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Ⅰ型人类免疫缺陷病毒整合酶及其抑制剂研究进展被引量：2: 2009年; 目的为研究新型Ⅰ型人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus type-1,HIV-1)整合酶抑制剂提供参考。方法根据查阅的文献从HIV-1整合酶的结构与功能、HIV-1整合酶的催化机制、HIV-1整合酶抑制剂对整合酶作用环节的影响等方面进行综述。结果HIV-1整合酶是由288个氨基酸残基组成的蛋白质,由病毒pol基因编码,相对分子质量约为32000;HIV-1整合酶抑制剂通过干扰整合酶的多聚化、竞争性结合病毒DNA长末端重复序列、阻断整合酶的"3′-加工"(切割病毒DNA)和"链转移"等影响整合酶的作用。结论利用先进的计算机辅助药物设计手段,通过对现有抑制剂构效关系以及抑制剂与大分子作用方式的研究可以逐步阐明整合酶抑制剂的作用机制;应着眼于寻找高活性的整合酶抑制剂,为治疗艾滋病提供新的途径。; 吴可柱李爱秀; 关键词：I型人类免疫缺陷病毒整合酶抑制剂

天然产物来源的抗HIV-1多靶点抑制剂研究进展被引量：6: 2015年; 在复杂疾病的治疗过程中,发现使用单靶点药物治疗越来越难得到预期的疗效。基于系统生物学和网络药理学的发展,对于复杂疾病的发病机制和病理过程的研究更加深入透彻,发现使用多靶点药物治疗复杂疾病能够克服单靶点药物的许多缺陷。多靶点药物包括多组分多靶点药物和单组分多靶点药物,而单组分多靶点药物较多组分多靶点药物更有优势。艾滋病的治疗是当今世界难题,先后采用单靶点药物和多组分多靶点联合用药(高效抗逆转录疗法)治疗艾滋病,但是由于病毒的高度变异性和药物严重的毒副作用制约了2种疗法的广泛应用,因此开发低毒、高效的单组分多靶点抗免疫缺陷病毒1型(HIV-1)药物成为治疗艾滋病的重要方向。抗HIV-1单组分多靶点药物主要通过合理药物设计合成或筛选得到,其中天然产物来源广泛,种类繁多,不乏抑制HIV-1的活性化合物,是发现抗HIV-1多靶点先导化合物的重要途径。对天然产物来源的具有多靶点抗HIV-1活性的化合物进行了综述。; 李凯李爱秀靳玉瑞罗力; 关键词：抗HIV-1 先导化合物艾滋病

Building the Pharmacophore Model of HIV-1 Integrase Strand Transfer Inhibitors and Studying Their Inhibition Mechanism被引量：4: 2010年; The replication of HIV-1 requires the integration of its cyclic DNA into host DNA by HIV-1 integrase （IN）, which includes two important reactions, 3＇-processing and strand transfer, both catalyzed by HIV-1 IN. Disrupting either of the reactions will fulfill the purpose of inhibiting the replication of HIV-1. In this paper, pharmacophore modeling and molecular docking are employed to investigate the inhibition mechanism of the HIV-1 IN strand transfer inhibitors （INSTIs）. Based on the results, we suggest that the inhibition mechanism of INSTIs involves the inhibitor chelating the cofactors Mg2＋ and its forming hydrogen bonds with some crucial residues adjacent to the DDE active center.; 吴可柱李爱秀刘兴太蔡德海马翼

影响1-羟基-2-氧-1,8-萘啶-3-甲酰胺类HIV整合酶链转移抑制剂抗整合酶链转移活性的主要因素被引量：1: 2022年; 目的探讨影响1-羟基-2-氧-1,8-萘啶-3-甲酰胺类HIV整合酶链转移抑制剂(integrase strand transfer inhibitors,INSTIs)抗整合酶链转移(integrase strand transfer,INST)活性的主要微观结构因素。方法采用遗传函数逼近法构建了10个1-羟基-2-氧-1,8-萘啶-3-甲酰胺类INSTIs的二维定量构效关系(2d-quantitative structure-activity relationship,2D-QSAR)模型,从中优选出最优模型,并据此探析影响抑制剂抗INST活性的主要微观结构因素。结果最优2D-QSAR模型的非交叉验证相关系数R^(2)为0.8555,留一法交叉验证相关系数Q^(2)_(loo)为0.7761,外部交互验证相关系数R^(2)_(e xt)为0.94,表明所建模型具有较好的统计学意义和稳定性。结论1-羟基-2-氧-1,8-萘啶-3-甲酰胺类INSTIs的抗INST活性主要与描述符JX、Dipole_mag、Jurs_PNS A_1和Strain_Energy相关,可为抑制剂的进一步合理设计提供理论依据。; 康家雄李爱秀靳玉瑞

基于2009甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶的分子对接研究被引量：1: 2014年; 神经氨酸酶(NA)是流感病毒复制过程中的关键酶,基于NA结构设计的抑制剂(NAI)已成为临床上最主要的抗流感病毒药物。由于2009甲型H1N1流感病毒NA(09N1)与以往NA亚型的三维结构不同,对09N1的深入研究可为新型NAI的设计打开思路。本文利用分子对接软件GOLD和Surflex-Dock对09N1-NAI复合物(09N1体系)进行对接研究,采用配体对接构象的RMSD值和KISS score值(复合物晶体结构中氢键作用的重现率)等两项指标评价分子对接效果,并进一步分析NAI与09N1之间的相互作用。结果:所有配体得分最高构象的RMSD值均小于2.0 A,且KISS score值均较高,在GOLD对接中,基于打分函数GoldScore的对接结果优于ChemScore.氢键作用、静电作用、疏水作用和范德华力在配体对接构象得分中均占一定比例。结论;GOLD和Surflex-Dock对09N1体系的分子对接均具有一定可靠性,在GOLD对接中宜选GoldScore作为打分函数;通过对接验证了氢键作用、静电作用和疏水作用在NAI与NA结合中的重要性,提出范德华力对分子间的相互作用也有重要贡献。; 靳玉瑞李爱秀邓联柏罗力李凯; 关键词：神经氨酸酶抑制剂分子对接相互作用

运用计算模拟技术揭示黄芩素抗HIV的新机制(英文)被引量：5: 2013年; 【目的】运用计算模拟技术,在分子水平揭示黄芩素抗HIV的新机制。【方法】基于药效团和分子对接等数据库搜索方法对抗HIV中药化学成分数据库进行虚拟筛选,得到潜在的抗HIV-1活性化合物;然后,利用分子对接技术得到抑制剂与靶蛋白的最佳结合模式,并从分子水平揭示其作用机制。【结果】虚拟筛选证实黄芩素是HIV-1逆转录酶和整合酶的抑制剂,分子对接显示其作用于HIV-1逆转录酶的核糖核酸酶H区域和整合酶的疏水区域。【结论】黄芩素是一个具有二价金属离子作用机制的、针对HIV-1核糖核酸酶H和整合酶的双重抑制剂。; 邓联柏李爱秀靳玉瑞刘兴太谢文利; 关键词：HIV-1 整合酶逆转录酶

新型抗HIV药物靶点核糖核酸酶H抑制剂的研究进展被引量：4: 2011年; 随着艾滋病感染人数和HIV耐药性突变的不断增加,对抗HIV新药需求越来越强烈。目前抗HIV新药研究主要分两方面进行,一方面是针对现有靶点开发新药,另一方面致力于寻找新的药物靶点。核糖核酸酶H是逆转录酶上具有自身独特酶功能的催化区域,成为抗HIV药物研究的一个新靶点。本文主要对近年来发现的核糖核酸酶H抑制剂进行总结,阐述其作用机制,为进一步深入开展核糖核酸酶H抑制剂的改造和设计提供一些信息。; 邓联柏李爱秀靳玉瑞; 关键词：逆转录酶抗HIV 化学合成植物提取物抑制剂

S-腺苷高半胱氨酸水解酶的晶体结构及其催化机制被引量：2: 2007年; AdoHcy水解酶是一重要的广谱抗病毒药物靶标,对其结构,特别是三维空间结构的研究,有助于深入了解和阐述其功能,并为实现基于靶标结构的药物设计和筛选奠定基础。该文介绍近年来有关AdoHcy水解酶晶体结构的研究成果。; 李爱秀刘兴太蔡德海; 关键词：晶体结构

虚拟筛选技术与新药开发被引量：6: 2011年; 计算机模拟与化学合成、生物测试的结合构成了后基因组时代新药研究的新策略。从已有的化合物，包括合成化合物和天然产物中寻找药物或先导化合物，是药物发现的一个重要途径[1]。; 吴可柱李昆李爱秀; 关键词：分子对接药效团定量构效关系

肌巨蛋白PEVK片段中模型分子EVPK的合成及结构测定: 2010年; 【目的】合成肌巨蛋白PEVK片段中模型四肽分子EVPK[Glu-Val-Pro-Lys],并测定其结构。【方法】采用Fmoc固相合成法合成四肽EVPK,利用电喷雾质谱法测定其分子量,并通过多级质谱和二维核磁共振谱,对该四肽分子进行序列和结构确认。【结果】分子量测定结果为471.4,与计算值471.3基本吻合;序列分析表明合成四肽的一级结构为Glu-Val-Pro-Lys,其在D2O/H2O溶液中Pro残基的构象以反式结构为主。【结论】成功合成了目标四肽化合物。; 李爱秀张欣董梅; 关键词：固相多肽合成

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国家自然科学基金(30472166)

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