃课现象。; 张传生耿立英; 关键词：大学生逃课教育改革

鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测被引量：4: 2008年; GDF-8、IGF-I、IGF-III、IGF2R、IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因。利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3′UTR潜在的microRNA靶标,并发掘靶标区域SNP位点。结果表明:在6个基因的26个microRNA靶标区域,共检测到125个SNP位点,在靶标及其5′和3′邻接等长侧翼区分别检测到47个、44个和35个SNPs位点,其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区。种子序列互补区及其3′侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控,导致家禽的表型变异。; 耿立英张传生杜立新; 关键词：非翻译区小RNA 生物信息学单核苷酸多态性

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