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乙烯利处理文心兰花瓣转录组分析及花衰老相关基因挖掘: 2024年; 为挖掘花衰老相关基因,揭示乙烯调控花瓣衰老的分子机制,利用乙烯利处理文心兰南茜种(Oncidium gower ramsey)盛开前期的切花花瓣,并进行RNA测序和转录组分析。测序结果共得到234 619个unigene。利用NR、GO、COG/KOG、KEGG和Swissprot数据库分别进行基因功能注释,分别注释到31 027 (77.22%)、11 126 (27.69%)、10 152 (25.27%)、5 523 (13.75%)和18 830 (46.86%)条unigenes。检测到差异表达基因有7 319条。GO功能富集分析共有4 622条差异表达基因注释到生物过程、细胞组分和分子功能3个功能群组;KEGG功能富集分析将差异表达基因主要参与15个代谢通路,其中植物激素信号转导富集的基因最多。鉴定出一批可能在乙烯调控文心兰花瓣衰老中发挥作用的植物激素信号转导关键成分基因和转录因子基因。本研究所获得的乙烯调控文心兰花瓣衰老转录组数据,有助于了解花衰老相关基因功能和阐明花衰老分子机制。; 裴小华赵龙田阳阳王帅薛唯佳曲飞鸿翟珂吴双李梦桃张恒潘英文夏志强刘进平; 关键词：文心兰乙烯转录组

基于衰老相关基因探索肾透明细胞癌的亚组和个体化治疗: 2024年; 目的肾透明细胞癌(ccRCC)的发病率较高,肿瘤异质性的存在导致ccRCC患者的预后存在明显差异,本研究推测在ccRCC中可能存在潜在的亚组,并通过衰老相关基因(SRGs)进行ccRCC的风险建模、分组以及亚组间的差异探索。方法从TCGA网站中获得ccRCC患者的mRNA-seq数据,筛选出正常和肿瘤组织中存在差异表达的SRGs。使用单因素Cox-Lasso-多因素Cox的方法建立风险模型,根据风险评分将患者分为高、低风险组。在内部队列和外部队列中验证模型和分组的效能。分析二组间功能通路和免疫微环境的差异。结果内部和外部队列的验证表明模型有良好的预测效能并且分组方法有效。功能通路以及免疫浸润分析发现两亚组间的免疫微环境存在差异。结论基于SRGs对ccRCC患者的预后模型构建和分组是有效的,免疫微环境的差异可能是导致二组生存差异的原因。; 裴永超李治国张秦欣张家毅沈宏曹凤宏; 关键词：肾透明细胞癌细胞衰老亚组

基于TCGA数据库肺腺癌衰老相关基因预后模型的建立与验证: 2024年; 目的探究肺腺癌(LUAD)差异表达的衰老相关基因(ARGs),并构建LUAD衰老相关基因的预后模型。方法LUAD的RNA高通量转录组数据下载于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,AgingAtlas数据库获取ARGs,并基于LUAD中衰老相关差异表达基因构建LUAD预后模型并验证,进一步构建列线图及校准曲线探究模型在临床中的应用价值。结果通过韦恩图去交集共获得80个衰老相关差异表达基因。通过单因素、多因素Cox回归分析筛选得到7个具有独立预后意义的差异表达ARGs,对筛选出的7个基因进行LASSO回归分析并构建LUAD预后模型。构建Kaplan-Meier生存曲线显示,与低风险组相比,高风险组与较差的OS显著相关,差异具有统计学意义(P<0.05)。1、3和5年受试者操作特性(ROC)曲线下面积(AUC)分别为0.706、0.725、0.642,提示风险模型有较高的灵敏度和特异度。单因素及多因素Cox回归显示,风险评分为LUAD独立预后因素。进一步基于风险评分构建列线图及校准曲线,校准曲线列线图全局的一致性为0.729,说明该模型预测结果与实际情况有较高的准确度。结论基于差异表达的ARGs构建的风险模型可作为LUAD的一种预后特征,为LUAD患者个体化治疗提供参考。; 邢龙吴双丽吴铁成徐敬宣李保健田平李醒亚; 关键词：肺腺癌预后模型生物信息学

小鼠胚肾发育过程中细胞衰老相关基因差异表达分析: 2024年; 目的通过转录组学筛选胚肾发育过程中的差异表达基因,采用生物信息学分析细胞衰老途径及其相关基因,进一步探讨细胞衰老与胚肾发育的关系。方法分别取胚龄为14.5 d(E14.5组)和18.5 d(E18.5组)的小鼠肾脏组织,使用过碘酸雪夫染色观察肾脏组织结构,通过转录组学分析胚肾发育过程中基因谱表达变化,采用生物信息学分析细胞衰老相关基因表达变化,并采用实时定量荧光PCR及Western blot验证靶基因的表达水平。结果随着胚肾的发育,肾脏结构逐渐成熟,转录组学结果及生物信息学分析发现细胞衰老相关基因在胚肾发育过程中发挥重要作用,其中E18.5组中细胞衰老相关基因Cdkn1a(P21)mRNA及蛋白相对表达水平较E14.5组升高(P<0.05),而Skp2、Ccne1、Ccnd2和Cdk4 mRNA表达水平较E14.5组降低(P<0.05)。结论在胚肾发育过程中细胞衰老相关基因表达水平发生显著变化,表明细胞衰老在胚肾发育过程中发挥重要作用。; 罗佳汪晓月喻芳陈娟陈客宏何娅妮陈佳; 关键词：细胞衰老生物信息学分析

一种球根花卉开花调控和花瓣衰老相关基因TgFTS1及其应用: 本发明属于植物基因工程技术领域，具体涉及一种球根花卉开花调控和花瓣衰老的相关基因及其应用，所述基因为TgFTS1基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，FTS1基因的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。通过农...; 王艳平产祝龙陈欣晨王森

肠道真菌抗衰老作用及对脏器组织衰老相关基因表达的影响: 2024年; 真菌作为肠道菌群的重要组成部分,直接或间接影响宿主的健康。尽管已有许多关于肠道细菌抗衰老的研究,但肠道真菌抗衰老的研究仍然相对有限。本研究使用混合抗细菌抗生素清除年轻小鼠粪便中的细菌,并将其移植到自然老龄鼠的肠道中。通过评估学习记忆能力、体重、脏器指数、组织病理变化等生理指标,结合实时荧光定量PCR和酶联免疫吸附试验检测老龄鼠各组织中衰老相关基因、蛋白以及炎症因子的表达水平。研究结果显示,经过清除细菌的粪菌移植处理显著提高了老龄鼠空间定位的学习记忆能力,对老龄鼠的体重和其他脏器指数均无不良影响。进一步分析表明,粪菌移植处理改善了老龄鼠脑、肝、脾、肺、肾、小肠的组织状态;显著上调了与肠道完整性相关的基因表达,下调了老龄鼠脑、肝、肾组织中衰老相关基因p53和p21的表达,但对肺、脾、小肠无明显影响;此外,粪菌移植处理显著提高了老龄鼠血清和多组织中抗氧化物酶的水平,降低了衰老生物标志物和促炎因子的表达。综上所述,年轻供体肠道真菌菌群可以延缓血清、脑、肝和肾等组织的衰老进程,为进一步探索肠道真菌抗衰老的潜在机制提供了科学依据。; 刘晓静赵佳敏晏露闻崔明肖惠文刘杏忠; 关键词：肠道微生物抗衰老

基于TCGA数据库构建乳腺癌衰老相关基因预后风险模型: 目的:本研究基于TCGA数据库构建乳腺癌衰老相关基因预后风险模型,并联合临床病理因素,开发一个便于临床使用的列线图。为临床更好地识别乳腺癌患者中的高危人群和评估患者预后提供新的思路。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)官方...; 蒋帅; 关键词：乳腺癌衰老相关基因预后生物信息学

基于衰老相关基因的胶质瘤预后模型: 2023年; 利用生物信息学方法筛选与胶质瘤预后相关的衰老基因,并进行相关预后风险模型的构建与验证。首先,从中国脑胶质瘤基因组图谱数据库中获取胶质瘤患者的表达谱和临床信息,通过单因素回归、拉索回归、多因素回归的方法构建相关预后模型;其次使用外部数据集进行验证;再使用箱线图表明各临床亚型的风险评分差异;最后使用富集分析(GSEA)探讨可能涉及的机制。结果筛选出4个用于预后的基因。训练集和验证集的生存曲线显示,高风险组的总生存率显著低于低风险组(p<0.001)。受试者工作特征曲线分析结果显示,训练集在1、3和5 a的曲线下面积分别为0.91、0.95和0.95,验证集在1、3和5 a的曲线下面积分别为0.73、0.80和0.80,说明该模型对患者的预后预测具有很强的预测效能。临床亚型箱线图显示多种临床亚型分组的风险得分具有显著差异。GSEA分析富集的通路主要涉及JAK-STAT信号路径、P53信号通路、泛素介导的蛋白水解、长期电位富集等通路。以上结果表明这4个衰老相关基因可能为胶质瘤预后潜在的生物标志物。; 周宇能彭肖周婧朱颖李婧陈孝平; 关键词：胶质瘤预后模型生物信息学

中老年人群相对端粒长度与血液生化指标及33个衰老相关基因位点多态性的关联分析: 目的:端粒长度是衰老和衰老相关疾病的标志物之一,但衰老具体机制尚不完全清楚。本研究通过分析社区中老年人群相对端粒长度(relative telomere length,RTL)与血液学生物标志物及基因多态性的关联性,探索...; 海志琴; 关键词：衰老基因多态性

胃癌综合治疗相关临床研究及胃癌线粒体--衰老相关基因预后模型构建: 研究背景:根据国家癌症中心最新的统计数据,胃癌在我国的肿瘤发病率、死亡率顺位均排名第三。2016年我国有39.65万人罹患胃癌,28.85万人死于胃癌。胃癌早期诊断缺乏有效、经济的方法,目前对于疾病自然史的研究结果表明,...; 吴昀紫; 关键词：胃癌腹腔热灌注化疗胃癌预后模型

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