张向喆
- 作品数：36 被引量：117H指数：6
- 供职机构：上海交通大学农业与生物学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划黑龙江省科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 金华猪与杜洛克、长白猪、大白猪杂交的杂种优势预测被引量：6
- 2019年
- 本研究旨在探讨杜洛克(D)、大白(Y)和长白(L)3个知名西方品种与金华猪(J)的杂交利用情况。应用"基于基因组简化与测序的基因型判型(GGRS)"技术平台,检测单核苷酸多态性(SNPs)并判定基因型。利用全基因组性状特异的SNP分子标记估算不同群体间的遗传距离,从胴体与肉品质、繁殖、健康和生长4个性状对金华猪不同杂交模式下的杂种优势进行预测。结果表明:共找到繁殖、生长、胴体与肉品质和健康性状潜在相关基因的SNP分别为1 835、2 174、196 057、17 200个;在二元杂交组合中,♂杜×♀金(D×J)为较优组合;在三元杂交组合中,♂金×♀长大(J×LY)为较优组合;在四元杂交组合中,♂杜金×♀长大(DJ×LY)为较优组合。本研究应用生物信息学技术对金华猪不同杂交模式的杂交优势进行预测,可大大减少后续的配合力实验,结果可为金华猪的保种和杂交利用提供一定参考。
- 徐忠张哲孙浩张向喆徐宁迎陈究成华坚青钟土木王起山潘玉春
- 关键词：金华猪杂种优势预测
- 杂种猪染色体的核型与显带研究被引量：6
- 2003年
- 应用常规方法获得了杂种猪(野猪(♂)×家猪(♀))的核型、C带和174条带纹的G带,应用微量秋水仙素法得到了258条带纹的高分辨G带。结果表明,杂种猪的二倍体细胞染色体数目2n=38,C带具有多态性,G带和高分辨G带与家猪相比无明显差异,它们属于同一种。
- 张冬杰刘娣顾志刚杨玉林张向喆杨秀琴
- 关键词：野猪杂种猪核型显带
- 生物医学文本中命名实体识别研究被引量：7
- 2010年
- 生物命名实体识别是对生物医学文本进行信息处理的关键技术。准确的生物命名实体识别工具是对文本进行后续工作如信息提取或文本分类等的先决条件。经过多年的研究,生命科学领域生物命名实体识别取得了一定的进展。本文总结了生物命名实体的特征,分析了基于不同方法的生物命名实体识别系统,及生物命名实体识别方法在提取蛋白质互作等方面的丰富应用,并展望了未来的发展趋势。
- 张向喆王明辉赵洪波王起山潘玉春
- 关键词：生物信息学生物医学文献
- 猪ESR和FSHβ位点基因对猪产仔性状的影响研究
- 由于猪产仔数的遗传力低（0.1左右），属限性表达，常规的育种技术对产仔数性状的
改变十分有限，所以寻找控制猪繁殖率的主效基因及其遗传标记对提高猪产仔数具有重
要意义。ESR和F...
- 张向喆
- 文献传递
- VEGFA,HIF1A和EPAS1基因多态性与猪繁殖性状的相关研究(英文)
- 2014年
- 在梅山猪保种群和法系大白猪群体中采用直接测序法和PCR-RFLP法对基因VEGFA、HIF1A和EPAS1进行了基因多态位点的寻找及多态性检测并对不同基因型的总产仔数、产活仔数等繁殖性状进行了相关分析。在所获得的基因VEGFA的扩增片段中共检测到17个多态位点,其中有4个位点可进行PCR-RFLP检测,分别为BstH2I-RFLP,PspEI-RFLP,Eco32I-RFLP和BcnI-RFLP,而在HIF1A和EPAS1扩增片段中未获得可进行PCR-RFLP检测的多态位点。在2个实验猪群中对VEGFA基因的4个多态位点进行基因型及等位基因频率分析,结果表明:VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI 3个多态位点在梅山猪群体中A等位基因占优势,BcnI多态位点在梅山猪群体中B等位基因占优势,而在法系大白猪群体中VEGFA基因的BstH2I、Eco32I、PspEI和BcnI 4个多态位点的相关基因型和等位基因分布极不均衡。BstH2I和PspEI多态位点相关的A等位基因频率在法系大白猪群体中为0,而Eco32I和BcnI多态位点相关的A、B等位基因频率在法系大白猪群体中不到1%。单倍体型推断结果表明VEGFA基因4个多态位点在梅山猪群体中共存在10种单倍体型,而在法系大白猪群体中只存在2种单倍体型BBBA和BBAB,且只有一个个体的单倍体型是BBAB。通过性状关联分析,发现梅山猪群体中VEGFA基因单倍体型BBBA对初产总仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BABA对经产总仔数和经产活仔数影响显著(P<0.05);单倍体型BBAA对初生窝重影响显著(P<0.05)。使用辐射杂种克隆板将基因VEGFA定位于SSC7q11-12;基因HIF1A定位于SSC1;基因EPAS1定位于SSC3q11-14。而所获得的基因HIF1A和EPAS1的扩增片段无PCR-RFLP可识别的SNP位点。研究结果表明猪VEGFA基因具有成为影响猪繁殖性状分子遗传标记的潜力。
- 张向喆杨仑陈强谭桂芳陈剑严国祥潘玉春
- 关键词：VEGFA基因多态性繁殖性状
- 奶牛生产性能测定与遗传评定方法被引量：2
- 2009年
- 探讨了奶牛生产性能测定的概念、实施和作用,以及动物模型BLUP法和测定日模型,对比了二者的优缺点,并对生产性能测定和测定日模型的发展和前景进行了展望。
- 谭桂芳潘玉春吴潇张向喆高运臻高会江
- 关键词：生产性能测定动物模型BLUP测定日模型
- 绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因预测分析
- 2016年
- 本研究旨在分析绿壳蛋鸡与白来航蛋鸡microRNA变异及其靶基因,将已鉴定的microRNA与预测microRNA组成全基因组的microRNA,并通过与GGRS得到的两种鸡群体SNP位点进行映射,挖掘含SNP的microRNA。利用生物信息学的方法,对含SNP的microRNA进行靶基因预测,并对直接含有SNP的maturemicroRNA进行聚焦。将这些靶基因进行富集,一共得到22个GO分类和10条KEGG信号通路与3个主要IPA调控网络,发现其在与生长相关的mTOR信号通路、Wnt信号通路、生长激素受体网络、胰岛素样生长因子Ⅰ受体网络得到了富集,与产蛋性状相关的卵母细胞减数分裂信号通路、黄体酮卵母细胞成熟信号通路得到了富集。此研究方法和结果可以给后期研究提供参考。
- 管毓渝廖荣荣王振赵静陈振亮张哲肖倩孙浩王起山张向喆杨长锁潘玉春
- 关键词：绿壳蛋鸡MICRORNASNP
- 酵母CUP1基因在动物饲养领域的用途
- 本发明涉及基因工程技术领域，特别是涉及酵母<I>CUP1</I>基因在动物饲养领域的用途，并进一步提供相关<I>CUP1</I>基因的表达载体及其制备方法。本发明提供酵母<I>CUP1</I>基因在动物饲养领域的用途，所...
- 潘玉春颉孝贤马育芳王起山张向喆杨玉梅陈强廖荣荣陈振亮王振贺鹏飞张哲涂盈盈
- 文献传递
- 杂谈猪的遗传改良——如何确定选择指数中各性状的权重被引量：1
- 2017年
- 选择指数由各育种相关性状的育种值加权合并而成。各性状的权重常采用经济重要性,而其大小涉及特定群体、特定市场背景下这些性状的经济重要性及其方差与协方差,因而适用范围具有一定限制,而其估计又很困难。有鉴于此,笔者建议采用基于现况与育种目标差距的育种重要性作为权重。本文系统介绍了育种重要性的概念与公式,给出了例题与软件,并探讨了应用中的一些相关问题,希望满足企业藉由个性化的指数及其性状权重开展个性化育种的愿望,进而推动《全国生猪遗传改良计划(2009—2020)》的实施。
- 潘玉春王起山王起山张向喆张向喆
- 关键词：选种
- 缺氧诱导因子在血管生成中的研究进展被引量：1
- 2009年
- 目前已发现的缺氧诱导因子(HIFs)有3个,即HIF-1、HIF-2和HIF-3。它们广泛存在于人和哺乳动物的细胞内。HIFs由对氧敏感的功能性亚基(α亚基)和构建性表达的结构亚基(β亚基)组成,它们调节的目标基因的表达涉及血管生成、红血球生成、能量代谢、细胞增殖和凋亡等生物学过程。介绍了近年来HIFs及其在血管生成中的研究进展,以便对HIFs进行更深入、广泛的研究。
- 张向喆王起山潘玉春
- 关键词：缺氧诱导因子缺氧诱导因子靶基因血管生成
