王大鹏
- 作品数：49 被引量：90H指数：5
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生轻工技术与工程农业科学生物学更多>>
- 1株三型丁香假单胞菌猕猴桃致病变种细菌全基因组扫描图测序及分析被引量：2
- 2020年
- 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,简称Psa)是引起猕猴桃细菌性溃疡病的病原菌。对从感染溃疡病的东红猕猴桃枝条中分离得到的1株Psa野生株(命名为GX05)进行全基因组测序,获得基因组草图,分析其中毒力基因、耐药基因和致病基因的情况。研究发现,多位点序列分型结果显示GX05为biovar 3,与毒力因子数据库比对,GX05携带99种毒力因子及692个相关毒力基因,同源性和匹配度最高的毒力因子是PvdL和Irp1;与综合抗生素抗性基因数据库比对,GX05携带336种耐药基因,与29种抗生素有关;与病原宿主互作数据库比对,不表达导致病原菌致病力减弱的基因数量最多,其中同源性和匹配度最高的是PvdL,此外与增强致病力相关的同源性和匹配度最高的基因是hrcC。通过全基因组测序信息初步分析了1株三型Psa菌株中存在的毒力、耐药及致病基因情况,对深入研究其致病机制和合理用药有重要意义。
- 邓博涵刘丹蕾陈秋菊倪培恩张子蕾王大鹏纠松涛王磊马超张才喜王世平沈叶鑫鲍金平许文平
- 关键词：猕猴桃细菌性溃疡病全基因组测序毒力基因耐药基因致病基因
- 上海市售海产品中副溶血性弧菌的分布状况被引量：14
- 2015年
- 海产品中副溶血性弧菌引起的食物中毒已成为我国沿海地区细菌性食物中毒的首要病原。本研究中针对上海市闵行区某农贸市场的海产品开展为期1年的调查分析,共采集257份样品。按照国家标准(GB/T4789.7-2008),以硫代硫酸钠柠檬酸胆盐蔗糖培养基(TCBS)和科玛嘉弧菌显色培养基(CV)两种选择性培养基辅助分离副溶血性弧菌疑似菌株,结合生化试验和PCR方法对疑似菌株进行鉴定,从84份阳性样本中获得107株副溶血性弧菌分离株。其结果表明:该农贸市场市售海产品中副溶血性弧菌的污染率为32.7%,其中牡蛎中副溶血性弧菌污染率最高(达54.4%),蛤蜊和海瓜子次之(分别为33.9%,25.6%)。牡蛎中副溶血性弧菌的污染水平与季节性变化直接相关。对107株分离株的主要毒力基因tdh和trh进行PCR筛查,tdh阳性菌株为10株,trh阳性菌株为1株,并且此株菌为tdh、trh双阳性菌株,tdh和trh的携带率分别为9.4%和1.0%,tdh、trh双基因的携带率为1.0%。结论:市售海产品中副溶血性弧菌污染状况较为严重。这为政府相关职能部门开展食品安全防控提供了参考依据。
- 陈志芸施春雷周秀娟张茜周敏王大鹏史贤明
- 关键词：海产品副溶血性弧菌PCR
- A组轮状病毒原位捕获RT-qPCR检测体系的建立及评估被引量：1
- 2021年
- 目的建立基于原位捕获反转录实时定量PCR方法(in situ capture real time quantitative reverse transcription PCR,ISC-RT-qPCR)检测感染性A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的体系,并对其进行评估。方法以自行构建的NSP3重组质粒为对象,绘制标准曲线;通过优化ISC-RT-qPCR体系中猪胃粘膜提取物(porcine gastric mucin,PGM)包被浓度、孵育时间、孵育缓冲液pH和封闭时间的参数,建立、完善RVA的ISC-RT-qPCR检测体系,并评估该体系的特异性、检测限及稳定性。结果ISC-RT-qPCR最佳试验参数分别为:PGM包被浓度为1.0 mg/mL、孵育时间为60 min、孵育pH为9.0、封闭时间为60 min;体系的检测限约为5拷贝/mL,检测特异性强、稳定性好。结论本研究所建立的ISC-RT-qPCR是一种可用于检测感染性RVA的方法,具有操作简单、绿色环保、可高通量检测等优点,适合于临床、尤其是低病毒载量的食品和环境样品中RVA的快速检测。
- 鲁飞凤吕陈昂石镇涛王大鹏
- 关键词：A组轮状病毒
- 一种人源诺如病毒免疫胶体金试剂盒及细胞株
- 本发明公开了一种人源诺如病毒免疫胶体金试剂盒，涉及分子生物学与免疫学领域，包括固相载体、检测抗体和样品处理液，其中固相载体包括样品垫、胶体金结合垫、具有检测线和质控线的承载膜、吸收垫及底板，胶体金结合垫包括结合垫本体和涂...
- 王大鹏
- 文献传递
- 氨基化磁性纳米粒子捕获基因组DNA结合PCR快速检测牛奶中金黄色葡萄球菌被引量：3
- 2017年
- 本研究对氨基化磁性纳米粒子进行优化,再用优化后的纳米粒子分离牛奶样品中微量的金黄色葡萄球菌基因组DNA,结合PCR检测,可以达到100 CFU/m L的检测限。在此过程中,纳米粒子与DNA的复合物直接加入到PCR体系中进行检测,无需洗脱、纯化等步骤,这样既减少了操作步骤,也减少了DNA损耗,还起到了浓缩的作用。而且,此方法中纳米粒子无需抗体等生物分子标记,成本非常低廉,在生命物质的快速检测中具有广阔的前景与巨大的潜力。
- 崔妍白亚龙施春雷王大鹏史贤明
- 关键词：金黄色葡萄球菌
- 沙门氏菌内标PCR快速检测试剂盒的研制与应用被引量：12
- 2011年
- 【目的】研制一种能有效指示假阴性的PCR检测产品,用于沙门氏菌快速、准确、灵敏的检测。【方法】针对沙门氏菌invA基因、stn基因序列分别设计引物与扩增内标,建立添加扩增内标的沙门氏菌PCR检测方法,组装试剂盒,并对试剂盒的各项性能进行评价。【结果】试剂盒对147株沙门氏菌和28株非沙门氏菌的检测结果显示,所有沙门氏菌均能扩增出362 bp的目标条带,非沙门氏菌仅扩增出520 bp的内标条带。试剂盒检测沙门氏菌基因组DNA的检测限为8.0 fg/PCR,检测染菌量为4—5 CFU/10 mL的牛奶样品,增菌8—10 h即得到阳性结果。反复冻融60次或-20℃下贮存1年,均不影响试剂盒的使用效果。对食品样品的检测结果显示,阳性检出率为2/30,与国标法的检测结果相符,比未添加扩增内标的PCR检测结果(阳性检出率为1/30)准确。【结论】采用添加扩增内标的PCR试剂盒检测沙门氏菌,特异性强、灵敏度高、稳定性好,并能有效指示假阴性,提高检测的准确性,适用于食品中沙门氏菌的快速筛检。
- 李小玲刘斌但现龙王大鹏周敏史贤明
- 关键词：沙门氏菌扩增内标检测试剂盒
- 诺如病毒研究进展被引量：3
- 2017年
- 近年来，媒体曝光了多起因诺如病毒（Norovirus，以下简称“NoV”）污染导致的食品安全事件，目前，美国、英国、法国、德国、日本、澳大利亚、中国等诸多国家都有NoV感染的报道。NoV每年可导致全球125亿人次感染和3．5万人死亡，且发病量逐年攀升。通过对我国27个省份173家哨点门诊2009年～2013年腹泻病例的调查可以发现。
- 王大鹏
- 关键词：病毒食品安全事件NOV
- 感染性人源诺如病毒的评估
- 人源诺如病毒(Human noroviruses,HuNoVs)是引起急性非细菌性胃肠炎暴发的重要病原之一。由于HuNoVs缺乏体外增殖模式或合适的小动物模型,该病毒检测主要依赖于以RT-PCR为代表的分子检测方法。虽然...
- 王大鹏史贤明
- 关键词：感染性
- 副溶血弧菌临床分离株的血清分型及毒力基因分析被引量：14
- 2013年
- 副溶血弧菌是一种以鱼类、贝类等海产品为主要传播载体的嗜盐性食源性致病菌。近年来,由该菌引起的食物中毒病例呈明显上升趋势。本文采用11种O抗体和8种K抗体,针对来自舟山、宁波、上海浦东和金山的58株副溶血弧菌食物中毒临床分离株(2006-2009年)进行血清型及毒力基因分析。菌株血清分型结果表明:上述4地致病性副溶血弧菌以O3群和K6型为主,共分为22个血清型。其中主要流行株为O3:K6型,占67.72%(107/158);其次为O1:K6,O3:K68,O1:K25,O1:K56,O2:K3等。菌株的来源地分析结果表明:上海金山临床分离株的血清型最复杂,表现出明显的多样性;舟山血清型较单一。利用PCR方法对上述158株副溶血弧菌的主要毒力因子——耐热溶血素基因(tdh)和耐热相关溶血素基因(trh)进行检测,结果发现,其阳性率分别为96.84%(153/158)和3.80%(6/158)。其中(tdh+/trh+)6株,(tdh+/trh-)147株和(tdh-/trh-)5株。结论:杭州湾4地致病性副溶血弧菌流行菌株血清型为O3:K6,且不同地区血清型差异较大;除极少数菌株外,绝大部分菌株都携带tdh或者trh。
- 代敏王大鹏陈万义史贤明
- 关键词：副溶血弧菌临床分离株血清型毒力基因
- 牡蛎不同组织中副溶血弧菌累积富集及净化
- 副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)是重要的食源性致病菌之一,牡蛎是其主要传播载体。但是到目前为止,副溶血弧菌在牡蛎不同组织中的分布状况仍不清楚。所以,研究该致病菌在牡蛎组织中的分布对于提高该菌检...
- 王大鹏
- 关键词：副溶血弧菌牡蛎饮食安全免疫磁珠法食源性致病菌多克隆抗体
