孙世伟 作品数:20 被引量:22 H指数:4 供职机构: 中国科学院计算技术研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 北京市自然科学基金 中国科学院知识创新工程 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 医药卫生 理学 生物学 更多>>
多级质谱生物大分子结构鉴定方法 本发明提供一种多级质谱生物大分子结构鉴定方法,包括:1)获得样品的二级质谱作为当前质谱;2)在当前质谱中,选择产生下一级质谱的离子,基于所选择的离子进行质谱实验获得所述下一级质谱;3)使用层次贝叶斯模型将所述当前质谱的后... 孙世伟 王耀君 卜东波 李岩 黄纯翠 刘亚名 杨飞 武红梅 陈润生文献传递 一种第二代、三代基因组测序数据联用的拼接方法及系统 本发明涉及生物信息技术和计算生物学领域,特别涉及一种第二代、三代基因组测序数据联用的拼接方法及系统,该方法包括获取第二代基因组测序数据,通过所述第二代基因组测序数据中部分碱基序列reads的质量信息,对所述第二代基因组测... 卜东波 张仁玉 陈挺 李帅成 孙世伟 刘兴武 许情 郑全刚 王超文献传递 基于全基因组比较的SARS冠状病毒种系进化分析 被引量:4 2003年 SARS(severe acute respiratory syndrome)冠状病毒已被世界卫生组织确认为SARS传染病的病原体,它的全基因组测序工作分别由中国、加拿大、美国等国的研究小组完成。然而它的起源仍是一个谜为了探寻SARS冠状病毒的来源,基于FDOD(function of degree of disagreement)方法,对12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒进行了全基因组比较,构造出种系进化无根树。结果表明,这两类病毒(分别由12个SARS冠状病毒分离株和12种以往发现的冠状病毒构成)虽然都来自冠状病毒属,但它们位于两个不同的进化分支上。冠状病毒属中的3个组被准确地重构。根据得到的结果,推测SARS冠状病毒更类似于第一组中的冠状病毒。根据种系进化树的拓扑结构和各SARS冠状病毒分离株与造成香港Metropole饭店疫情的SARS冠状病毒株之间的联系,推测各SARS冠状病毒分离株分别位于进化树上两个大的分支,这为SARS的流行病学研究提供了辅助信息。 齐震 狐昱 李蔚 陈燕俊 张治华 张治华 孙世伟 卢宏超 张京芬 卜东波 凌伦奖关键词:SARS冠状病毒 传染途径 一种基因组酶切图谱拼接方法及系统 本发明涉及分子生物学领域的基因组序列拼接领域,本发明提出一种基因组酶切图谱拼接方法及系统,该方法包括对所述基因组酶切图谱中基因序列分子进行预处理操作,获取新基因序列分子,将所述新基因序列分子切成FLES片段,其中所述FL... 卜东波 许情 陈挺 孙世伟 李帅成 刘兴武 张仁玉 王超文献传递 基于多级质谱技术高通量鉴定糖链分支结构 生物糖链对蛋白质构象、分子识别、细胞增殖和分化等过程具有重要影响,因而糖链分支结构的准确鉴定对于功能糖组学具有重要的意义[1]。多级质谱技术可以对糖链碎片进行多级断裂,反映出碎片的不同层次的结构信息,因此成为糖链结构鉴定... 黄纯翠 孙世伟 王耀君 刘亚名 张敬玮 周巾煜 高枫 杨飞 陈润生 柴文刚 卜东波 李岩关键词:糖链结构 自动化 高通量 文献传递 多级质谱生物大分子结构鉴定方法 本发明提供一种多级质谱生物大分子结构鉴定方法,包括:1)获得样品的二级质谱作为当前质谱;2)在当前质谱中,选择产生下一级质谱的离子,基于所选择的离子进行质谱实验获得所述下一级质谱;3)使用层次贝叶斯模型将所述当前质谱的后... 孙世伟 王耀君 卜东波 李岩 黄纯翠 刘亚名 杨飞 武红梅 陈润生文献传递 一种第二代、三代基因组测序数据联用的拼接方法及系统 本发明涉及生物信息技术和计算生物学领域,特别涉及一种第二代、三代基因组测序数据联用的拼接方法及系统,该方法包括获取第二代基因组测序数据,通过所述第二代基因组测序数据中部分碱基序列reads的质量信息,对所述第二代基因组测... 卜东波 张仁玉 陈挺 李帅成 孙世伟 刘兴武 许情 郑全刚 王超蛋白质质谱分析中的算法问题研究 串联质谱(Tandem Mass Spectrometry)是蛋白质序列鉴定的重要方法,其目标是如何从已知实验质谱来推断未知肽段的氨基酸序列.当前的主要方法是数据库搜索方法.对于数据库搜索算法,如何从一个肽段序列精确地预... 孙世伟关键词:串联质谱 蛋白质鉴定 EM算法 迭代算法 文献传递 基于多级质谱技术高通量鉴定糖链分支结构 生物糖链对蛋白质构象、分子识别、细胞增殖和分化等过程具有重要影响,因而糖链分支结构的准确鉴定对于功能糖组学具有重要的意义。多级质谱技术可以对糖链碎片进行多级断裂,反映出碎片的不同层次的结构信息,因此成为糖链结构鉴定的一项... 黄纯翠 孙世伟 刘亚名 王耀君 柴文刚 杨飞 高枫 陈润生 卜东波 李岩关键词:糖链结构 自动化 高通量 多级质谱技术高通量鉴定血液样品中的糖链分支结构 生物糖链对蛋白质构象、分子识别、细胞增殖和分化等过程具有重要影响,因而糖链分支结构的准确鉴定对于功能糖组学具有重要的意义。多级质谱技术可以对糖链碎片进行多级断裂,反映出碎片的不同层次的结构信息,因此成为糖链结构鉴定的一项... 黄纯翠 孙世伟 王耀君 刘亚名 周巾煜 杨飞 高枫 陈润生 柴文刚 卜东波 李岩关键词:糖链结构 自动化 高通量 文献传递