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基于GBS 测序对无芒雀麦资源群体的解析 2024年 GBS 测序技术,对采自不同区域的67份无芒雀麦种质资源亲缘关系和遗传结构进行分析。结果表明:1)无芒雀麦表型存在丰富的多样性,比较21个表型指标变异特征,变异系数为12.67%~54.17%。2)基于表型特征将67份材料可分为4个类群,类群Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ均为单一材料,分别为N06(新疆)、M09(内蒙古)和QG07(甘肃)。类群Ⅳ包含64份材料,各地区均有。基于SNP位点信息构建的系统发育进化树和主成分分析,将67份无芒雀麦种质资源分成4个类群:类群Ⅰ,N08,属于新疆北部山地;类群Ⅱ为5份亲缘关系密切的疆外区域种质;类群Ⅲ为39份与其他类群种质亲缘关系较远的材料组成;类群Ⅳ由22份新疆区域种质组成。两种方法对材料的划分具有相似性。3)根据GBS 测序序列,发现SNP的变异类型主要为碱基转换,且转换占比高于颠换,转换占76.02%,颠换占23.98%。4)基于不同材料SNP的分布特征,通过群体遗传结构分析将无芒雀麦材料划分为两个类群,类群Ⅰ主要来自于新疆,类群Ⅱ包含全国各地材料,67份材料存在群体结构。以上结果为无芒雀麦种质资源的鉴定评价、关联分析、系统分类及品种选育等奠定了基础。关键词：无芒雀麦 亲缘关系 表型性状 妊娠晚期阴道微生态改变与GBS 感染的关系探究 2024年 GBS )感染的关系。方法:选取2022年1月—2023年1月九江市妇幼保健院收治的疑似GBS 感染的妊娠晚期孕妇80例,将生殖道GBS 检测阳性的妊娠晚期孕妇40例纳入阳性组,另将生殖道GBS 检测阴性的妊娠晚期孕妇40例纳入阴性组。比较两组患者阴道微生态指标(功能学指标、阴道菌群密集度、阴道菌群多样性、阴道清洁度、Nugent评分),采用多因素logistic回归分析妊娠晚期GBS 感染与阴道微生态改变的相关性。结果:单因素分析结果显示,阳性组过氧化氢(H_(2)O_(2))、白细胞酯酶(LE)、唾液酸苷酶(SNA)、β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶(NAG)阳性率均高于阴性组,pH值、阴道清洁度、阴道菌群密集度、阴道菌群多样性异常率及BV诊断率均高于阴性组(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示,低H_(2)O_(2)、高LE、高pH值、阴道清洁度异常、高Nugent评分是GBS 感染的独立危险因素(P<0.05)。结论:阴道微生态改变与GBS 感染密切相关,临床应重视对妊娠晚期孕妇H_(2)O_(2)、LE、pH值、阴道清洁度及Nugent评分的评估,以便对GBS 感染进行早期诊断和干预。关键词：妊娠晚期 阴道微生态 B族链球菌 基于Super-GBS 简化基因组测序技术的柞蚕SNP位点挖掘 2024年 GBS 基因分型(super-genotyping-by-sequencing)技术开展柞蚕单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)位点挖掘研究,旨在开发性状关联SNP分子标记,为柞蚕种质资源评价鉴定、遗传图谱构建、QTL定位提供数据支撑。以白体色小白蚕为母本、黄体色H04为父本,获得BC1M群体(110个)、F1(3个)、P1(1个)、P2(1个)总计115个柞蚕材料,利用PstⅠ-HF/MspⅠ双酶切基因组构建Super-GBS 文库并测序,使用BWA软件将过滤后的序列数据比对到柞蚕参考基因组,采用GATK软件开发SNP标记,使用SnpEff软件注释SNP位点及R语言分析遗传结构。测序共产生序列数据量为106.39 Gb,过滤后的平均读长为0.89 Gb,Q30测序质量值平均为90.11%,比对率平均为98.48%。共得到有效SNP位点141100个,主要位于基因间隔区、内含子区、基因下游、上游,其中C/T、A/G变异类型最多,转换与颠换的比例为1.296187∶1。SNP位点变异主要为同义突变和错义突变,产生修饰(MODIFIER)影响。主成分与聚类分析将115个样品分为4组(P1、P2、F1、BC1M),反映了样品的遗传背景及亲缘关系,群体遗传分化指数FST在0.0003777~0.8272间,群体遗传距离DR分布在0.0004~1.7556,FST与DR均表现出明显的遗传背景上的聚类。结果表明,Super-GBS 技术能够获得大量柞蚕SNP位点信息,可用于SNP标记开发,且开发的SNP标记能够对115个样品的亲缘关系、体色演变进行解释,为今后柞蚕种质资源评价与鉴定、分子标记辅助育种工作奠定基础。关键词：柞蚕 基因组 SNP位点 基于GBS 测序的湘东黑山羊的亲缘关系及近交系数 被引量：1 2024年 GBS )对60只湘东黑山羊(9只公羊、51只母羊)进行基因组测序,获得湘东黑山羊染色体上的SNP数据和连续纯合子片段(ROH)数据。通过SNP数据进行基于G矩阵的基因组亲缘关系分析和NJ聚类分析,构建湘东黑山羊的群体家系结构,并通过ROH数据得到群体平均近交系数。结果表明,60只湘东黑山羊的平均测序深度为9.15X,与参考基因组比对率平均为99.59%;在SNP检测过程中,3只母羊不符合基因型数据质控标准,将其过滤后获得其他57只黑山羊29条染色体上153046个SNPs位点和1937个ROH片段;构建的湘东黑山羊8个家系,其中9只公羊和6只母羊被分为7个家系,另42只母羊被单独分类;基于ROH片段分析的湘东黑山羊群体中每个个体的近交系数均值为0.047,说明湘东黑山羊公羊在繁育过程中有较大的利用空间。关键词：湘东黑山羊 近交系数 亲缘关系 围产期孕妇GBS 感染情况及与不良妊娠结局及新生儿结局的相关性 2024年 GBS )感染情况及其与不良妊娠结局及新生儿结局的相关性。方法:选取2021年11月—2023年3月在郑州市妇幼保健院就诊的1590例孕36~42周的孕妇作为研究对象,检测并统计围产期孕妇的GBS 感染状况,并根据GBS 感染情况,将孕妇进行分组。采用logistic回归分析围产期孕妇感染GBS 的影响因素,比较两组孕妇的不良妊娠结局,对比两组的新生儿结局。结果:本研究的1590例围产期孕妇中,共有84例(5.28%)GBS 为阳性,1506例(94.72%)GBS 为阴性。阳性组及阴性组孕妇的平均年龄、平均孕周、平均产次等资料相比,差异无统计学意义(P>0.05);而两组孕妇的孕早期体质指数(BMI)、存在阴道炎、妊娠期糖耐量异常等资料相比,差异有统计学意义(t/χ^(2)=9.373、35.860、22.236,P<0.05)。logistic多因素回归分析结果显示,孕早期BMI、存在阴道炎、妊娠期糖耐量异常为影响围产期孕妇感染GBS 的独立危险因素(P<0.05)。阳性组孕妇发生胎膜早破、宫内感染、产褥感染、产后出血等的概率均明显高于阴性组,差异有统计学意义(χ^(2)=6.939、24.067、27.741、35.902,P<0.05)。阳性组发生胎儿宫内窘迫、早产、新生儿肺炎、脑膜炎、败血症、病理性黄疸等的概率均明显高于阴性组,差异有统计学意义(χ^(2)=5.434、52.989、9.394、17.940、17.940、7.354,P<0.05)。结论:围产期孕妇出现GBS 感染可明显增加不良妊娠结局的发生风险,因此,应对围产期孕妇开展GBS 常规筛查,以保障母婴安全。若孕妇感染GBS ,应尽早干预,以改善不良妊娠结局。关键词：围产期 B族链球菌 胎膜早破 胎儿宫内窘迫 生殖道GBS 感染对妊娠晚期妇女阴道微生态环境及免疫因子的影响 2024年 GBS )感染对阴道微生态环境及免疫因子的影响。方法收集2021年7月至2022年7月本院76例GBS 筛查阳性妊娠晚期妊娠妇女(GBS 阳性组),另选取同期GBS 筛查阴性的76例妊娠晚期妊娠妇女(对照组),比较2组阴道微生态情况、血清免疫炎症因子(IL-1β、IL-6)水平及妊娠结局;另根据阴道微生态评价结果将GBS 阳性组妊娠妇女进一步分为微生态失调组(n=56)和微生态正常组(n=20),比较2组妊娠结局。结果GBS 阳性组和对照组研究对象的阴道pH值、细菌性阴道病(BV)发生率、外阴阴道假丝酵母菌病(VVC)发生率、阴道菌群密集度、阴道菌群多样性及微生态失调发生率比较差异均有统计学意义(χ2=8.550、5.842、5.156、4.682、5.339、14.341,均P<0.05),2组研究对象滴虫性阴道炎发生率、阴道清洁度比较差异均无统计学意义(χ2=0.541、1.685,均P>0.05)。GBS 阳性组血清IL-1β、IL-6水平显著高于对照组(t=16.711、19.388,均P<0.05)。GBS 阳性组早产、产褥感染、胎儿窘迫及病理性黄疸发生率显著高于对照组(χ2=5.365、10.059、7.938、5.787,均P<0.05),2组研究对象胎膜早破、产后出血、新生儿窒息及新生儿肺炎发生率比较差异均无统计学意义(χ2=1.849、0.882、2.027、2.027,均P>0.05)。微生态失调组胎膜早破、胎儿窘迫发生率显著高于微生态正常组(χ2=4.113、4.113,均P<0.05),2组研究对象早产、产褥感染、产后出血、新生儿窒息、病理性黄疸和新生儿肺炎发生率比较差异均无统计学意义(χ2=2.805、1.281、0.384、0.734、0.880、0.734,均P>0.05)。结论妊娠晚期GBS 感染妊娠妇女易发生阴道微生态及炎症因子失调,增加不良妊娠结局发生风险。关键词：B族溶血性链球菌 妊娠晚期 阴道微生态 免疫炎症因子 基于ADMM-GBS 考虑故障影响的互联微电网多时间尺度优化调度 2024年 GBS )得到最优故障调度策略。通过算例分析验证了所提模型和调度策略的有效性。关键词：分布式调度 多时间尺度 新生儿GBS 感染所致化脓性脑膜炎中血清维生素D和炎性细胞因子的表达及意义 2024年 GBS )感染所致化脓性脑膜炎(purulent meningitis,PM)血清中维生素D、白细胞介素(interleukin,IL)-6、IL-10、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)和C反应蛋白(c-reactive protein,CRP)的表达水平,并探讨其临床价值。方法选取2017年5月至2020年5月在秦皇岛市第一医院出生的59例GBS 感染的PM新生儿纳入观察组,同期59例非GBS 感染的PM新生儿(晚发败血症)纳入对照组。检测所有受试者血清维生素D、CRP、IL-6、IL-10和TNF-α水平,并进行Pearson相关性分析;利用受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析血清维生素D和炎性细胞因子对新生儿GBS 感染所致PM的诊断价值。统计学方法采用t检验、χ^(2)检验和Pearson相关性分析。结果观察组与对照组孕产妇胎膜早破[47.5%(28/59)与5.1%(3/59),χ^(2)=27.345]、产时窒息[52.5%(31/59)与18.6%(11/59),χ^(2)=14.787]和产褥感染[(44.1%(26/59)与(22.0%(13/59)),χ^(2)=6.473]的发生率比较,观察组明显高于对照组(P<0.05)。观察组血清维生素D水平显著低于对照组[(13.3±2.1)μg/L与(21.1±5.0)μg/L,t=11.345],IL-6[(87.1±14.5)μg/L与(63.9±11.9)μg/L,t=9.507]、IL-10[(49.6±15.2)μg/L与(29.3±10.0)μg/L,t=8.596]、TNF-α[(76.8±19.0)μg/L与(50.0±10.8)μg/L,t=9.410]和CRP[(21.5±5.0)μg/L与(13.7±3.7)μg/L,t=9.702]水平显著高于对照组(P值均<0.05)。Pearson相关性分析结果显示,观察组血清维生素D水平分别与IL-6、IL-10、TNF-α和CRP水平呈负相关(r=-0.662、-0.644、-0.564、-0.643,P<0.05);血清维生素D、IL-6、IL-10、TNF-α和CRP单独诊断GBS 感染新生儿PM的曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.831(95%CI:0.757~0.904)、0.887(95%CI:0.830~0.944)、0.859(95%CI:0.793~0.925)、0.888(95%CI:0.821~0.955)、0.879(95%CI:0.820~0.938),5项联合检测的AUC为0.991(95%CI:0.978~1.000)。结论GBS 感染所致的PM新生儿血清中维生素D水平降低,炎性细胞因子水平增加,关键词：B族链球菌 新生儿化脓性脑膜炎 白细胞介素-10 基于GBS 简化基因组技术的蕲艾遗传多样性分析 2024年 GBS )的简化基因组技术对45份资源进行了单核苷酸多态性(SNP)位点挖掘,并利用SNP标记进行了主成分分析、系统发育分析、群体遗传结构分析和遗传变异分析。结果:共获得111.91 Gb数据,测序结果的Q20和Q30分别为96.39%和90.33%,平均GC含量为39.37%,clean reads与参考基因组的比对率为70.24%~98.97%,共获得22 399个Indel和170 539个SNP位点,其中第10对染色体上的变异位点最多;主成分分析、聚类分析和遗传多样性分析表明,45份资源可以被分为3个类群,类群Ⅰ包含的3份资源均来源于蕲春县,第Ⅱ类群资源均为野生种,类群Ⅲ包含31份种质,来源最为复杂;同时,这45份种质可分为3亚类,包含来源于3个祖先的遗传信息,说明不同种源的艾遗传组成比较复杂,尤其是来源于湖北省蕲春县的种质。结论:该研究可为蕲艾的新品种选育、特异性SNP标记的开发、艾的亲缘关系研究提供理论支撑。关键词：蕲艾 遗传多样性分析 妊娠晚期孕妇血清hs-CRP水平、GBS 感染对妊娠及新生儿结局的影响 2024年 GBS )感染与妊娠及新生儿结局的关系。方法:采用回顾性分析,将2022年1月至2022年10月在本院诊治的90例妊娠晚期孕妇作为研究对象,根据是否出现胎膜早破进行分组,即将出现胎膜早破的41例妊娠晚期孕妇设为观察组,将未出现胎膜早破的49例妊娠晚期孕妇设为对照组。于孕晚期未出现胎膜早破前检测血清hs-CRP水平,采集两组妊娠晚期孕妇生殖道分泌物进行细菌培养,检测GBS 感染情况、GBS 病原菌数量,并在新生儿娩出后采集鼻咽拭子标本检测GBS 阳性率。比较两组孕妇血清hs-CRP水平、GBS 感染情况预测胎膜早破的临床意义,并对比分析血清hs-CRP、GBS 感染对胎膜早破孕妇结局、新生儿结局的影响。结果:观察组血清hs-CRP阳性率、GBS 阳性率高于对照组(P<0.05);观察组Hs-CRP水平、GBS 病原菌数量高于对照组(P<0.05);联合血清hs-CRP水平、GBS 病原菌数量诊断胎膜早破灵敏度、特异度高于单一检测诊断价值;血清hs-CRP阳性者剖宫产率、早产率高于阴性者(P<0.05),GBS 感染阳性者的剖宫产率、宫内感染率、早产率、新生儿窒息率、新生儿宫内感染率高于阴性者(P<0.05)。结论:妊娠晚期孕妇生殖道GBS 感染可诱发胎膜早破,增加新生儿感染概率,且母婴围生不良结局发生风险较高。关键词：妊娠晚期 B族链球菌感染 新生儿感染
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