沈新媛
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 供职机构：大连大学生命科学与技术学院辽宁省生物有机化学重点实验室更多>>
- 发文基金：辽宁省教育厅基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 人体端粒中(3＋1)混合结构G-四链体稳定性的分子动力学模拟被引量：3
- 2009年
- 利用分子动力学模拟方法,考察了人体端粒中(3+1)混合结构G-四链体的结构及稳定性问题.讨论了配位K+离子、药物分子(端粒抑素)和溶剂水分子对G-四链体的Hoogsteen氢键结构、π-π堆积作用的影响.研究表明,K+离子与鸟嘌呤碱基上O6原子的配位作用减弱了对角鸟嘌呤间O6-O6的静电排斥作用,使得相邻的四个鸟嘌呤能够以Hoogsteen氢键结合的方式形成具有近平面结构的稳定G-四平面.另一方面,G-四平面间、G-四平面与药物分子间的π-π堆积作用降低了G-四链体复合物的总能,有利于其稳定存在.此外,溶剂水分子主要分布在G-四链体的TTA环、骨架和糖环的周围,使其位移涨落增大;然而,在3ns动力学模拟中,由于水分子没有进入到G-四链体的空腔中,溶剂水对G-四平面的结构影响不明显.
- 沈新媛吕洋李慎敏
- 关键词：Π-Π堆积作用分子动力学模拟
