刘彬彬
- 作品数：21 被引量：207H指数：5
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市国际科技合作基金更多>>
- 相关领域：环境科学与工程农业科学生物学医药卫生更多>>
- 上海地区正常人群中TAP多态性调查被引量：5
- 1997年
- 报告一组无血缘关系的上海地区正常人中抗原处理相关转运蛋白（ＴＡＰ）的分布。在８８名正常人中共观察到３种ＴＡＰ１和４种ＴＡＰ２等位基因，其中包括罕见的ＴＡＰ２Ｈ等位基因。并将上海人群中ＴＡＰ的分布与日本人和白种人中ＴＡＰ的分布作了比较。
- 王福庆奚宏康刘彬彬
- 关键词：转运蛋白多态现象抗原性
- 焦化废水处理厂接触氧化池中降酚菌群的苯酚羟化酶大亚基基因多样性被引量：3
- 2005年
- 研究了某焦化废水处理厂接触氧化池中降酚菌群的苯酚羟化酶大亚基基因(thelargestsubunitofthemulti-componentphenolhydroxylase,LmPH)的多样性。通过温度梯度凝胶电泳(temperaturegradientgelelectrophoresis,TGGE)对比分析了氧化池4个区段(O1—O4)中降酚菌群LmPH的组成。它们的TGGE图谱完全一样,相似性为100%,表明该处理池中不同区段的降酚菌群的功能基因组成是高度相似的。以O4段的菌群为代表建立LmPH基因克隆文库,从中挑选了49个克隆测序。依据LmPH基因的DNA序列所推测的氨基酸序列完全相同的归为一类的原则,49个克隆被分为16种类型,其中优势LmPH基因主要有5种类型(多于4个克隆),而另外11种类型都只有1个克隆。与已知基因同源性超过90%的有7种类型,低于80%的有2种类型。基于氨基酸序列的系统进化树分析表明,LmPH文库中绝大部分的类型都属于低亲和常数(low-Ks)的LmPH,占所有克隆的92%。只有一个类型属于高亲和常数(high-Ks)的。因此,处理焦化废水的工业装置中不仅具有丰富多样的苯酚羟化酶基因类型,而且以编码低亲和常数的占优势地位,而过去报道的通过富集培养分离得到的降酚菌则多带有高亲和常数的酶。这提示我们传统的富集培养方法并不能筛选到生态环境中的真正优势功能菌。
- 张学礼熊顺子刘彬彬严兴周志华王凌华赵立平
- 关键词：TGGE克隆文库
- PCR-DGGE方法分析原油储层微生物群落结构及种群多样性被引量：61
- 2005年
- 使用基于 16 S r DNA的 PCR- DGGE(变性梯度凝胶电泳 )图谱分析结合条带割胶回收 DNA进行序列分析 ,对新疆克拉玛依油田一中区注水井 (12 # 9- 11)和与该注水井相应的两个采油井 (12 # 9- 9S、13# 11- 8)井口样品微生物群落的多样性进行了比较并鉴定了部分群落成员。 DGGE图谱聚类分析表明注水井与两油井微生物群落的相似性分别为 30 %和 2 0 % ,而两油井间微生物群落结构的相似性为 5 4 %。DGGE图谱中优势条带序列分析表明注水井样品和油井样品中的优势菌群为未培养的环境微生物 ,它们与数据库中 α、γ、δ、ε变形杆菌 (Proteobacteria)和拟杆菌 (Bacteroidetes)有很近的亲缘关系。 DGGE与分子克隆相结合的分子生物学方法在研究微生物提高原油采收率 (MEOR)机理 ,以及指导
- 佘跃惠张凡向廷生刘彬彬赵立平周玲革舒肤昌
- 中国人群中TAP多态性的调查及其与IgA肾炎相关性的研究
- 刘彬彬
- 对降解喹啉的厌氧生物反应器中重要功能菌群的鉴定被引量：5
- 2006年
- 通过把微生物区系组成的分子水平的动态变化情况与微生物群落的整体功能变化相关联,鉴定重要的功能类群是微生物分子生态学研究的一个重要的策略。应用分子生物学的方法,对一个实验室规模的用于降解喹啉的厌氧反应器生物膜样品的微生物区系组成变化进行解析,找出可能的主要功能菌。通过DGGE对反应器的种子污泥和运行稳定的厌氧生物膜反应器的微生物区系组成进行了对比分析,并对主要的优势条带进行了分子鉴定。同时对以上两个样品构建16SrDNA克隆文库,通过统计学分析对克隆文库的有效性进行验证,并对文库进行测序分析。DGGE条带及克隆文库的序列分析均表明,在驯化过程中,GammaProteobacteria亚纲与Desulfobacterpostgatei种的微生物显著增加,这种动态变化表明这些细菌可能是在厌氧条件下对喹啉的降解起关键作用的微生物。
- 刘彬彬张峰冯晓西刘勇弟张晓君赵立平
- 关键词：生物膜厌氧反应器DGGE
- 高效废水处理生物反应器中优势功能菌的分子识别与鉴定
- 刘彬彬
- 关键词：废水处理生物反应器功能菌分子识别
- 文献传递
- 喹啉与吲哚驯化的反硝化反应器的微生物群落结构分析比较被引量：8
- 2008年
- 【目的】本研究旨在比较分析分别以喹啉和吲哚为底物,在相同条件下驯化的两个反硝化生物反应器的微生物群落结构。【方法】采用相同的种子污泥和相同的驯化条件,经过大约6周的驯化后,两个反应器均达到稳定而高效的污染物去除能力,通过16SrDNA克隆文库技术对两个反应器的微生物群落结构进行研究。【结果】研究发现,微生物群落结构表现出很大的差异。喹啉驯化的群落中所有的OTU都属于Betaproteobacteria,而吲哚驯化的群落中Betaproteobacteria占56.3%,吲哚驯化的群落具有更高的多样性。两个群落的优势OTU也不同,喹啉驯化群落中Thauera及其它Rhodocyclaceae科的微生物占整个群落的73%,而吲哚驯化群落中优势OTU为Comamonadaceae科、Alcaligenaceae科和Rhodocyclaceae科等类型的微生物,其中Comamonadaceae科的一个OTU占整个群落的28.7%。【结论】不同的驯化底物对微生物群落的组成具有较强的选择作用。首次报道并比较了可高效降解喹啉和吲哚的反硝化生物反应器的微生物群落结构。
- 洪璇刘彬彬张晓君赵立平
- 关键词：喹啉吲哚反硝化细菌群落RDNA
- 处理焦化废水的厌氧和反硝化反应器的微生物区系结构解析及优势功能菌类型的鉴定
- 应用分子的分析方法,对两个实验室规模的处理焦化废水的厌氧和反硝化反应器的微生物区系进行了解析,并与种子污泥进行对比来鉴定功能菌。厌氧和反硝化是废水生物处理中的两个常用的条件,在这两种条件下,特定的有机物可以高效降解,而在...
- 刘彬彬张峰冯晓西刘勇弟张晓君赵立平
- 文献传递
- 原废水培养基分离活性污泥中的苯酚降解细菌被引量：29
- 2003年
- 用未经处理的含酚焦化工业废水为基础配制培养基,采用平板涂布法,在10^(-5)稀释度下得到100个单菌落分离物.它们均能在以苯酚(500～800 mg L-1)为唯一碳源的无机盐培养基上生长,其16S rDNA基因的ARDRA多态性分析将这些分离物划分成4个分类操作单元(OTUs).各单元代表株的16S rRNA基因序列分析和检索结果表明,97个分离物与Alcaligenes faecalis同源性达99％,2个分离物分别与Arthrobacter nicotianae和Klebsiella sp.99％同源,另一个分离物与Ochrobactrum sp.96％同源.苯酚羟化酶大亚基基因(LmPHs)PCR扩增表明,除类似Arthrobacter nicotianae的菌株外,其它3个分类操作单元的降酚菌都能利用多组分苯酚羟化酶代谢途径进行酚代谢.
- 高平平陈迎春刘彬彬张学礼赵立平
- 关键词：苯酚生物降解降解细菌活性污泥
- 喹啉与吲哚驯化的反硝化反应器的微生物群落结构比较分析
- 本研究以采自某焦化废水处理厂的生物处理反应器的二沉池的活性污泥为种子污泥,分别以40mg/L 喹啉和吲哚为底物,在相同条件下驯化了两个实验室规模的反硝化生物反应器。经过约6周的驯化,反应器达到稳定状态,喹啉驯化的反应器的...
- 洪璇刘彬彬张晓君赵立平
- 关键词：喹啉吲哚反硝化细菌群落
- 文献传递
