宋灿磊 作品数:62 被引量:338 H指数:9 供职机构: 上海市金山区疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 上海市卫生局青年科研基金 国家自然科学基金 广州市医药卫生科技项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 建筑科学 生物学 更多>>
诺如病毒重组的研究进展 被引量:5 2010年 戴迎春 宋灿磊 张绪富 聂军关键词:病毒重组 诺瓦克样病毒 人类杯状病毒 诺如病毒 札如病毒 NOV 金山区某学校一起诺如病毒感染性腹泻疫情流行病学调查 被引量:21 2017年 目的分析一起学校诺如病毒感染性腹泻疫情流行病学特征及其感染病毒基因型别,探讨可能传播途径,为有效控制疫情提供科学依据,同时为类似疫情现场处置提供经验。方法制定统一病例定义,在全校学生及教职员工中开展主动病例搜索,采用描述性流行病学和回顾性队列研究进行分析;采集未经治疗发病学生呕吐物、粪便或肛拭子,食堂员工及食堂环境样本,发病班级饮用水及环境拭子,运用实时荧光RT-PCR进行诺如病毒核酸检测,阳性样本进行RTPCR,PCR产物纯化、测序,序列经核酸比对确认,应用Clustal X、MEGA5.1等软件分析基因序列,构建系统进化树;采用Excel2010软件建立数据库,Open Epi3.03在线软件进行统计学分析。结果 2014年11月18-24日,该校共报告病例36例,19日为发病高峰(19例)。病例集中分布在二(3)班,罹患率为55.81%(24/43),其次为二(10)班,罹患率为14.29%(6/42);症状以呕吐为主(97.22%),发热(38.89%)、腹痛(36.11%)及腹泻(8.33%)。回归性队列研究显示参加舞蹈兴趣班为发病危险因素(RR=6.67,P<0.01)。经实时荧光RT-PCR检测,16份发病学生样本中诺如病毒核酸阳性6份。序列比对结果显示,Jinshan06、Jinshan09等6株基因同源性为100%,其与GII.P17_GII.17/Kawasaki323、GII.17/Okinawa/FP027/2012等株基因同源性高达98%,均属GⅡ.17型诺如病毒,指示病毒同源。结论本次疫情是一起因密切接触引起GⅡ.17型诺如病毒感染性腹泻疫情。 宋灿磊 刘天 杜荐如 朱建明关键词:诺如病毒 急性胃肠炎 流行病学 上海市某幼儿园一起札如病毒引发的胃肠炎疫情流行分析 被引量:10 2021年 [目的]分析一起札如病毒性胃肠炎疫情的流行病学特征及其感染病毒基因型别,为制订有效控制策略提供科学依据。[方法]制定统一病例定义,开展主动病例搜索,采用描述性流行病学对该起疫情进行分析。采集未经治疗发病幼儿粪便或肛拭子、带班老师、食堂员工及食堂环境样本、发病班级环境样本,运用实时荧光聚合酶链反应(RT-PCR)检测诺如病毒及札如病毒核酸。采用常规逆转录RT-PCR扩增部分札如病毒衣壳蛋白基因区,应用MEGA7.0等软件分析基因序列,构建系统进化树。[结果]本次疫情共报告12例病例,报告于同一个班级,病例均有呕吐症状,全班级罹患率为44.44%。疫情呈现点源性暴发,首发病例带病上课为传染源,疫情持续8 d。实时荧光RT-PCR检测证实5份患儿粪便札如病毒核酸阳性,首发患儿粪便札如病毒及GⅡ型诺如病毒核酸阳性。序列比对结果显示,扎如病毒基因序列均属于GI.1型,基因同源。[结论]根据病例临床表现、现场流行病学调查及实验室检测结果,确认本起疫情因首发病例带病上课,由GI.1型札如病毒感染导致聚集性疫情,通过病例隔离及消毒等综合性措施可有效控制疫情。 朱琳 董兆鹏 杜荐如 莫平华 王唐 宋灿磊关键词:札如病毒 急性胃肠炎 流行病学 一种新型灭蚊膜对白纹伊蚊控制效果的研究 被引量:3 2020年 目的探讨新型灭蚊膜对白纹伊蚊幼虫和蛹的控制效果,评价其对蚊虫生长发育的影响及致死活性。方法2019年7-9月在实验室内采用幼虫浸渍法,将30只白纹伊蚊幼虫或蛹分别放置于含有不同蚊幼杀虫剂的搪瓷盆中,观察并记录幼虫或蛹的死亡时间、化蛹或羽化情况;利用SPSS 18.0软件计算半数致死时间(LT50)及95%可信区间(CI)、建立毒力回归方程,并进行统计学分析。结果新型灭蚊膜组和双硫磷组白纹伊蚊蚊蛹的24 h死亡率分别为100%和2.22%,两组间差异有统计学意义(χ2=172.174,P<0.001),双硫磷组未死亡的蛹均羽化为成蚊。球形芽孢杆菌组、苏云金芽孢杆菌以色列亚种组、双硫磷组幼虫的24 h死亡率均为100%;1 h观察1次生物膜组和5 h观察1次生物膜组幼虫的24 h死亡率分别为55.56%和60.00%,两组间差异无统计学意义(χ2=0.364,P>0.05),所有未死亡的幼虫均未化蛹。新型灭蚊膜对高龄组和低龄组幼虫的24 h死亡率分别为90.00%和18.89%,两组差异有统计学意义(χ2=91.747,P<0.001)。结论新型灭蚊膜对白纹伊蚊幼虫及蛹均有较好的控制效果,可用于蚊虫防控。 王唐 宋灿磊 许峰 董兆鹏 刘洪霞关键词:白纹伊蚊 金山区首起G1.5型诺如病毒感染疫情的确认及其现场流行病学调查分析 目的:分析一起学校诺如病毒感染性腹泻疫情流行病学特征及其感染病毒基因型别,探讨可能传播途径,为制定有效控制策略提供科学依据.
方法:制定统一病例定义,开展主动病例搜索,采用描述性流行病学和回顾性队列研究进行分析... 宋灿磊 王新科 王唐 臧浩 莫平华 朱建明关键词:儿童患者 感染性腹泻 诺如病毒 流行病学 江门某医院儿童急性腹泻患者诺如病毒的检测与毒株型别分析 目的:
1.研究江门地区某医院儿童病毒性腹泻患者中诺如病毒(norovirus,NoV)感染基因型别,探讨流行的优势毒株,
2.疑似NoV重组株的重组鉴定及其重组区域的初步分析,探求可能的重组信息。
方... 宋灿磊关键词:诺如病毒 衣壳 开放阅读框架 文献传递 金山区2010-2017年3月诺如病毒感染聚集性疫情流行病学特征分析 目的:分析2010-2017年3月金山区确认或疑似诺如病毒感染聚集性疫情及其流行病学特征.
方法:统计分析2010年1月至2017年3月金山区报告的确认或疑似诺如病毒聚集性疫情的调查报告.
结果:共报... 高霞 宋灿磊 王新科关键词:诺如病毒感染 流行病学 免疫力 疫情防控 新型GⅡ.4诺如病毒重组株感染疫情的分子流行病学研究 被引量:8 2013年 目的 分析老年护理院诺如病毒(norovirus,NoV)胃肠炎疫情流行病学特征及其所感染病毒的基因型别.方法 2013年1月29日,上海市金山区某老年护理院发生了一起由NoV感染引起的急性胃肠炎疫情,以26例患者作为研究对象,对其进行个案调查.采用单纯随机抽样方法,抽取未经治疗的9例患者,采集其粪便或肛拭子样本9份,再从中抽取4例患者,采集其病房门把手表面涂抹样本或马桶坐垫表面涂抹样本4份.运用荧光RT-PCR对样本进行NoV核酸检测,对核酸检测阳性的样本进行常规RT-PCR,对PCR产物进行纯化回收及测序,测序序列经核酸比对确认,应用Clustal X、MEGA 5.1等软件分析基因序列,构建系统进化树.结果 在26例患者中,男性7例,女性19例.经荧光RT-PCR检测的13份样本中,NoV核酸阳性8份.序列比对分析结果显示,获得测序信号的Jinshan08、Jinshan12分离株间核苷酸序列同源性为100% 进化树分析结果显示,在RdRp区,Jinshan08 、Jinshan12分离株与GⅡ.e/NV2634/BCN/Spain/2008株等在进化树的同一分支上,可信度为99%,在Capsid的N/S区,2分离株与Lordsdal株等在进化树的同一分支上,可信度为97%.结论 本次疫情是由新GⅡ.4型NoV重组株感染引起的急性胃肠炎暴发疫情. 宋灿磊 袁佳春 曹志城 李澜 钟海明 朱建明 高霞关键词:诺罗病毒 胃肠炎 基因 2017年上海市金山区柯萨奇病毒A组6型VP1基因系统发育分析 目的 分析金山区2017年三起手足口病聚集性疫情中分离到的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)VP1基因特征.方法 对金山区2017年采集到引起手足口病聚集性疫情的4株CV-A6毒株进行VP1全长基因扩增和序列测定,进而应用... 董兆鹏 孙箐爽 臧浩 王唐 蔡光 李淑华 宋灿磊关键词:系统发育分析 同源性分析 基于GoPubMed对诺如病毒研究文献计量学分析 被引量:1 2017年 目的探究诺如病毒研究的现况及发展趋势,从而为相关研究提供参考依据。方法以诺如病毒文献为研究对象,以Go Pub Med为检索与统计工具,对诺如病毒研究的主题、时间、来源、分布、作者和文献数量发展趋势进行信息分析。结果共检索到4 890篇文献,文献数量呈逐年上升趋势;其中来源于美国的文献数量和影响力居首位,发文总数655篇,日本发文量排第2名(185篇),中国发文量排第3名(165篇);文献发文量前10名中美国所占城市最多(5个),以亚特兰大最多(76篇),东京和伦敦位居第2、3位(57篇和46篇),北京位居第4位(40篇);诺如病毒英文文献主要收录于国外核心期刊,其中Journal of Virology杂志发文总数居首(76篇);核心著者及合作者检索结果显示诺如病毒的研究由多个合作团队完成。高频主题词共有20个,反映了诺如病毒研究的热点。结论 Go Pub Med是一种优秀的集检索与统计功能于一体的文献检索工具;揭示了诺如病毒研究的现状和发展趋势;我国诺如病毒研究文献在数量和质量上均有待提高。 宋灿磊 王新科 李淑华 高霞关键词:诺如病毒 GOPUBMED 文献计量分析