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单分子实时测序在HLA基因分型中的应用初探: 2024年; 目的分析单分子实时(SMRT)测序技术判断HLA基因型、单体型的准确性,以探讨该方法应用于临床的可行性。方法留取19例需行肾移植的患者血液标本,提取DNA后利用SMRT测序技术检测样本基因序列,并利用PCR-SBT方法验证其准确性。结果 SMRT技术可鉴定出19例样本的HLA基因型和基因单体型,且结果与PCR-SBT方法相符。1和14号样本PCR-SBT方法的C位点结果存在模棱两可现象,结果为HLA-C*03:02/04;03:03/132,SMRT技术可直接区分,结果为HLA-C*03:02:02,03:03:01。另外,SMRT方法在1号样本的B位点发现新的HLA等位基因。结论 SMRT测序技术应用于HLA高分辨率分型具有高度准确性,在HLA单体型分析具有精准定位多个长间距突变位置的独特优势。; 储玉霜肖彦琳望喆冯青青李亭亭卞茂红; 关键词：HLA分型单体型分析

纳米孔基因测序技术在HLA基因分型中的应用: 2024年; 人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)基因是人类基因组中最复杂的基因区域,主要参与机体免疫反应,HLA的基因分型在器官移植以及疾病诊疗等领域有着广泛的临床应用。现有的HLA分型方法在临床实践中发挥了重要作用,但也存在一些技术限制和局限性。纳米孔基因测序技术的出现为快速鉴定HLA基因分型提供了全新视角。该技术以其快速、实时测序和长读长等特点,为复杂的HLA区域提供了更为快速精确的识别能力。该技术不仅能更快速地解析HLA基因型,还对前沿高通量基因测序新技术开发HLA分型方法的研究具有潜在的借鉴意义。本文主要对纳米孔基因测序技术在HLA分型领域中的研究方法和临床应用进行综述。; 朱孟琳何燕琴谢水莲杨影万绍贵; 关键词：人类白细胞抗原基因分型技术

基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在HLA基因分型中的评价研究: 2024年; 目的探讨基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9(TGS测序)在人类白细胞抗原(human leukocyte antigen, HLA)基因分型中应用的性能。方法选取北京市红十字血液中心实验室常规HLA分型检测样本48份,采用PCR-SBT和TGS两种测序法分别对全部样本进行HLA基因分型,比较两种方法的基因分型结果及性能。结果 TGS法和PCR-SBT法对48份样本的HLA-A、-B、-C、-DRB1和-DQB1的基因检测结果,在高分辨水平上完全一致,TGS法可以对全部样本进行直接指定新基因及单一组合分型结果。TGS法在耗时、新基因判定、读长、机器维护、模棱两可结果和实时数据等性能方面优势更明显。结论与PCR-SBT测序技术相比,基于Nanopore平台的测序试剂QzTGS HLA MX9在指定HLA基因结果方面准确性更高、耗时更短。; 廉雪张丹温玉洁范成艳刘娜张荣芳王东梅; 关键词：人类白细胞抗原 PCR-SBT

同时检测TCR和HLA基因分型的方法及应用: 本发明涉及一种同时检测TCR和HLA基因分型的方法及应用，属于基因检测技术领域。该方法包括以下步骤：样品提取：取待测生物样本，提取其中DNA；PCR扩增：取上述DNA，同时加入TCR扩增引物和HLA扩增引物，对TCR目标...; 杨凡林莉娅张伟

NGS自动化平台在HLA基因分型的建立及应用: 2024年; 目的建立基于二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术对人类白细胞抗原(human leucocyte antigen,HLA)基因进行分型的自动化操作平台,并评估其在HLA常规检测中的应用。方法根据试剂盒操作说明编写相应的计算机程序,利用Hamilton Microlab STARlet全自动液体处理工作站联合96通道小型液体工作站、荧光化学发光分析仪等仪器,实现NGS技术对HLA基因分型过程中文库制备步骤的自动化操作。结果手工法和自动化平台获取的文库片段两者读长基本一致,浓度及质量均符合要求,测序结果一致;而自动化平台操作时间明显少于手工操作。结论建立的NGS自动化操作平台检测HLA基因分型方法可行,值得推广使用。; 何亿镇王芳董丽娜陈晨章伟; 关键词：人类白细胞抗原自动化平台

一种用于HLA基因分型的引物组、试剂盒及其应用: 本发明公开了一种用于HLA基因分型的引物组、试剂盒及其应用；所述引物组包括HLA基因扩增引物组，所述HLA基因扩增引物组包括HLA‑A引物组、HLA‑B引物组、HLA‑C引物组和/或HLA‑DRB1引物组。通过本发明方案...; 费云舟李超鹏吴春杨钟欧阳冬生李晓晖

HLA基因分型的方法、装置、存储介质及处理器: 本申请公开了一种HLA基因分型的方法、装置、存储介质及处理器。其中，HLA基因分型的方法包括：构建HLA基因型数据库，HLA基因型数据库包括与HLA‑A基因相关的假基因的DNA序列；将待测样本的测序数据与HLA基因型数据...; 郭现超宋小凤赵义陈维之杜波何骥

一种用于HLA基因分型的扩增引物组、试剂盒及方法: 本发明属于基因检测领域，具体涉及一种用于HLA基因分型的扩增引物组、试剂盒及方法，提供的HLA基因扩增引物组，包括如下引物组中至少一组引物组组成的混合物：所述引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑18所示；上述HL...; 蒋廷亚刘海涛刘枫王银锋

AllType^(TM) Fastplex^(TM) NGS试剂基于Ion Torrent S5平台进行HLA基因分型的评价: 2023年; 目的AllType^(TM)Fastplex^(TM)NGS试剂增加了HLA-Ⅱ类基因1号外显子序列分析,本文旨在评价该试剂基于Ion Torrent S5平台进行HLA基因分型的性能情况。方法利用AllType^(TM)Fastplex^(TM)NGS试剂检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1、-DPB1位点,使用TSV 2.0.0软件指定NGS法的HLA基因型。采用聚合酶链反应-序列分析法(PCR-SBT)复核部分标本进行质量控制。结果94份标本NGS法检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1、-DPB1位点,指定为单一组合分型结果为58份,占61.70%。结果分析中软件提示至少有一个等位基因报警的组合有432个,占76.60%。共有5个等位基因组合,报警存在外显子区域碱基错配,经PCR-SBT方法复核发现均为NGS软件错误的判定。随机抽取16份标本,NGS法和PCR-SBT方法检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1、-DPB1基因结果在高分辨水平上完全一致。增加HLA-Ⅱ类基因1号外显子序列,有效解决了DRB1*12:01:01/12:10、DRB1*15:02:01/15:140/15:149、DPB1*13:01/107:01组合的指定。结论AllType^(TM)Fastplex^(TM)NGS试剂增加分析HLA-Ⅱ类基因1号外显子,提升HLA分型指定能力。HLA基因型结果指定中应注意软件分析报警信息的处理,必要时采用其他方法进行验证,以保证分型结果准确性。; 何亿镇董丽娜王芳王炜章伟朱发明; 关键词：人类白细胞抗原

一种基于三代测序平台的HLA基因分型方法: 本发明公开了一种基于三代测序平台的HLA基因分型方法，包括以下步骤：(1)对需要分型的HLA基因进行PCR扩增；(2)PCR所得产物检测合格后，进行三代测序，获得原始数据；(3)将原始数据与参考基因序列进行长序列比对；(...; 郎娜金杰龚淳杨帆周家蓬汪德鹏; 文献传递

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