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一种蛋白质功能预测模型生成方法及装置
本发明公开了一种蛋白质功能预测模型生成方法及装置,包括获取训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标,并根据其进行图论方法生成蛋白质二维接触图;对训练蛋白质的氨基酸三维原子坐标进行算法处理获取第一特征矩阵,对蛋白质二维接触图进行算法...
李君一焦沛舜王贝贝王轩刘博王亚东
蛋白质功能识别方法、装置及可读存储介质
本申请提供一种蛋白质功能识别方法、装置及可读存储介质,涉及生物信息技术领域,其中该方法具体包括:获取目标蛋白质数据,目标蛋白质输入数据包含与待识别的蛋白质相关的蛋白质序列、蛋白质结构和相互作用网络信息;将目标蛋白质数据输...
朱东杰王衍淞丁卓
一种用于预测蛋白质功能的数据多标签分类方法
本发明涉及一种用于预测蛋白质功能的数据多标签分类方法,属于生物信息学及数据挖掘技术领域。本发明包括步骤:把蛋白质序列生物数据由字符转换成向量的形式,对高维的向量形式进行降维处理;构建用于进行蛋白质序列生物数据标签分类模型...
丁家满李红磊
多物种蛋白质功能预测方法、装置、设备及存储介质
本申请公开了一种多物种蛋白质功能预测方法、装置、设备及存储介质,属于生物信息技术领域,该方法包括:将多物种蛋白质的标签矩阵和特征矩阵输入预先构建的跨物种异构网络;在所述跨物种异构网络的每个传播层传播所述标签矩阵和所述特征...
李君一吴楷涛王乐翔张阳王轩刘洋漆舒汉吴宇琳姚霖刘博王亚东
一种人工智能驱动的蛋白质功能预测方法及系统
本发明公开了一种人工智能驱动的蛋白质功能预测方法及系统,涉及人工智能技术领域,包括对蛋白质氨基酸的序列进行特征提取,基于图采样技术搜索蛋白质的本体特征;将提取后的蛋白质氨基酸序列和搜索的蛋白质本体特征进行融合,判定蛋白质...
计智伟谢诗婕朱一亨
一种基于多源异质信息聚合的蛋白质功能预测方法
本发明公布了一种基于多源异质信息聚合的蛋白质功能预测方法,首先构建PPI、SSN网络用于提取蛋白特征,然后收集蛋白质结构域、亚细胞位置、信号通路等节点特征,用于蛋白质表征;进一步地,利用图掩码自动编码器(GraphMAE...
张树刚魏志强马文健
基于迁移学习和三通道组合GNN预测蛋白质功能的方法
本发明属于深度学习和生物信息学领域,公开了基于迁移学习和三通道组合GNN预测蛋白质功能的方法,该方法通过解析蛋白质空间结构文件,提取出有不同连接密度的氨基酸残基接触图;基于迁移学习构建氨基酸序列混合特征提取器,以得到氨基...
黎晟石海鹏石海鹤 曾子涵 龚嘉盈 陈彬
基于多模态多注意力融合特征的蛋白质功能预测方法
本发明属于智能细胞生物识别领域,具体涉及一种基于多模态多注意力融合特征的蛋白质功能预测方法。该方法包括:序列特征的编码和预处理,基于接触图的结构信息编码,基于S‑C跨模态交叉注意融合网络的结构与序列特征融合,对于标签(G...
邓赵红何靓雯吴敬未志胜王蕾
一种基于异构网络的多物种蛋白质功能预测方法及系统
本发明公开了一种基于异构网络的多物种蛋白质功能预测方法及系统,所述方法包括:使用ESM‑2模型对蛋白质序列进行特征提取,得到序列特征;构建蛋白质的结构接触图,基于图卷积和层次图池化的结构模型对结构接触图训练,提取结构特征...
李君一 王贝贝 周靖力 施少怀 王轩
基于拓扑感知注意力网络的蛋白质功能预测方法及装置
本发明提出了一种基于拓扑感知注意力网络的蛋白质功能预测方法及装置,其中的方法包括如下步骤S1:获取公开蛋白质功能注释数据集、公开的描述基因本体及关系obo文件;S2:构建蛋白质图输入和基因本体图输入;S3:搭建基于拓扑感...
刘娟张蔷杨锋黄伟鸿

相关作者

付道林
作品数:44被引量:72H指数:5
供职机构:山东农业大学
研究主题:小麦 基因 蛋白质功能 雄性不育基因 抗条锈
吴佳洁
作品数:45被引量:65H指数:5
供职机构:山东农业大学
研究主题:小麦 基因 蛋白质功能 抗条锈 小麦条锈菌
刘强
作品数:32被引量:15H指数:3
供职机构:山东农业大学
研究主题:基因 小麦 小麦条锈菌 蛋白质功能 抗条锈
倪飞
作品数:32被引量:6H指数:1
供职机构:山东农业大学
研究主题:小麦 基因 蛋白质功能 雄性不育基因 抗条锈
郭政
作品数:143被引量:279H指数:8
供职机构:哈尔滨工业大学
研究主题:基因表达谱 基因功能 ONTOLOGY 基因表达 基因芯片