搜索到163篇“ RT-PCR扩增“的相关文章
- 不同RT-PCR扩增试剂盒检测甲肝病毒效果评价
- 2020年
- 讨论评价ABI公司、天根公司和Roche公司扩增试剂盒用于检测食品中甲肝病毒结果的差异,为甲肝病毒扩增检测提供便捷、准确的技术参考。在食品样品中添加盔甲病毒作为病毒富集的过程质控,甲肝减毒疫苗作为阳性对照。根据一步法RT-PCR检测人工污染样品的Ct值对三种扩增试剂盒的扩增效率、特异性和灵敏度进行评价和数据分析。ABI公司扩增试剂盒扩增效率最高(EFF%:91.584),灵敏度最高(0.314CCID50/μL),三种扩增试剂盒均具有良好的特异性。采用盔甲病毒作为过程控制病毒进行食品中甲肝病毒的检测,为甲肝病毒的质量控制提供分析依据。ABI公司扩增试剂盒在总体性能上优于其他两个厂家,更适用于各级实验室甲肝病毒的日常检测工作,为一线检测工作提供最佳的扩增方案及质量控制措施。
- 齐欣曲世超田卓麻丽丹崔妍徐文英王煜
- 关键词:甲肝病毒
- 一种快速检测牛副流感病毒3型的RT-PCR扩增引物及其应用
- 本发明公开了一种快速检测牛副流感病毒3型的RT‑PCR扩增引物及其应用,属于动物细菌学及分子生物学领域。所述RT‑PCR扩增引物由具有SEQ ID NO:1 所示核苷酸序列的上游引物和具有SEQ ID NO:2 所示核苷...
- 彭昊李军吴翠兰冯世文潘艳陶立马春霞谢永平钟舒红胡帅杨威陈泽祥贺会利李常挺
- 文献传递
- 柑橘黄化脉明病毒基因组的长链RT-PCR扩增、克隆及序列分析被引量:3
- 2017年
- 为了建立柑橘黄化脉明病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)基因组长链RT-PCR扩增体系,构建其全长cDNA克隆,为深入了解CYVCV分子特性及其致病机理奠定基础。根据GenBank中CYVCV基因组序列和5′RACE扩增结果设计引物。以感染CYVCV的代代酸橙(Citrus aurantium‘Daidai’)植株总RNA为模板进行长链RT-PCR扩增,得到CYVCV全基因组cDNA,克隆至pGEM-Teasy载体,并进行序列测定与分析。结果显示,建立了一步扩增CYVCV全基因组的长链RT-PCR方法,扩增出约7.5 kb的目标片段;所获得的4个CYVCV全基因组cDNA序列与GenBank中已登录的相关毒株的核苷酸序列同源性为93%~99%。
- 崔甜甜王艳娇宾羽李中安周常勇宋震
- 关键词:全长CDNA
- 藏羊GM-CSF基因的RT-PCR扩增、序列分析及蛋白结构预测
- 2016年
- 为了研究藏羊GM-CSF基因及其编码蛋白的功能,提取藏羊脾脏总RNA,应用RT-PCR技术对藏羊GM-CSF基因进行扩增及测序,并利用DNA Star软件进行序列分析及编码蛋白结构预测。测试表明,藏羊GM-CSF基因长度为381 bp,编码127个氨基酸;藏羊GM-CSF基因与参考绵羊、藏羚羊、山羊和水牛的GM-CSF基因的核苷酸序列同源性依次为100%、99.2%、98.7%和92.1%,氨基酸序列同源性依次为100%、97.6%、96.9%和81.0%。蛋白结构预测表明GM-CSF蛋白具有1个N-糖基化位点、1个N-豆蔻酰化位点、1个粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子信号、2个蛋白激酶C磷酸化位点、3个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点;综合二、三级结构预测得出,该蛋白主要由α螺旋组成,其次是β转角和无规则卷曲,而β折叠相对较少。研究成果可为青海藏羊GM-CSF基因抗病功能的研究提供参考。
- 张晓芬冶贵生马玉花贺晓龙康明韩志辉贾跃宁张洪波
- 关键词:藏羊GM-CSF基因RT-PCR蛋白结构预测
- 甘蔗细胞色素P450还原酶基因的RT-PCR扩增与表达分析被引量:3
- 2016年
- 细胞色素P450基因在电子传递链、次生代谢物质合成和对外源化学药物毒性降解中发挥着重要作用,为了深入了解该基因在甘蔗中的功能,通过RT-PCR扩增获得甘蔗细胞色素P450还原酶基因的cDNA全长序列,命名为ScCPR450(Gen Bank Accession Number:KR864841).该基因全长999 bp,含有744 bp的完整开放阅读框,编码247个氨基酸.亚细胞定位结果显示,ScCPR450蛋白分布于细胞质中,与生物信息学预测结果相符.q RT-PCR表达分析表明,该基因在甘蔗中组成型表达,但有组织特异性,芽中表达量最高,其次是叶,而皮中表达量最低.在脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(Me JA)、聚乙二醇(PEG)和氯化铜(CuCl_2)胁迫诱导过程中,该基因的表达量呈现不同变化模式,其中SA胁迫6 h下,ScCPR450基因的表达量最高,约为对照的12.21倍;在PEG胁迫下,ScCPR450基因的表达量上调且表达量稳定,推测ScCPR450基因在甘蔗响应生物和非生物胁迫中发挥一定的作用.本研究可为该基因家族其它成员的克隆以及深入解析该基因的功能特性奠定基础,进而为基于基因工程技术对甘蔗品种进行定向改良提供基因资源.
- 苏炜华黄珑黄宁刘峰苏亚春肖新换凌辉阙友雄
- 关键词:甘蔗胁迫
- PRRSV的多重荧光定量RT-PCR扩增试剂
- 本发明公开了检测PRRSV多重荧光定量RT‑PCR方法及其应用。检测PRRSV荧光定量RT‑PCR引物和探针,引物包括AM‑PRRSV引物对和TJM‑PRRSV引物对,探针包括AM‑V‑PRRSV‑P探针、AM‑C‑PR...
- 施开创莫胜兰胡杰邹联斌张步娴屈素洁陆文俊粟艳琼苏凯李军
- 文献传递
- 藏羊DQB1基因RT-PCR扩增及序列分析被引量:1
- 2015年
- 提取藏羊脾脏总RNA,设计DQB1基因引物并进行反转录,扩增产物测序后利用生物软件进行序列分析。结果表明,藏羊DQB1基因长度为786 bp,编码261个氨基酸。藏羊DQB1基因与参考美利奴羊DQB1基因、中国美利奴细毛羊MHCⅡ抗原基因、山羊DQB1基因的核苷酸序列同源性依次为95.8%、95.9%、95.3%,氨基酸序列同源性依次为91.2%、92.0%、91.2%。
- 张晓芬冶贵生马玉花贺晓龙康明张爽韩志辉贾跃宁张洪波
- 关键词:藏羊DQB1基因RT-PCR
- 抗ORFV免疫球蛋白重链可变区基因序列的RT-PCR扩增及其多样性被引量:1
- 2014年
- 利用RT-PCR方法从羊传染性脓疱病毒(Orf virus,ORFV)感染绵羊脾脏总RNA中扩增获得免疫球蛋白(immunoglobulin,Ig)重链可变区cDNA克隆,随机挑选52个阳性克隆进行测序,获得49条完整的不重复序列。序列比对结果显示,49条序列的核苷酸同源性分别为84.3%(H7与H38)-100%(H5与H6)不等;绵羊IgH可变区V片段氨基酸聚类结果显示,克隆H1-H49的VH区段自动聚类为2个相对独立的单位。通过BLAST-N程序在GenBank数据库在线搜索,并结合其他参考序列进行比较分析,分析数据显示,D片段从9到46个碱基长度不等,无论是在核苷酸还是氨基酸序列上,其同源性均存在高度的变异性;结合其亲水性分布图可知,可变区的亲水性氨基酸主要分布在VH区域和D高变区,对照抗原指数图和表面可能性图,亲水性强的VH区域和D高变区易形成抗原决定簇。
- 包英夫宋德光贺文琦张希牧李吉达王改丽毕经影赵魁高丰
- 关键词:羊传染性脓疱病毒免疫球蛋白重链可变区
- 直接RT-PCR扩增法研究miR-223在儿童急性淋巴细胞白血病血浆中的异常表达被引量:2
- 2013年
- 本研究旨在探索miR-223在急性淋巴细胞白血病(ALL)患儿血浆中的表达情况及其在不同疾病状态下的表达特点。选取北京儿童医院2005年5月至2012年1月住院ALL患儿64例,包括初诊患儿30例,缓解患儿30例,复发患儿4例。直接使用血浆进行逆转录和实时荧光定量PCR的方法检测样本中miR-223的表达情况。结果发现,miR-223在初诊患儿血浆中表达较低,在缓解患儿中表达升高。由于复发例数太少,暂未发现差异性;在初诊或缓解患儿中,miR-223在TEL-AML1阳性组和无融合基因B系ALL组表达均无明显差异。结论:miR-223在初诊患儿血浆中表达较低,在缓解患儿中表达明显升高,可能起着抑癌基因的作用,并可作为白血病的分子标志物以及监测疗效的指标。
- 鲁晓静江倩黄鹏丽李刚张文娟赵晓曦郑胡镛
- 关键词:儿童急性淋巴细胞白血病实时荧光定量PCR
- 槭树叶片类黄酮糖基转移酶基因RT-PCR扩增体系优化被引量:1
- 2013年
- 以槭树"秋天火焰"变色期秋季叶片为试材,采用改良CTAB法提取叶片总RNA,利用GenBank中相关物种的UFGT基因序列设计特异引物,进行RT-PCR扩增并对RT-PCR反应体系中的引物、退火温度和循环次数进行优化,建立了槭树叶片UFGT基因的RT-PCR扩增反应体系。
- 尹燕雷苑兆和招雪晴冯立娟杨尚尚李云
- 关键词:槭树RT-PCR
相关作者
- 江国托

- 作品数:69被引量:389H指数:12
- 供职机构:大连工业大学生物与食品工程学院
- 研究主题:鸡传染性支气管炎病毒 传染性支气管炎 IBV 鸡病 病毒
- 龚丽明

- 作品数:30被引量:41H指数:4
- 供职机构:昆明市第一人民医院
- 研究主题:RT-PCR扩增 CK20 淋巴结微转移 甲状旁腺激素相关蛋白 巢式
- 王林川

- 作品数:187被引量:612H指数:13
- 供职机构:华南农业大学
- 研究主题:S1基因 鸡传染性支气管炎病毒 PCR 传染性支气管炎 RT-PCR
- 王伟利

- 作品数:152被引量:424H指数:11
- 供职机构:吉林农业大学动物科学技术学院
- 研究主题:禽流感病毒 血凝素基因 PCR NA基因 锦鲤疱疹病毒
- 林世杰

- 作品数:21被引量:52H指数:5
- 供职机构:云南省第二人民医院
- 研究主题:巢式 RT-PCR扩增 胆结石 CK20 结肠直肠肿瘤