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甘肃酒泉肃州区牛病毒性腹泻病例诊治
2024年
该文阐述了甘肃酒泉市肃州区某养殖场牛病毒性腹泻病例的发病情况,介绍了该病的临床症状、病理变化与实验室诊断方法,说明了针对性治疗与预防措施,有效降低了该疾病造成的损失,确保了养殖安全。
董建文董杰
关键词:牛病毒性腹泻病例临床症状病理变化
2015-2021年宁夏腹泻病例中人星状病毒分子流行病学特征分析被引量:1
2024年
基于宁夏食源性疾病监测系统研究宁夏地区2015-2021年15家哨点医院腹泻病例中的人星状病毒(Human astrovirus,HAstV)感染状况,流行病学特点和基因特征。对收集的粪便标本,采用Real-time PCR方法筛选出的HAstV阳性标本,进行了回顾性分析。通过逆转录PCR对保存的HAstV阳性样本进行测序和基因分型,确定宁夏地区HAstV流行的基因型别和遗传进化。2015-2021年共收集腹泻病例标本8586例,HAstV阳性率为5.9%(513例),其中单独HAstV感染293例(占57%),和其它病毒共同感染220例(占42%),共同感染中与轮状病毒和诺如病毒GII组感染最多见,其次是两种以上病毒感染。感染发生在所有年龄组,5岁以下儿童的阳性率最高(8.0%),11-20岁年龄组阳性率最低(1.9%)。感染全年发生,一月和六月高发。对保存的168份HAstV单独阳性标本进行测序分析,测序获得94条HAstV基因序列,经鉴定为5种基因型别,分别是HAstV-1、HAstV-2、HAstV-3、HAstV-4、 HAstV-5,其中HAstV-1型为最常见的基因型(占61.7%),其次是HAstV-5(占19.1%)和HAstV-4(占15.9%)。系统发育分析显示HAstV-1分别属于HAstV-1a和HAstV-1b亚型,HAstV-1a较常见。HAstV-5和HAstV-4分别属于HAstV-5c和HAstV-4c亚型。全人群均可感染星状病毒,但主要受影响为5岁以下儿童。HAstV-1型是宁夏地区流行的主要型别,同时存在HAstV-1a和HAstV-1b、HAstV-4c、HAstV-5c共循环。
袁芳蒯文和曹慜马学平魏新峰马江涛张薇
关键词:病毒性腹泻星状病毒基因特征
2021-2022年湖州市监测哨点医院感染性腹泻病例沙门菌病原学特征分析
2024年
目的 分析湖州市感染性腹泻患者分离沙门菌的血清型分布、耐药情况及分子分型特征,为沙门菌引起腹泻性疾病的防控、预警、溯源及临床治疗提供科学依据。方法 湖州市2021-2022年6家监测哨点医院分离出126株沙门菌,采用玻片凝集法、微量肉汤稀释法和脉冲场凝胶电泳(PFGE)法,分别进行血清学分型、抗生素最小抑菌浓度测定和分子分型。结果 126株沙门菌可分为28种血清型,优势血清型为鼠伤寒沙门菌单相变种(32.5%,41/126),肠炎沙门菌(24.6%,31/126)及鼠伤寒沙门菌(15.1%,19/126)。不同血清型沙门菌对15种抗生素存在不同程度的耐药性,鼠伤寒沙门菌单相变种对四环素耐药率较高,分别为73.3%(44/60)其次氨芐西林和磺胺甲噁唑的耐药率为56.7%(34/60),鼠伤寒沙门菌对四环素和磺胺甲噁唑的耐药率较高,分别为68.4%(13/19)、52.6%(10/19),肠炎沙门菌对氨苄西林/舒巴坦的耐药率最高为54.8%(17/31),其他沙门菌对四环素的耐药率最高为51.4%(18/35),总体多重耐药率达62.7%(79/126),呈现出20种多重耐药谱。鼠伤寒沙门菌单相及鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌经XbaⅠ酶切后分别获得46种和15种不同PFGE指纹图谱。结论 湖州市沙门菌感染优势血清型以鼠伤寒沙门菌单相变种和肠炎沙门菌为主,沙门菌多重耐药现象严重,PFGE带型既有多样性又具有优势带型。
沈月华纪蕾徐德顺吴晓芳严伟
关键词:沙门菌血清分型分子分型感染性腹泻
2021-2022年广东省5岁以下婴幼儿腹泻病例中A组轮状病毒分子流行病学分析
2024年
目的了解2021-2022年广东省病毒性腹泻监测哨点医院5岁以下腹泻患儿A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)的流行病学和基因型别特征,为RVA疫苗研发提供依据。方法收集2021-2022年5岁以下儿童腹泻患者的粪便标本共1858份,采用ELISA方法检测轮状病毒抗原,对阳性样本进一步测序分型。结果1858份样本中检出RVA阳性样本156例,阳性率8.4%;其中男女患儿的阳性率分别为8.76%、7.87%,男女性别阳性检出率差异无统计学意义;RVA感染在各年龄组检出率差异有统计学意义;RVA感染率从12月逐渐增高,次年1-4月达到高峰;2021年广东地区RVA主要流行株以G9P[8]亚型为主,国内少见的G8P[8]亚型呈上升趋势,2022年G8P[8]亚型检出率首次超越G9P[8]亚型。结论2021-2022年广东省5岁以下婴幼儿腹泻病例中RVA基因型别多样,G8P[8]亚型已成为主要流行基因型之一,仍需持续开展RVA基因型别监测以评估RVA相关疾病的风险。
李彩霞张昌张薇曾汉日郑焕英李柏生柯碧霞
关键词:轮状病毒病毒性腹泻基因分型
上海市2014-2021年肠道门诊15岁及以上感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌流行特征分析
2024年
目的了解上海市肠道门诊≥15岁感染性腹泻病例中致泻性大肠埃希菌(DEC)流行特征,为DEC感染性腹泻防控策略的制定提供科学依据。方法采用多阶段系统抽样方法,在上海市22家监测点医疗机构的肠道门诊开展腹泻症状监测,收集病例的人口学、临床和流行病学资料,同时采集病例粪便标本,送至医疗机构所在区CDC开展DEC检测及鉴定分型,分析比较2014-2021年不同人群和季节的DEC阳性率。统计学分析采用χ^(2)检验。结果在15185例感染性腹泻病例中,DEC的总阳性率为8.05%(1222/15185)。其中男性阳性率(8.74%,684/7824)高于女性(7.31%,538/7361),15~29岁组人群阳性率最高(9.14%,335/3665),2021年阳性率最高(10.21%,83/813),以上差异有统计学意义(均P<0.05)。DEC阳性PCR菌型鉴定分离出菌株1264株中,肠产毒性大肠埃希菌为主(50.24%,635/1264),其次是肠黏附性大肠埃希菌(27.93%,353/1264)和肠致病性大肠埃希菌(21.36%,270/1264)。DEC存在明显季节性流行特征,夏季阳性率最高(13.92%,774/5562)(χ^(2)=495.73,P<0.001)。结论DEC是2014-2021年上海市感染性腹泻患者重要病原体之一,引起的感染性腹泻全年均可发生,夏秋季高发,流行型别为肠产毒性大肠埃希菌、肠黏附性大肠埃希菌和肠致病性大肠埃希菌。应针对不同年龄、不同季节和不同型别的DEC感染性腹泻采取特异性的防控措施。
林声郑雅旭宫霄欢肖文佳俞晓潘浩陈健
关键词:哨点监测肠道门诊感染性腹泻致泻性大肠埃希菌
上海市普陀区儿童感染性腹泻病例病原谱及分子特征
2024年
【目的】了解2018—2023年上海市普陀区儿童感染性腹泻病的病原谱和分子特征,为儿童感染性腹泻防控提供科学依据。【方法】收集2018年1月—2023年12月上海市普陀区儿童腹泻病监测哨点医院就诊病例的粪便标本,通过分离培养11种细菌和实时荧光聚合酶链反应(PCR)检测5种病毒。使用脉冲场凝胶电泳(PFGE)标准分型法分析部分阳性菌株的分子分型;采用逆转录PCR方法扩增部分诺如病毒阳性标本的聚合酶-衣壳蛋白连接区,基因测序后使用生物信息软件进行分析。采用χ^(2)检验或Fisher精确概率法比较2018—2019年和2020—2023年病原体阳性率。【结果】707例病例中,总阳性率为47.67%,单一细菌阳性率为16.27%,单一病毒阳性率为22.63%,混合阳性率为8.77%。优势病原体为轮状病毒(10.75%)、诺如病毒(10.33%)、肠致病性大肠杆菌(8.06%)、沙门菌(6.36%)、肠集聚性黏附大肠杆菌(5.52%)、弯曲菌(5.23%)。夏秋季以细菌感染为主,冬春季以病毒感染为主。2020—2023年的总阳性率较2018—2019年下降(χ^(2)=5.753,P<0.05)。对37株沙门菌、81株肠致泻性大肠杆菌、19株弯曲菌完成PFGE分子分型分析,分别分为28种、80种和18种带型,带型相似度范围较广。19份诺如病毒经GⅡ组基因序列分析分为5种基因型,主要为GⅡ.Pe-GⅡ.4型和GⅡ.P16-GⅡ.2型。【结论】轮状病毒、诺如病毒、肠致泻性大肠埃希菌、沙门菌、弯曲菌为上海市普陀区儿童感染性腹泻的优势病原体,病原谱呈现季节性流行特征,部分病原体的分子特征存在多样性。应在不同季节加强儿童感染性腹泻病原体的分子特征监测,为防控提供实验室依据。
顾文超张焕生唐海丰闫浩吴婷婷桂依琳李强李勇
关键词:儿童感染性腹泻病原谱脉冲场凝胶电泳基因型
2021-2023北京市某区748例腹泻病例中弓形杆菌病原特征分析
2024年
目的基于腹泻病原学监测进行弓形杆菌分离和病原特征分析,为该病原导致腹泻相关研究提供基础数据。方法收集2021—2023年北京市某区腹泻患者基础信息和临床症状信息,采集患者粪便标本进行弓形杆菌培养并使用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行鉴定。分离弓形杆菌进行抗生素敏感性检测和全基因组测序并基于序列进行平均核苷酸一致性(ANI)分析、毒力基因分析和核心基因组单核苷酸多态性分析。结果2021—2023年腹泻患者粪便弓形杆菌检出率为0.80%(6/748),2017年在北京某区腹泻监测中检出2株弓形杆菌,荧光PCR鉴定结果均为布氏弓形杆菌。本地区分离到弓形杆菌的8例腹泻患者中的5例同时分离到其他肠道致病菌。从8例腹泻患者中分离的8株弓形杆菌对不同抗生素耐药株数分别为耐四环素7株、耐氟苯尼考6株、耐链霉素6株、耐阿奇霉素5株、耐克林霉素5株,6株菌耐3类或3类以上抗生素;基于基因组序列的ANI分析确定8株菌均为布氏弓形杆菌。结论北京市某区腹泻患者中分离弓形杆菌以布氏弓形杆菌为优势种,弓形杆菌感染者的临床特征以及分离菌株的病原特异性需要增加菌株数量后继续深入研究。
李颖周贵兰刘雨薇王苗闫爱霞李首飞王园园王海瑞彭涛张茂俊
关键词:腹泻全基因组测序抗生素敏感性
2017—2021年安徽省食源性腹泻病例病原学分析
2024年
目的分析安徽省2017—2021年食源性腹泻病例病原学特征,为制定相关防控措施提供依据。方法采用横断面研究方法,收集2017—2021年安徽省22家食源性疾病病原学监测医院上报被采集肛拭子/粪便的腹泻病例信息,并按要求对采集的患者标本开展病原学检测。分类资料采用χ^(2)_(趋势)或χ^(2)进行组间比较。结果2017—2021年共采集标本15484份,病原体总检出率为23.75%(3678/15484)。其中,诺如病毒检出率最高,为10.01%(1550/15484);其次是沙门菌(6.16%,954/15484)、致泻大肠埃希菌(6.10%,944/15484)、副溶血性弧菌(1.66%,257/15484)、志贺菌(1.00%,155/15484)。不同年份(χ_(2)_(趋势)=11.249,P<0.05)和不同季度(χ^(2)_(趋势)=146.119,P<0.05)病原体的检出率,均差异有统计学意义。各年龄段人群中,年龄<11岁患者的病原体检出率最高(30.29%,1123/3708);学生的病原体检出率较高。可疑暴露食品前3位分别是肉类及其制品(17.62%,648/3678)、粮食及其制品(15.17%,558/3678)和多种食品(13.78%,507/3678)。可疑暴露场所主要是家庭(69.93%,2572/3678)。结论安徽省食源性腹泻病例病原体主要为诺如病毒和沙门菌,总检出率呈逐季度上升趋势,主要可疑暴露食品和场所分别为肉类及其制品和家庭。需要针对不同人群、季节、暴露食品和场所,制定不同的食源性疾病防控措施。
樊勇徐粒子孟灿王志强李卫东
关键词:食源性疾病腹泻病例诺如病毒食源性致病菌
北京市日均气温与日均相对湿度对食源性腹泻病例就诊量影响的时间序列分析
2024年
目的探索日均气温与日均相对湿度对北京市食源性腹泻发病的健康效应。方法收集2018—2023年北京市食源性腹泻病例逐日就诊数据与气象数据,采用分布滞后非线性模型建立日均气温、日均相对湿度与食源性腹泻病例就诊量之间的暴露-反应关系,同时控制时间趋势、星期几效应与节假日效应以及气象因素的混杂影响,分析日均气温、日均相对湿度对食源性腹泻发病风险的滞后效应与累积滞后效应。结果日均气温、日均相对湿度与食源性腹泻发病人数之间的关联均呈非线性关系,食源性腹泻发病风险最低时所对应的日均气温和日均相对湿度分别为-5.7℃和38.4%,其健康效应主要来自高温、高湿。高温(P_(95):29.2℃)对食源性腹泻发病风险的滞后效应在暴露当天达到最大,相对危险度为3.45(95%CI:1.12~10.67),高湿(P_(95):83.5%)对食源性腹泻发病风险的滞后效应无统计学意义;高温、高湿的累积滞后效应均在0~5 d达到最大,累积相对危险度分别为10.10(95%CI:2.23~45.71)、1.59(95%CI:1.06~2.40)。结论高温、高湿可增加北京市食源性腹泻发病风险,且存在滞后效应。
牛彦麟杨军王超张晓媛张百超刘起勇马晓晨
关键词:食源性腹泻
上海市2016-2022年腹泻病例致泻性大肠埃希菌感染的流行特征与耐药分析
2024年
目的掌握上海市腹泻病例致泻性大肠埃希菌(DEC)的感染情况、流行病学特征及耐药情况,为后续监测和防控提供数据支撑。方法基于上海市腹泻病综合监测系统收集2016-2022年肠道腹泻门诊病例的流行病学资料,采集粪便标本,开展DEC检测。基于国家致病菌识别网系统收集2016-2022年药敏监测数据。统计学分析采用χ^(2)检验或Fisher确切概率法。结果在24883例感染性腹泻患者中,DEC阳性率为9.13%(2271/24883),其中单一致病型DEC阳性率为8.83%(2197/24883),混合致病型DEC阳性率为0.30%(74/24883)。DEC阳性主要型别为肠产毒性大肠埃希菌[4.33%(1077/24883)],以≤5岁组人群的DEC阳性率最高[18.48%(22/119)]。2016-2022年DEC阳性率最高月份为7-9月[5.91%(1470/24883)]。2016-2022年市区和郊区的DEC阳性率分别为9.47%(554/5847)和9.02%(1717/19036),市区和郊区的DEC主要型别分别为肠黏附性大肠埃希菌[3.98%(233/5847)]和肠产毒性大肠埃希菌[4.56%(868/19036)]。2016-2019和2020-2022年DEC阳性率分别为9.42%(1821/19330)和8.10%(450/5553),主要型别分别为肠产毒性大肠埃希菌(4.87%,941/19330)和肠黏附性大肠埃希菌(4.70%,261/5553)。耐药菌株的多重耐药率为40.21%(618/1537)。耐药率较高的前三位药物依次为氨苄西林[64.74%(995/1537)]、萘啶酸[58.49%(899/1537)]和四环素[45.09%(693/1537)]。结论相比于2016-2019年,2020-2022年DEC阳性率下降,主要型别由肠产毒性大肠埃希菌转变为肠黏附性大肠埃希菌。多重耐药现象较严重,建议应加强DEC的耐药性持续监测,同时规范临床抗生素的使用。
丰俊夏佳慧庄源徐桢罗嘉远陈涌费加艺吴艺童吴寰宇陈昕张静陈敏
关键词:腹泻致泻性大肠埃希菌肠产毒性大肠埃希菌

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李颖
作品数:84被引量:418H指数:12
供职机构:北京市顺义区疾病预防控制中心
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张爽
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研究主题:腹泻病例 腹泻 脉冲场凝胶电泳 食源性疾病 耐药
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研究主题:腹泻 腹泻病例 食源性疾病 脉冲场凝胶电泳 副溶血性弧菌
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供职机构:北京市顺义区疾病预防控制中心
研究主题:腹泻病例 脉冲场凝胶电泳 耐药 腹泻 食源性疾病
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作品数:26被引量:184H指数:9
供职机构:北京市顺义区疾病预防控制中心
研究主题:腹泻病例 脉冲场凝胶电泳 食源性疾病 耐药 腹泻