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高G-C含量突变型Foxo1转基因动物基因型鉴定PCR方法的建立被引量：2: 2017年; 为解决因目的基因G-C(鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对)含量过高导致的目的基因扩增困难,以及操作过程中多环节引起的DNA污染导致的假阳性问题.本研究以突变型Foxo1(Forkhead转录因子1)转基因小鼠作为对象,就高G-C含量转基因的PCR方法和多个环节避免DNA污染进行了探索,结果显示,实验中消除了PCR的假阴性和假阳性现象,得到了准确的突变型Foxo1转基因小鼠的基因型鉴定结果.; 张赟周国丽杨冉刘慧敏杨国庆; 关键词：基因型鉴定转基因小鼠

利用不同G+C含量细菌基因组评估细菌ncRNA基因预测工具被引量：1: 2014年; 【目的】为识别已完成全测序细菌基因组中的ncRNA基因,对3个常用ncRNA预测工具s RNAPredict、PORTRAIT和s RNAscanner进行评估。【方法】选择了细菌ncRNA数据库BSRD收录的含有已知ncRNA基因数目大于30的9个细菌基因组,并按基因组G+C含量进行分类,比较s RNAPredict和PORTRAIT工具的预测准确性。提取不同G+C含量基因组中ncRNA基因转录起始和终止区的序列特征,对s RNAscanner预测结果进行评估。【结果】s RNAPredict对细菌ncRNA基因的预测特异性和阳性检出率均高于PORTRAIT,而敏感性则较差;两种工具预测效果均随基因组G+C含量不同而产生明显变化。在不同G+C含量的细菌基因组中,ncRNA基因启动子和终止子区域的序列特征有明显差异。利用这些序列特征能提高s RNAscanner预测ncRNA基因的平均水平。【结论】3种ncRNA基因工具预测效果随基因组G+C含量变化而不同。不同G+C含量基因组中ncRNA基因的转录起始和终止区特征可作为ncRNA基因预测的重要参数之一。; 刘林梦温权欧竑宇

大曲高温放线菌Thermoactinomyces daqus CICC 10681的DNA(G+C)含量分析: 2014年; 通过热变性温度法(Tm法)、高效液相色谱(HPLC)法并结合全基因组测序结果对大曲高温放线菌(Thermoactinomycesdaqus)CICC 10681的(G+C)摩尔分数进行了分析,完善其遗传学特征。并对Tm法和HPLC法这两种常规测定方法进行了比较。结果显示,Tm法和HPLC法得到的CICC 10681(G+C)摩尔分数分别为47.0%(Tm)和49.3%(HPLC),与全基因组测序的结果相近,并且与已报道的高温放线菌属的(G+C)摩尔分数范围一致,符合高温放线菌低(G+C)摩尔分数的特征;与Tm法相比,HPLC法得到的(G+C)摩尔分数更准确,适合用于对微生物菌株(G+C)摩尔分数的分类学描述。; 张欣姚粟刘洋刘勇张露程池; 关键词：分析方法

应用甜菜碱增加富含三核苷酸重复的高G--C含量DNA片段测序辨识度的最佳浓度探讨: 2014年; 目的通过在Sanger法测序体系中加入浓度梯度的甜菜碱，建立高辨识度的富含三核苷酸重复的高G-C含量DNA片段的测序体系。方法以G-C含量为72％无三核苷酸重复的Nogo-B基因cDNA的5’端序列（the 5’ terminal of Nago—BcDNA，Am-Nogo-B）及G-C含量为74％的富含CAG重复与CCG重复的Huntingtin基因cDNA的5’端序列（the 5’ terminal of huntingtin cDNA，Am-HTT）为例，在Sanger法测序体系中加入浓度梯度的甜菜碱，比较测序结果。结果Am—Nogo—B与Am-HTT基因测序体系中最适宜的甜菜碱浓度相差较大。甜菜碱浓度在0．8～1．2mol／L之间时，Am-Nogo-B测序结果质量最佳。甜菜碱浓度在1．6～2．4mol／L之间时，Am-HTT基因的测序质量最好。结果具有良好的可重复性。结论不同碱基组成类型的高G-C含量DNA片段，即使G-C含量接近，最适宜测序体系中甜菜碱浓度不同。探索出了适宜于增加富含三核苷酸串联重复的高Gc含量DNA片段测序辨识度的体系，可作为类似DNA片段测序的参考方法。; 王丹蔡灏余龙; 关键词：甜菜碱三核苷酸重复 DNA测序

1、RTN4B五肽(178RRGSS182)抑制肝癌血管发生的研究2、暨应用甜菜碱增加高G-C含量三核苷酸重复序列DNA片段测序辨识度的最佳浓度探讨: 肝细胞肝癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一,全球每年新发肝癌病例约74万人,每年肝癌死亡病例约70万人,其中半数发生在中国,这其中东南沿海又是肝癌的高发地带。目前在临床上治疗肝癌的有效方法只有手术切除,但是患者术后5年的...; 蔡灏; 关键词：肝癌整合素甜菜碱三核苷酸重复; 文献传递

RTN4B五肽(178RRGSS182)抑制肝癌血管发生的研究：暨应用甜菜碱增加高G-C含量三核苷酸重复序列DNA片段测序辨识度的最佳浓度探讨: 第一部分RTN4B五肽(178RRGSS182)抑制肝癌血管发生的研究　　肝细胞肝癌是全球范围内最常见的恶性肿瘤之一，全球每年新发肝癌病例约74万人，每年肝癌死亡病例约70万人，其中半数发生在中国，这其中东南沿海又是肝癌...; 蔡灏; 关键词：甜菜碱肝癌血管发生三核苷酸重复; 文献传递

高G+C含量模板进行PCR扩增的高效缓冲液体系的建立被引量：9: 2006年; 高G+C含量模板进行PCR扩增时,往往通过添加增强剂如甘油、DMSO、甲酰胺等来提高扩增效率,但是目前研究单个增强剂对PCR影响的较多,而研究增强剂组合的不多,而且关于增强剂对聚合酶保真度的影响的研究也不够充分。本研究通过正交试验对不同增强剂组合的效应进行了探讨,建立了3个对高G+C含量模板进行PCR扩增的高效缓冲液体系,并且对其中2个进行研究发现它们可以提高Taq聚合酶扩增的保真度,因而具有较广的应用前景。; 孔会利王超肖亮李文成; 关键词：保真度 PCR

高G+C含量靶基因的PCR扩增方法被引量：2: 1999年; 自从１９８５年Ｍｕｌｉｓ等［１］发明了聚合酶链反应（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ，ＰＣＲ）以来，ＰＣＲ及其衍生物的分子生物学方法无论在人类基因组研究，还是在疾病的病因、诊断及治疗等方面的研究中均有举足轻重的地位。然而ＰＣＲ技术也不是...; 郑以漫李小英朱宏达许曼音陈家伦; 关键词：PCR扩增靶基因

鸭疫里氏杆菌江苏分离株G+C含量测定及DNA同源性研究被引量：12: 1998年; 采用苯酚－氯仿混合法，提取了鸭疫里氏杆菌（Ｒｉｅｍｅｒｅｌａａｎａｔｉｐｅｓｔｉｆｅｒ）血清１型Ｊｂ２株、Ｊｂ３株、未定型菌Ｔｂ１株以及鸭大肠杆菌Ｅ４株和大肠杆菌Ｋ１２株的基因组ＤＮＡ。用热变性法测得Ｊｂ２、Ｊｂ３、Ｔｂ１和Ｋ１２株的解链温度（Ｔｍ）分别为６８．５，６８．５，６９．０和７３．５℃（缓冲液为０．１×ＳＳＣ）。由计算可知Ｊｂ２、Ｊｂ３和Ｔｂ１株的Ｇ＋Ｃ含量分别为３５．６２％，３５．６２％和３６．６７％。应用ＤＮＡ－ＤＮＡ杂交技术（初始复性速率法）比较了１型鸭疫里氏杆菌Ｊｂ２与Ｊｂ３株之间以及Ｊｂ２与Ｔｂ１株、Ｅ４株之间的同源性。结果表明，Ｊｂ２与Ｊｂ３之间的ＤＮＡ同源值为６８．６３％；Ｊｂ２与Ｔｂ１株之间的ＤＮＡ同源值为６８．９４％；而Ｊｂ２株与鸭大肠杆菌Ｅ４株的ＤＮＡ同源值为０。; 胡青海李刚郑明球蔡宝祥; 关键词：疫里氏杆菌 G+C含量 DNA同源性

G＋C超含量DNA序列的PCR扩增被引量：6: 1998年; 结合PCR技术和变性剂的作用，扩增出内皮型一氧化氮合成酶（eNOS)801-902AA区G＋C超含量（71．5％）编码基因，同时研究了各种变性剂及其不同浓度对扩增的影响，结果显示，DMSO，吐温20可促进该序列特异性扩增，其中DMSO在1．5－2％，吐温20在0．15％浓度时效果最佳，扩增产物为建立eNOS检测试剂盒作了必要准备，本实验证明，变性剂可明显改善G＋C超含量DNA序列的特异性扩增，这对临床应用PCR技术扩增G＋C高或超含量基因片段具有重大的参考意义。; 赵建华朱敏生等; 关键词：聚合酶链反应变性剂特异性

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