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南瓜钙依赖型蛋白激酶基因CmCDPK20在其耐盐性中的应用: 本发明涉及南瓜耐盐性基因功能研究领域，具体涉及南瓜钙依赖型蛋白激酶CmCDPK20在其耐盐性中的应用。本发明首先通过基因家族分析、转录水平分析以及亚细胞定位分析鉴定了南瓜关键钙依赖型蛋白激酶CmCDPK20基因，然后构建...; 别之龙陈惠王颖韦兰星

桑树钙依赖型蛋白激酶及其编码基因和应用: 本发明公开了一种桑树钙依赖型蛋白激酶及其编码基因和应用。所述基因、蛋白的序列分别如基因编码序列表中SED ID NO.1和SED ID NO.2所示。本发明通过桑树在镉胁迫下的生理生化检测以及公开桑树钙依赖型蛋白激酶Mm...; 赵卫国李阳杜秋霞郭鹏郑丹艳师一粟; 文献传递

一种钙依赖型蛋白激酶CPK32及其编码基因和应用: 本发明公开了一种钙依赖型蛋白激酶CPK32及其编码基因和应用。本发明的钙依赖型蛋白激酶CPK32，其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码基因的CDS序列如SEQ ID NO.2所示。本发明发现CPK32基因导入...; 陈丽梅武维华李希东姚莉; 文献传递

‘西伯利亚’百合钙依赖型蛋白激酶基因的克隆及表达分析被引量：3: 2019年; 钙依赖型蛋白激酶(calcium-dependent protein kinase, CDPK)是一类Ser/Thr型蛋白激酶,在植物体内钙信号的传递中起着重要的作用。本研究以东方百合‘西伯利亚’(Oriental Lilium’siberia’)为材料,通过RACE方法克隆了LiCDPK基因,并进行了时空表达分析。结果表明,百合LiCDPK基因全长2 231 bp,开放阅读框长1 551 bp,编码516个氨基酸,其蛋白序列与其他物种的CDPK蛋白相似性在80%以上。LiCDPK基因在不同花期和9个不同组织中的表达存在差异。不同花期的qRT-PCR表明,花蕾期LiCDPK基因的表达量最高;盛花期的不同组织器官中,花药LiCDPK基因的表达量最高。本研究为进一步揭示LiCDPK基因在百合花香释放过程中的信号作用提供了帮助。; 闫子飞黎梦娟马波冷平生高海波胡增辉; 关键词：基因克隆

二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶基因BdCDPK14克隆及表达分析被引量：2: 2017年; 【目的】克隆分析二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶(CDPK)基因BdCDPK14,并检测其在干旱胁迫下的表达量,为揭示钙依赖型蛋白激酶的抗旱调控机制打下基础。【方法】根据NCBI检索结果设计特异引物,以二穗短柄草cDNA为模板,采用PCR扩增二穗短柄草CDPK基因家族成员BdCDPK14,利用在线分析软件对BdCDPK14基因编码蛋白进行生物信息学分析,并采用RT-PCR检测PEG-6000干旱胁迫下的BdCDPK14基因表达量。【结果】从二穗短柄草叶片中克隆获得的BdCDPK14基因(Gen Bank登录号XM_003564390)片段长度1750 bp,其开放阅读框(ORF)1545 bp,编码514个氨基酸,其编码蛋白分子量56.78 kD,理论等电点5.45,脂肪指数78.21,不稳定指数38.66,属于稳定蛋白。BdCDPK14蛋白与小麦TaCPK13蛋白(ABY59018)的亲缘关系最近,含有4个EF-hands结构、蛋白酪氨酸激酶结构域、脂多糖激酶家族、ATP结合区域、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活区和预测跨膜区等结构域,主要由无规卷曲和α-螺旋构成,位于叶绿体和细胞质膜上。在PEG-6000干旱胁迫下,BdCDPK14基因在胁迫3 h内的相对表达量无明显变化,胁迫6 h后相对表达量开始升高,至胁迫12 h时的相对表达量最高。【结论】克隆获得的BdCDPK14基因为二穗短柄草CDPK基因家族成员之一,参与其抗干旱胁迫反应,可作为候选基因用于二穗短柄草抗旱机制研究。; 韦淑亚赵旭东杨广笑何光源; 关键词：二穗短柄草克隆生物信息学分析干旱胁迫

二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶BdCDPK4基因的克隆及其编码蛋白质的生物信息学分析被引量：2: 2017年; 二穗短柄草(Brachypodium distachyon L.)因与小麦、大麦等有很高的同源性,作为新型禾本科模式生物吸引了越来越多的研究者。试验采用基因克隆技术分离了二穗短柄草Bd CDPK4基因的编码区序列,并采用生物信息学方法分析了该基因及其编码的蛋白质的序列特征、结构和功能。结果表明,分离了BdCDPK4基因1 851 bp的cDNA序列(Gen Bank登录号为XM_003559516),编码区长度为1 752 bp,编码583个氨基酸,分子量为64.78 ku,等电点为9.12,含有N端可变区、蛋白激酶区、自抑制区、EF手型结构、类似钙调素等结构域。亚细胞定位预测位于叶绿体和液泡上。进化树分析结果显示,该蛋白与小麦Ta CDPK19蛋白的同源性最近。根据各物种间CDPKs蛋白的高同源性,结合小麦TaCDPK19基因被高盐和小麦白粉病菌Blumeria graministritici(Bgt)诱导,推测Bd CDPK4基因也可能参与逆境胁迫下的信号传导途径,在抗逆等生物学过程中发挥重要功能。; 韦淑亚赵旭东王会平杨广笑何光源; 关键词：CDPKS 多序列比对生物信息学分析

一种钙依赖型蛋白激酶CPK32及其编码基因和应用: 本发明公开了一种钙依赖型蛋白激酶CPK32及其编码基因和应用。本发明的钙依赖型蛋白激酶CPK32，其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，其编码基因的CDS序列如SEQ ID NO.2所示。本发明发现CPK32基因导入...; 陈丽梅武维华李希东姚莉

羊草钙依赖型蛋白激酶基因生物信息学及表达特性分析被引量：8: 2015年; 为了研究钙依赖型蛋白激酶(CDPK)在羊草适应生境中的功能,分别对羊草幼苗进行模拟干旱(PEG)和盐碱(NaCl-Na2CO3)处理,测序分析了羊草中克隆的CDPK基因cDNA(LcCDPK),其核酸序列全长为1704bp,开放阅读框为1647bp,共编码548个氨基酸,编码的氨基酸序列与GenBank中小麦CDPK1基因的同源性最高,氨基酸一致性为96%。用软件对其蛋白质氨基酸组成及结构分析,氨基酸序列构成具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化活性的S-TKc结构域,有4个保守的EF手性结构域,为Ca2+结合位点,预测的成熟肽相对分子质量61.349KDa,理论等电点5.34;二级结构预测α-螺旋占37.59%,β-折叠占9.85%,而无规则卷曲占52.55%;实时荧光定量PCR结果分析表明,在低浓度PEG、盐碱处理条件下羊草根及叶片的CDPK基因表达下调,高浓度处理条件下CDPK基因表达上调,说明CDPK基因表达受干旱及盐碱胁迫调控;盐碱处理条件下CDPK基因在根和叶片中的表达均高于干旱处理。推测LcCDPK广泛参与羊草抵御逆境胁迫的响应,尤其在盐碱胁迫过程中发挥重要作用。; 崔喜艳张继伟秦思余刘忠野郭继勋; 关键词：羊草生物信息学基因表达

钙依赖型蛋白激酶CPK32调节拟南芥开花时间的机制研究: Ca2+在植物体内广泛存在,在维持体内电荷平衡中起着重要的作用,它不仅是重要的结构成分,还作为重要的第二信使参与植物细胞的多种信号传递过程。作为重要的钙感受器蛋白,CDPK参与了植物生长发育调控、植物激素信号转导、营养代...; 李希东; 关键词：拟南芥开花时间 FLC FCA

水稻钙依赖型蛋白激酶OsCPK9基因启动子的克隆及在烟草中的瞬时表达分析被引量：3: 2014年; 植物钙依赖型蛋白激酶(CDPK)调控钙信号途径下游组分,与植物的生长发育及各种逆境生理过程密切相关。通过对本课题组克隆的水稻OsCPK9基因的cDNA序列与NCBI中的水稻基因组数据库进行比对、定位,结合生物信息学的方法,预测到基因上游的一段启动子序列。进而利用PCR的方法从水稻‘日本晴’(Oryza sativa L.cv.Nipponbare)基因组DNA中克隆到了水稻OsCPK9基因5’端上游约2 kb的DNA序列,命名为POsCPK9。PLANTCARE在线分析表明,POsCPK9序列除包含植物启动子所必备的基本元件如TATAbox和CAAT-box外,还含有多个与逆境和信号物质相关的顺式表达元件。将克隆到的POsCPK9取代pBI121中的CaMV 35S启动子,构建成POsCPK9与GUS的融合表达载体POsCPK9-GUS;通过农杆菌介导的方法在烟草的根、茎、叶中进行瞬时表达。结果显示,该启动子驱动的GUS基因在烟草的根、茎、叶中都有不同程度的表达。说明OsCPK9基因上游2 kb具有启动子活性。; 韦淑亚刘小东张莹莹赵旭东罗青晨刘虎杨广笑何光源; 关键词：水稻启动子 GUS活性

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