贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
- 作品数:301 被引量:682H指数:11
- 相关作者:宋桃伟惠嫣婷杨勇张许赵顺林更多>>
- 相关机构:江西农业大学动物科学技术学院大连海洋大学水产与生命学院华中农业大学水产学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金贵州省科技计划项目贵州省农业科技攻关项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生文化科学更多>>
- 兴义鸭MEF2C基因启动子区序列克隆与分析被引量:1
- 2019年
- 为研究MEF2C基因启动子区SNPs对屠宰性状的影响,本实验运用直接测序法筛选兴义鸭MEF2C基因启动子区的SNP位点,并分析其与屠宰性状的相关性。结果表明:在兴义鸭MEF2C基因启动子上存在8个SNPs位点,分别为T-190A、A-232G、A-285G、A-617T、G-1420A、A-1437C、T-1504G、A-1524G;生物信息学分析发现T-190A、A-232G、G-1420A突变位点周围HOXA4、GCN4、Pit-1a、IRF-1等重要转录因子结合位点消失,继而生成Oct-1、ICSBP 2个新的转录因子结合位点;关联分析结果表明,T-190A不同基因型个体的兴义鸭活重存在显著差异,G-1420A不同基因型个体的兴义鸭腿肌率具有显著差异。由此推断,T-190A、G-1420A位点可能对调控兴义鸭MEF2C基因启动子区功能元件有重要影响,且2个多态性位点可能为影响兴义鸭屠宰性状的重要功能性SNP。本研究结果将为进一步确定MEF2C基因功能提供试验基础。
- 杨华婷李辉李兴才赵忠海师新彩
- 关键词:启动子SNP屠宰性状生物信息学
- 香炉山鸡线粒体DNA D-Loop区遗传多样性及系统进化研究被引量:6
- 2019年
- 试验旨在研究香炉山鸡的遗传多样性与系统进化。利用PCR扩增结合双向测序的方法对121只香炉山鸡线粒体DNA D-Loop(mtDNA D-Loop)区全长序列进行分析,并对mtDNA D-Loop区全长序列组成、变异与母系起源进行探讨。结果发现,香炉山鸡mtDNA D-Loop区全长序列为1 231~1 233 bp,A、T、C、G碱基含量分别为26.62%、33.55%、26.49%、13.34%,表现出T碱基含量最高,G碱基含量最低,A+T含量明显高于G+C含量,说明此区可能具有一定的碱基嗜好性;121条全长序列经分析发现共存在11种单倍型,26个变异位点,其中单一多态信息位点2个,简约信息位点24个,另外存在4处碱基插入与2处碱基缺失。遗传多样性分析发现,单倍型多样度为0.814,核苷酸多样度为0.00447,平均核酸差异数为5.494,表明香炉山鸡遗传多样性比较丰富,保种效果较好,具有一定的选育空间。经Tajima Test检测发现,Tajima’s D值为0.39378,检验结果不显著(P>0.10),符合中性突变。聚类分析结果显示,香炉山鸡与红色原鸡聚为一支,说明香炉山鸡起源于红色原鸡;在分支内部又有4个分支,说明香炉山鸡存在多个母系起源。研究结果可为香炉山鸡种质资源保护与开发利用提供一定的参考数据。
- 李兴才潘成勇李辉李辉陈林肖涛
- 关键词:线粒体DNA
- 威宁黄牛SOCS4基因多态性及其与生长性状的关联分析被引量:3
- 2015年
- 【目的】了解威宁黄牛SOCS4基因多态性及其与生长性状的关联性,为深入研究SOCS4基因遗传效应及其功能和调控机制奠定基础。【方法】随机抽取106头威宁黄牛,采集血样后提取总DNA,利用PCR-SSCP检测SNP位点及基因型,并分析SOCS4基因SNP位点与不同个体生长性状的相关性。【结果】在SOCS4基因中共发现两个SNP位点,分别是第1内含子的T+435C和3'UTR的G+13700C,均有3种基因型。在威宁黄牛群体中,T+435C位点是以T为优势等位基因,G+13700C位点则以C为优势等位基因,但只有T+435C位点与威宁黄牛的生长性状存在显著关联(P<0.05,下同),且在公牛和母牛中呈不同关联性特征。在公牛中,T+435C位点与胸围显著相关,TT型个体胸围均值显著高于CC型个体;而在母牛中,T+435C位点与管围、胸深、腰高和坐骨端宽等生长性状显著关联,且均以CC型个体值高于其他基因型个体。【结论】威宁黄牛SOCS4基因多态性不丰富,且只有内含子区的T+435C位点与其生长性状存在明显关联,即T+435C位点可作为威宁黄牛生长性能的辅助选择分子标记。
- 杨忠诚龚俞杨永强刘若余
- 关键词:威宁黄牛SNP位点生长性状
- 超表达SRD5A2基因对山羊卵巢颗粒细胞增殖和产羔相关基因表达的影响
- 2021年
- 旨在探究类固醇5α还原酶2(SRD5A2)基因对卵巢颗粒细胞增殖和山羊产羔性状相关基因表达的影响。选取健康黔北麻羊母羊6只,采集卵巢组织进行卵巢颗粒细胞培养及提取组织中的总RNA反转录为cDNA,克隆黔北麻羊SRD5A2基因CDS区全长序列,进一步构建SRD5A2基因真核表达载体,转染至卵巢颗粒细胞。采用免疫荧光法鉴定培养细胞为卵巢颗粒细胞,CCK-8法检测细胞增殖情况,RT-qPCR检测SRD5A2、BMP15、GDF9、BMPR-1B和FSHB的mRNA表达水平。CCK-8结果发现,超表达SRD5A2基因在6,12,24 h显著促进细胞增殖(P<0.05),48 h达到极显著促进作用(P<0.01);RT-qPCR结果显示,转染试验组SRD5A2基因mRNA表达水平极显著高于空白组(P<0.01),产羔性状相关GDF9基因mRNA表达水平显著高于空白对照组(P<0.05),BMPR-1B、BMP15、FSHB基因mRNA表达水平极显著高于空白对照组(P<0.01)。推测超表达SRD5A2基因可促进产羔相关基因BMPR-1B、BMP15、GDF9、FSHB在卵巢颗粒细胞表达。本研究成功克隆黔北麻羊SRD5A2基因编码区,构建pEGFP-N3-SRD5A2真核表达载体,并成功在卵巢颗粒细胞中表达,检测SRD5A2基因对黔北麻羊卵巢颗粒细胞增殖及产羔性状相关基因表达的影响,为进一步研究SRD5A2基因对黔北麻羊产羔性状影响提供基础。
- 洪磊陈祥唐文周志楠
- 关键词:黔北麻羊卵巢颗粒细胞细胞增殖产羔性状
- 日粮中添加菜粕对安格斯母牛繁殖性能的影响
- 2023年
- 选择体况良好、无生殖系统疾病的成年且体重相近的经产空怀母牛20头,随机分成2组,每组10头,对照组不添加菜粕,试验组在日粮中添加10%菜粕。整个试验分3个阶段饲养,第一阶段包括空怀和妊娠前期,第二阶段妊娠中期和后期,第三阶段泌乳期,每个阶段过渡期15d,整个饲养期13个月。结果显示:试验组安格斯母牛妊娠率和产犊率均比对照组低10%,试验组犊牛发病率比对照组高12.5%;试验组犊母牛初生体重和1月龄犊母牛、犊公牛体重以及2月龄犊公牛体重均显著低于对照组(P<0.05),其他体尺各指标各组间差异未达到显著水平(P>0.05),表明日粮中添加菜粕饲喂安格斯母牛对犊牛体重有不利影响而对其体尺的影响不明显;此外,试验组的产后第一次发情时间、第一次配种天数和产后配种妊娠天数均显著低于对照组(P<0.05),表明日粮中添加菜粕推延了安格斯母牛发情配种时间。结果表明:安格斯母牛妊娠中后期和哺乳期日粮中添加菜粕可影响其健康状况,推延产后发情配种和妊娠时间,且不利于公、母犊牛1、2月龄体重。
- 吴燕邹茂华罗清云王春梅张依裕
- 关键词:菜粕繁殖性能
- 猪不同颜色皮肤组织中MLANA mRNA的表达分析
- 2023年
- 为了解MLANA mRNA在猪黑、白色皮肤中的表达差异,提取剑白香猪黑、白色皮肤组织的RNA,分别逆转录合成MLANA cDNA,以RPS18基因作为内参,采用实时荧光定量PCR检测MLANA mRNA在皮肤组织中的相对表达量。结果:MLANA mRNA在黑色皮肤中的表达量比白色皮肤高,差异极显著(P<0.01),推测MLANA基因与猪黑色皮肤的形成有关。
- 袁茂莎陈伟陈伟石婷婷蒙泽飞
- 关键词:皮肤组织
- 威宁黄牛STAM1基因SNPs及其与生长性状关联研究
- 2014年
- 为研究STAM1基因多态性与贵州地方黄牛品种威宁黄牛生长性状关联性,选择106头威宁黄牛为对象,利用PCR-SSCP、DNA测序方法分析STAM1基因SNP与不同个体生长性状的相关性。结果表明:在STAM1基因第3内含子区存在1个SNP位点,命名为G+31122A。G+31122A位点在威宁黄牛中有不同分型,在威宁黄牛公畜中,G+31122A位点与胸围、坐骨端宽极显著相关,AA型个体胸围均值极显著低于GA型和GG型个体。而在母畜中,该位点对体直长的影响达到显著性水平,GG型个体体直长均值显著高于AA型个体。说明G+31122A突变与威宁黄牛生长性状有一定关联。
- 龚俞杨忠诚杨永强刘若余
- 关键词:SNP外显子内含子威宁黄牛
- 贵州黄鸡体尺、屠宰性能、肉品质测定及相关分析被引量:18
- 2021年
- 为了探究贵州黄鸡的体尺、屠宰性能、肉品质与营养成分及其相关性,随机选择120日龄贵州黄鸡(公母各15羽)进行体尺、屠宰性能、肉品质测定。结果表明,平均活质量为(1811.24±340.84)g,平均屠体质量为(1540.28±307.73)g,平均半净膛质量为(1399.59±300.20)g,平均全净膛质量为(1100.83±231.50)g,平均胸肌质量为(212.14±49.94)g,平均腿肌质量为(282.35±83.74)g。在贵州黄鸡体尺指标中,体斜长、龙骨长、胸深、髋骨宽、胫长与胸宽之间相关性不显著(P>0.05),胸深、胫围与髋骨宽之间相关性不显著(P>0.05),大部分体尺指标间都存在极显著(P<0.01)或显著性(P<0.05)正相关,并且大部分相关系数达到0.5以上,屠宰性能指标间存在极显著正相关性(P<0.01)。在体尺指标与屠宰性能指标之间,除胸肌质量与胸宽、腿肌质量与髋骨宽之间相关性不显著(P>0.05)外,其他指标间均呈极显著(P<0.01)或显著性(P<0.05)正相关。
- 李维牟腾慧饶永超杨德凤龙广丽林家栋林家栋张福平
- 关键词:贵州黄鸡体尺指标屠宰性能肉品质营养成分
- 山羊GHRH-R基因SNPs的快速筛查及基因频率估算被引量:3
- 2011年
- 为进一步开展山羊GHRH-R基因的表达调控、分子标记辅助育种及比较基因组学等的研究,采用构建DNA池并用直接测序的方法,研究了黔北麻羊、内蒙古绒山羊和关东奶山羊3个山羊品种GH-RH-R基因的多态性,并估算其等位基因频率。结果表明:在黔北麻羊GHRH-R基因中发现2个SNPs(T-640-C,G-811-T),第8内含子640bp、811bp处分别发生了T→C、C→T碱基转换;等位基因频率T-640为0.500,C-640为0.500,C-811为0.387,T-811为0.613;关中奶山羊和内蒙古白绒山羊在640bp、811bp处没有发生碱基突变。
- 陈志刘若余罗卫星蔡惠芬李敬瑞
- 关键词:SNPS基因频率
- 山羊TGFB3基因的多态性及生物学信息分析被引量:2
- 2011年
- 为了解山羊TGFB3基因的多态性,并为优秀山羊品种的选育提供理论依据,选择牛TGFB3基因组序列(NM_001101183)设计1对特异性引物,采用DNA池PCR直接测序法快速检测黔北麻羊、内蒙古白绒山羊和关中奶山羊3个山羊品种的TGFB3基因的多态性。结果表明,只在黔北麻羊TGFB3基因第1外显子212bp处发现1个多态性(SNP)位点(G-212-A)。利用生物信息学分析TGFB3基因5’侧翼调控序列,转录因子结合位点96分以上的有28个(CdxA有2个,HSF有18个,ADR1有2个,AML1a有1个,GCR11有3个,cap有1个,RY有1个),在TGFB3基因5’调控区没有发现CpG island。
- 蔡惠芬陈志罗卫星刘若余张依裕李敬瑞
- 关键词:山羊多态性