国家自然科学基金(30660024)
- 作品数：57 被引量：303H指数：11
- 相关作者：苗永旺袁峰霍金龙刘丽仙钱林东更多>>
- 相关机构：云南农业大学云南大学云南农业职业技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学更多>>
- 动物溶菌酶基因的研究进展被引量：6
- 2012年
- 溶菌酶[Lysozyme(EC3.2.1.17),LYZ]是机体先天免疫系统中一个重要的效应分子,参与机体多种免疫反应,在溶菌过程中形成一个水解体系,破坏和消除侵入动物体内的病原,从而实现机体的免疫防御。它可以有效抑制葡萄球菌、大肠杆菌等一系列病原菌,是重要的奶牛乳房炎抗性因子之一。本文综述了溶菌酶基因的研究进展,包括其结构与进化、变异及应用前景等。
- 孙国庆哈福苗永旺李大林
- 关键词：溶菌酶基因多态性乳房炎
- 水牛、大额牛和牦牛抑制素α亚基编码基因外显子1多态性分析
- 2012年
- 为了揭示牛科物种INHA基因的遗传特征,该文采用PCR产物直接测序法对水牛、大额牛和牦牛INHA基因外显子1及其侧翼序列进行多态性检测,并结合已发表的包括牛科物种在内的一些哺乳动物数据进行了比较分析。结果表明,在水牛INHA基因外显子1中存在c.73C>A替换,为同义替换,河流型和沼泽型水牛编码产物一致;在大额牛的INHA基因外显子1中发现c.62C>T、c.187G>A替换,分别引起INHA中氨基酸发生p.P21L、p.V63M改变,两者均为相同性质氨基酸的替换;在牦牛中发现c.62C>T、c.129A>G替换,前者也引起编码氨基酸发生p.P21L替换,后者为同义替换。在INHA基因5'侧翼区所测出的序列中,水牛、大额牛和牦牛等物种内均未发现SNP位点,但在种间发现存在c.-6T>G的替换,大额牛、牦牛和普通牛均为c.-6G,而水牛为c.-6T。在INHA基因内含子中,水牛的第31～36位核苷酸处发现有6个碱基的缺失,即c.262+31_262+36delTCTGAC;该位点在河流型水牛中野生型(+/+)占主体,而在沼泽型水牛中则缺失型(-/-)占主体。在大额牛、牦牛和普通牛等其它牛科物种的内含子中均未发现该缺失,但与水牛相比,大额牛、牦牛和普通牛内含子中发现缺失c.262+78_262+79delTG。序列比对显示,INHA基因外显子1序列中c.43A和c.67G为水牛中所特有,而c.173A和c.255G为大额牛、牦牛和普通牛所共有,c.24C、c.47G、c.174T和c.206T为山羊所特有。大额牛、牦牛和普通牛间INHA基因外显子1序列差异较小,而山羊和水牛与它们间的差异相对较大。
- 苗永旺哈福高华山袁峰李大林袁跃云
- 关键词：水牛大额牛牦牛多态性
- 利用微卫星标记分析迪庆黄牛的遗传多样性
- 2009年
- 采用分布在黄牛基因组15条染色体上的15个微卫星标记对迪庆黄牛60个样品进行了群体遗传变异检测分析。共检测到63个等位基因,每个座位的等位基因数从2～6不等,有效等位基因数在2.0000～4.0000之间,平均每个座位等位基因数（4.2000±0.8619）个,有效等位基因数（3.5529±0.5312）个,群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0.9958±0.0161,0.7098±0.0637和0.6573±0.0851。结果表明,迪庆黄牛群体遗传变异丰富。
- 田应华钱林东凌军霍金龙祁宏刘丽仙苗永旺
- 关键词：微卫星标记杂合度多态信息含量
- 水牛κ-酪蛋白基因(CSN3)外显子4序列多态性研究被引量：3
- 2012年
- 分别设计位于CSN3 5个外显子旁侧引物,采用DNA测序法对沼泽型和河流型水牛CSN3编码区结构进行了分析,并对10个水牛群体共106个样本CSN3第4外显子序列进行了变异检测。结果表明,两类水牛CSN3编码区由848个核苷酸组成,包括ORF序列573bp、5′-UTR序列69bp和3′-UTR序列206bp。在水牛CSN3第4外显子中共检测到4个SNP,其中c.445G>A,c.467C>T和c.516A>C为异义替换,导致相应的κ-CN成熟肽中氨基酸发生p.Val128Ile、p.Thr135Ile和p.Glu151Asp改变,c.467C>T和c.516A>C替换可能对κ-CN功能产生了影响。群体遗传分析表明,在河流型水牛中,等位基因c.445G、c.467C、c.471C和c.516A均为优势等位基因,而在沼泽型水牛中,仅c.445G、c.467C和c.471C为优势等位基因,河流型和沼泽型水牛的遗传差异主要体现在SNP516位点的群体遗传组成上。
- 祁宏刘丽仙袁峰李大林袁跃云苗永旺
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛Κ-酪蛋白基因多态性
- 家养水牛催乳素基因编码区结构特征被引量：1
- 2012年
- 催乳素具有促进生长发育及维持泌乳、进行免疫调节等生物学功能,但目前家养水牛PRL基因的变异特征及其与水牛性状间的关系还不清楚。本研究采用PCR-SSCP及PCR产物直接测序技术,检测不同沼泽型和河流型水牛群体PRL基因各外显子的遗传变异,将各外显子序列进行拼接得到编码区序列,对其进行生物信息学分析,结果表明:水牛成熟催乳素含199个氨基酸残基,其编码蛋白呈酸性,碱基使用率为A 25.96%,T 22.95%,C 28.14%,G22.95%,平均碱基组成差异较小,偏好性密码子占密码子使用总数的48.21%。在沼泽型水牛群体中检测到c.G192A、c.C427T和c.C606T共3种核苷酸替换,均为同义替换,产生8种单倍型,在河流型水牛群体中检测到c.C606T替换,为同义替换,产生2种单倍型,不同单倍型个体未产生表达差异。序列比对分析表明,水牛PRL基因编码区序列在进化过程中未受到人工选择的影响,可能是因为功能的约束使其编码区序列表现得十分保守。
- 袁峰苗永旺王绍卿李大林袁跃云
- 关键词：催乳素基因编码区PCR-SSCP
- 槟榔江水牛种质资源调查与评价被引量：32
- 2008年
- 槟榔江水牛是近年在我国发现的河流型水牛类群,主要分布于云南省腾冲县。该牛产奶量高,可以向奶用方向继续选育,是我国发展奶水牛业的宝贵遗传资源。为了更好地对其进行选育利用,本文对该水牛的品种形成历史及发展、产地分布及数量、生产性能和遗传基础等方面进行了深入调查和研究,以进一步揭示其种质特征。
- 屈在久李大林苗永旺沈雪鹰尹玉安艾有林
- 关键词：槟榔江水牛种质资源
- 雉鸡微卫星DNA标记筛选及孔雀绿雉鸡群体遗传变异分析被引量：2
- 2014年
- 利用33个家鸡微卫星DNA标记对孔雀绿雉鸡基因组DNA进行种间扩增,筛选可用于雉鸡群体分析的遗传标记.共筛选出能扩增出特异性条带的7对引物,具有较丰富的多态性,分别是MCW0294,MCW0285,MCW0328,MCW0134,MCW0330,MCW0097,LEI0075.利用这7个遗传标记对孔雀绿雉鸡选育的母本群体（P）——美国七彩山鸡及其F3和F8群体进行群体变异检测.结果表明：各基因座位的等位基因数为2～4个;P,F3和F8群体平均期望杂合度分别为0.52,0.59,0.53,平均多态信息含量分别为0.438 8,0.505 2,0.461 2;F8与P群体Nei氏遗传距离为0.015 8,与F3群体之间Nei氏遗传距离为0.123 4.结果显示孔雀绿雉鸡F8群体与美国七彩山鸡亲缘关系更近,血统较纯,说明选育有一定效果.
- 高姗姗付琳袁峰欧阳依娜唐正红普丽萍田应华钱林东赵跃李石友苗永旺
- 关键词：雉鸡微卫星DNA
- 槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析被引量：15
- 2007年
- 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值,以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况,研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析,从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增,结果15条引物共产生105种扩增片段,多态片段95条,平均每条引物的扩增带数为7,各引物多态性片段范围在2-12之间,多态频率在40%-100%之间,多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。
- 李大林霍金龙霍海龙苗永旺屈在久尹玉安
- 关键词：槟榔江水牛随机扩增多态DNA
- 牛科物种FSHβ基因外显子3编码区遗传多态性及其生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 促卵泡素是动物垂体前叶分泌的重要繁殖调控激素。采用PCR产物直接测序法对河流型和沼泽型水牛、牦牛和大额牛的FSHβ基因外显子3编码区进行群体变异检测,并进行了生物信息学分析。牛科物种FSHβ基因外显子3编码区均为231 bp。在水牛中共发现16个SNP位点,其中异义替换13个,推测4个异义替换对FSH功能有显著影响(subPSEC<-3)。沼泽型水牛中发现的SNP位点均与河流型水牛共享,但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同。在普通牛、牦牛和大额牛中分别确定8,3,1个SNP位点,但只有SNP307是异义替换,普通牛与牦牛共享该位点,推测其对FSH功能无显著影响(subPSEC>-3)。在山羊中有11个SNP位点,8个为异义替换,推测只有SNP253对FSH功能有显著影响(subPSEC<-3)。在绵羊中有3个SNP位点,皆为同义替换。确定水牛特有的核苷酸位点4个,山羊特有的位点1个,普通牛、牦牛和大额牛共有的核苷酸位点4个,山羊和绵羊中共有的位点2个,这些位点编码氨基酸的差异可能引起了不同类型牛科物种间FSHβ亚基功能上的差异性。
- 杨秋丽哈福李大林袁跃云袁峰霍金龙苗永旺
- 关键词：生物信息学分析
- 牛肌肉生长抑制素基因的研究进展
- 2011年
- 肌肉生长抑制素,属TGF-β超家族,是一种骨骼肌生长发育的负调控因子。其生物活性的丧失或受到抑制,会导致骨骼肌增生从而引起动物肌肉的过度发育,表现为双肌性状。本文综述了MSTN基因的发现、结构特点、作用机制、在牛科物种中的研究进展及其应用前景。
- 黎仁军苗永旺
- 关键词：肌肉生长抑制素骨骼肌
