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孟繁驰
作品数:
2
被引量:1
H指数:1
供职机构:
西北农林科技大学信息工程学院
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发文基金:
陕西省自然科学基金
陕西省科学技术研究发展计划项目
国家自然科学基金
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相关领域:
自动化与计算机技术
生物学
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合作作者
李书琴
西北农林科技大学信息工程学院
蔡骋
西北农林科技大学信息工程学院
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2013
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2
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基于核范数凸优化的微阵列缺失点重建
被引量:1
2013年
为解决大多数基因微阵列矩阵中含有缺失点的问题,提出了基于矩阵核范数凸优化(Nuclear Norm Optimization)的微阵列缺失点的重建方法。该方法利用了微阵列矩阵中的冗余信息,使用矩阵填充(Matrix Completion,MC)来重建缺失点,实现了矩阵的核范数凸优化。实验结果表明,矩阵填充在某些时间序列的微阵列数据集上与K最近邻(KNN)、贝叶斯主成分分析(BPCA)和局部最小二乘法(LLSimpute)相比表现出了较强的竞争力。由矩阵填充得到的矩阵,还可以替代广泛应用的局部最小二乘法中的行均值填充矩阵。矩阵填充和局部最小二乘法结合的方法在所有测试数据集的几乎所有缺失率下都取得了最低的重建错误率。
孟繁驰
李书琴
蔡骋
基因微阵列缺失点估计方法研究
基因微阵列技术在各种生物实验中已经得到了广泛的应用,是生物信息学中一项重要的研究分支。基因微阵列实质是大规模的矩阵,但由于受到实验条件的限制,这些矩阵往往都存在缺失点,所以如何对这些缺失点进行估计,是当前生物信息学领域研...
孟繁驰
关键词:
贝叶斯估计
最小二乘法
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