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基于小样本血浆蛋白质组学数据的抑郁症分类预测: 2024年; 抑郁症是一种常见的精神障碍,约27%的人在一生中会出现类似症状,早期诊断对治疗至关重要,但传统诊断方法存在主观局限性,易误诊或漏诊,因此需要一种客观的诊断方法来提高诊断率。蛋白质组学技术研究蛋白质表达水平变化,可以帮助理解疾病机制,有助于开发临床诊断工具。蛋白质组学数据通常具有特征维度高,样本量少的特点,本文提出了一种基于小样本学习的抑郁症分类预测模型,相比于传统机器学习模型,该模型对抑郁症的分类预测能力显著提升。; 涂强强郭文静潘乔陈德华; 关键词：抑郁症蛋白质组学技术

血浆蛋白质组学在肝内胆管癌诊断和鉴别中的应用研究: 研究背景和目的:肝内胆管癌(ICC)是一种起源于肝脏内二级及以上胆管上皮的肝脏恶性肿瘤,近年来ICC发病率在全球范围内呈上升趋势。ICC的预后极差,5年总生存率仅为20%左右。预后较差的主要原因包括ICC的高度侵袭性和没...; 胡志亮; 关键词：肝内胆管癌蛋白质组学生物标志物 S100A9

通过血浆蛋白质组学分析鉴定预测颅内动脉瘤破裂的生物标志物: 目的本研究旨在探究颅内动脉瘤(IAs)患者的血浆蛋白质组学表达特征,通过比较破裂动脉瘤患者(RIA)与未破裂动脉瘤患者(UIA)的血浆蛋白质组学表达差异,鉴定可用于预测IAs破裂的生物标志物。方法采用串联质谱标签(TMT...; 王晨辰李晓明; 关键词：颅内动脉瘤蛋白质组学蛛网膜下腔出血

基于血浆蛋白质组学与代谢组学技术探讨2型糖尿病气阴两虚证的生物学基础被引量：2: 2024年; 目的用血浆蛋白质组学与代谢组学技术分析2型糖尿病气阴两虚证的生物学基础。方法选择2018年5月—2018年9月于首都医科大学附属北京世纪坛医院2型糖尿病气阴两虚证患者30例(Q组),2型糖尿病非气阴两虚证患者30例(F组),健康对照组30例(N组)。用Label free蛋白质组学方法对3组血浆样本进行差异蛋白分析,得到组间差异表达蛋白,采用KEGG pathway、String数据库对差异表达蛋白进行生物信息学分析;采用LC-MS联用技术对3组血浆样本进行差异代谢产物分析,用多维分析和单维分析相结合的方法筛选3组间差异代谢物,通过HMDB数据库进行搜库鉴定,并对筛选出的差异代谢物进行KEGG pathway分析,探索差异代谢物可能参与的代谢途径。结果血浆蛋白质组学结果:在2型糖尿病组与健康对照组间筛选出差异蛋白119个,其中表达上调的有55个,表达下调的有64个;2型糖尿病气阴两虚证组与非气阴两虚证组间筛选出差异蛋白89个,其中表达上调的有51个,表达下调的有38个;2型糖尿病气阴两虚证组与非气阴两虚证组、健康对照组间筛选出差异表达蛋白18个,其中表达上调的有8个,表达下调的有10个。KEGG pathway分析发现PI3K-AKT信号通路、肾素分泌、IL-17等信号通路与2型糖尿病气阴两虚证的发生发展密切相关。血浆代谢组学结果:在2型糖尿病组与健康对照组间筛选出差异代谢产物32个。KEGG pathway分析发现支链氨基酸(BCAAs)合成与代谢途径、甘油磷脂代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢途径可能与2型糖尿病的发生发展密切相关。进一步整合蛋白质组学与代谢组学结果发现,BCAAs代谢通路、PI3K-AKT信号通路均与2型糖尿病气阴两虚证密切相关。结论血浆高水平的BCAAs可能通过抑制PI3K-AKT信号通路导致胰岛素信号通路受损,从而促进2型糖尿病气阴两虚证的发生发展。; 高慧娟冯兴中; 关键词：蛋白质组学代谢组学 2型糖尿病气阴两虚证

子宫内膜异位症痛经患者血浆蛋白质组学研究: 2024年; 目的:应用蛋白质组学方法探讨子宫内膜异位症痛经的生物学标志物及相关发病机制。方法:选择符合纳入及排除标准的子宫内膜异位症痛经寒凝血瘀证患者(内异症组)、原发性痛经寒凝血瘀证患者(痛经组)、健康女性(正常组)为研究对象,每组8例。采集各组受试者月经周期第2天的静脉血浆样本进行蛋白提取、胰酶酶解,采用Label-free定量蛋白质组学技术筛选差异表达蛋白,采用生物信息学的分析方法进行功能注释、关键信号通路富集等。结果:内异症组与正常组共筛选出180个差异表达蛋白,痛经组与正常组共筛选出219个差异表达蛋白。经交集比对后,得出子宫内膜异位症痛经相关差异表达蛋白83个,其中50个蛋白下调,33个蛋白上调。GO富集分析筛选到Wnt信号通路的正调控、平滑肌细胞迁移的正调控等生物学过程。KEGG通路富集分析主要富集到PI3K-Akt信号通路、糖代谢、黏着斑、糖酵解等信号通路。蛋白互作网络及拓扑参数分析显示纤维连接蛋白1(FN1)、磷酸丙糖异构酶1(TPI1)、Ⅰ型胶原蛋白α1链(COL1A1)、转醛醇酶1(TALDO1)为核心差异表达蛋白。结论:子宫内膜异位症痛经的发病机制可能与调节核心差异表达蛋白,参与代谢、免疫、血管生成等关键生物学过程和信号通路,调控细胞增殖、迁移、黏附、凋亡、侵袭等细胞功能有关。; 孙莹马玉聪范丽洁张宇张拴成贺明杜惠兰; 关键词：子宫内膜异位症痛经寒凝血瘀证蛋白质组学

基于iTRAQ技术分析早期糖尿病肾病肾阴虚证患者血浆蛋白质组学被引量：1: 2024年; 目的:筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证敏感的血浆分子标志物,探究糖尿病肾病肾阴虚证的生物学基础及其发病机制。方法:收集24例早期DN肾阴虚患者(DN阴虚证组)的血浆和24例正常人群血浆(NC组),应用同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tag for relative and absolute quan-tification,iTRAQ)标记的二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2DLC-MS/MS)方法检测血浆蛋白质,利用基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)及蛋白质互作网络等方法筛选血浆差异蛋白,采用Western blot对筛选出来的蛋白进行验证。结果:与NC组比较,DN阴虚证组中共鉴定出37个差异蛋白质(差异倍数>2,P<0.05),包括20个上调蛋白和17个下调蛋白。这些蛋白主要涉及胆固醇代谢、补体及凝血级联反应、脂肪消化吸收等与心血管疾病有明显关系的通路。进一步验证发现HP和FGG蛋白表达高于NC组,载脂蛋白AI表达低于NC组(P<0.05),Western blot结果与iTRAQ质谱结果具有一致性。结论:iTRAQ结合2DLC-MS/MS技术可以有效筛选出DN肾阴虚证中差异的蛋白,本研究鉴定的37种蛋白有可能为DN的早期诊断和中医证型研究提供潜在分子标志物。; 耿宇轩赵青郭文涛程吟黄怡冯龙卢洪梅; 关键词：糖尿病肾病肾阴虚证蛋白质组学

DIA血浆蛋白质组学肺纤维化疾病采样检测套盒: 本实用新型公开了DIA血浆蛋白质组学肺纤维化疾病采样检测套盒，涉及疾病检测技术领域，该DIA血浆蛋白质组学肺纤维化疾病采样检测套盒，包括盒体，所述盒体的上端设置有盒盖，所述盒盖的一侧连接有侧盖板，所述盒体的一侧设置有抽屉...; 刘慧黄邵鑫刘涵杨敏洁

重型COVID-19患者中基于血浆蛋白质组学的肺损伤修复相关生物标志物及应用: 本发明公开了重型COVID‑19患者中基于血浆蛋白质组学的肺损伤修复相关生物标志物及应用，涉及生物医疗技术领域，其技术方案要点是：利用随机对照试验队列找到一个含有5种蛋白质(DDX55、AGRG6、PICAL、CTRB1...; 石磊李甜甜王泽瑞姚惟琦王福生

基于数据非依赖采集质谱技术对下肢动脉硬化闭塞症合并急性动脉血栓形成的血浆蛋白质组学的研究被引量：1: 2023年; 目的应用数据非依赖采集质谱(DIA-MS)技术研究下肢动脉硬化闭塞症(LEASO)合并急性动脉血栓形成患者的血浆蛋白质组学,探索LEASO合并急性动脉血栓形成的潜在发病机制。方法收集2020年1—5月德阳市人民医院收治的10例LEASO合并急性动脉血栓形成患者和10例健康体检者的血浆,分别为血栓形成组和健康对照组,采用混样方式,确保每组3例生物学重复。先通过DIA-MS技术进行数据采集和分析,再针对差异蛋白进行基因本体论(GO)功能富集分析、京都基因和基因组数据库(KEGG)通路富集分析,并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,最后采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对血浆Serpin家族成员1(SERPINA1)蛋白的表达进行验证。结果与健康对照组相比,血栓形成组共有112个差异蛋白,包括61个表达上调的蛋白和51个表达下调的蛋白。差异蛋白富集分析结果显示,多个与动脉粥样硬化及血栓形成相关的GO条目和KEGG信号通路被显著富集。PPI网络图分析结果显示,连通数目最多的3个蛋白分别为甲状腺素运载蛋白(TTR)、触珠蛋白(HP)和SERPINA1。ELISA结果显示,血栓形成组患者SERPINA1蛋白的浓度高于健康对照组患者,差异有统计学意义(P﹤0.05)。结论利用DIA-MS技术研究LEASO合并急性动脉血栓形成患者的血浆蛋白质组学是可行的,筛选出来的差异蛋白可能参与了LEASO合并急性动脉血栓形成的病理过程,其中,SERPINA1蛋白可能是参与该过程的关键蛋白之一。; 黄国飞李俊贺俊文李佩明周阳; 关键词：下肢动脉硬化闭塞症蛋白质组学

一种用于血浆蛋白质组学样品前处理的方法: 本发明公开了一种用于血浆蛋白质组学样品前处理的方法，包括如下步骤：步骤S1，将小分子药物加入血浆样品中，使小分子药物与血浆中的白蛋白结合，抑制白蛋白的酶解；步骤S2，将经步骤S1处理后的血浆样品转移到超滤管中，离心滤除血...; 周愿田璐季灿灿刘丹丹庞奕君周雍进

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