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搜索到1278篇“ 甲基化分析“的相关文章

舌黏膜癌变基因组甲基化分析: 2024年; 目的研究舌黏膜癌变过程中基因组甲基化特征,探讨舌癌中DNA甲基化的规律。方法用50 mg/L的4-硝基喹啉-1-氧化物(4NQO)饮水诱导C57BL/6J小鼠舌黏膜癌变,分别取第0、12、28周的舌黏膜(分别代表正常、癌前病变和癌变)进行基因芯片检测和甲基化DNA免疫沉淀测序(MeDIP-Seq),在人舌黏膜组织和人舌癌细胞系中,用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)和飞行质谱检测验证转化生长因子贝塔信号蛋白1(SMAD1)的表达和启动子的甲基化。结果28周较12周和0周舌黏膜的胞嘧啶鸟嘌呤岛(CGI)甲基化水平均升高,12周时启动子甲基化水平高于0周。在0、12和28周期间,208个差异表达基因与启动子中的差异甲基化呈负相关。与正常黏膜相比,细胞系中SMAD1的mRNA上调,同时启动子甲基化水平降低。结论舌黏膜癌变中伴随DNA甲基化修饰异常,舌癌中SMAD1高表达伴启动子低甲基化。; 刘华岳万远邵帅孙家平杨莹代晓明; 关键词：舌癌甲基化差异表达基因

杉虎杂交斑5S rRNA基因甲基化分析被引量：1: 2024年; 核糖体RNA是构成核糖体的重要组成部分,在蛋白质合成过程中起着重要作用。利用雌性棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus)与雄性清水石斑鱼(Epinephelus polyphekadion)杂交,获得在生长、肉质等方面具有一定优势的子代——杉虎杂交斑。对杉虎杂交斑及其亲本5S rRNA基因编码区前1 000 bp、编码区以及非转录区的DNA甲基化水平进行测定和比较分析。结果表明,杉虎杂交斑5S rRNA基因整体甲基化水平(0.418)高于棕点石斑鱼(0.379)和清水石斑鱼(0.037),但与母本棕点石斑鱼不具有显著性差异,与父本清水石斑鱼存在显著性差异。对5S rRNA基因编码区和非转录区的甲基化位点进行分析发现,在棕点石斑鱼与杉虎杂交斑中所有甲基化位点是一致的,但在清水石斑鱼中均未发现这些位点,表明杉虎杂交斑的5S rRNA基因甲基化模式与母本棕点石斑鱼一致。结果阐明了杉虎杂交斑5S rRNA基因的DNA甲基化水平和模式,为石斑鱼杂交育种提供理论基础。; 曹柳黄潇庆陈菁苗卢艳黄海; 关键词：石斑鱼杂交 DNA甲基化

一种DNA条码甲基化分析装置: 本发明涉及生物检测技术领域，尤其涉及一种DNA条码甲基化分析装置。其技术方案包括放置台、调节结构、夹料结构和固定结构，所述放置台上端设置有样品盒；所述调节结构包括固定板、位于固定板下方的移动板；所述夹料结构包括顶板、位于...; 王思振

高灵敏度DNA甲基化分析方法: 提供了用于扩增一定量的基因组甲基化DNA的方法、组合物和试剂盒，该基因组甲基化DNA可进行随后分析和/或测序。其特别适用于少量DNA，包括但不限于无细胞DNA样品。在一些实施方案中，控制聚合酶和甲基转移酶的比例以提供最大...; 何川普拉德尼亚·纳尔赫德赵伯譞刘畅崔晓龙

高灵敏度DNA甲基化分析方法: 提供了用于扩增一定量的基因组甲基化DNA的方法、组合物和试剂盒，该基因组甲基化DNA可进行随后分析和/或测序。其特别适用于少量DNA，包括但不限于无细胞DNA样品。在一些实施方案中，控制聚合酶和甲基转移酶的比例以提供最大...; 何川普拉德尼亚·纳尔赫德赵伯譞刘畅崔晓龙

诱导山羊成纤维细胞转分化为乳腺上皮细胞的全基因组DNA甲基化分析: 2024年; 为了获得山羊成纤维细胞转分化为乳腺上皮细胞过程的DNA甲基化水平和模式等表观遗传差异,试验采用全基因组甲基化测序(WGBS)技术对山羊成纤维细胞和转分化得到的乳腺上皮细胞进行DNA甲基化水平的检测和差异甲基化区域(DMR)分析,通过检测分析差异甲基化区域和差异甲基化基因解析甲基化参与山羊耳缘成纤维细胞转分化为乳腺上皮细胞的过程,探讨甲基化对乳腺上皮细胞发育调控的影响。结果表明:通过对WGBS文库数据的统计,共有2个测序样本的Q30值大于90.86%,分别被命名为DGFF5i8d和DGFF,即为诱导8 d转分化后的乳腺上皮细胞和山羊成纤维细胞。2个测序样本共检测到361个差异甲基化区域(其中130个上调差异甲基化区域和231个下调差异甲基化区域)和866个差异甲基化基因,对差异甲基化基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析,筛选出旁粒相关基因(PSPC1)、斑点型POZ蛋白(SPOP)、丝氨酸蛋白酶14(ST14)、X染色体连锁凋亡抑制因子相关因子(XAF1)、跨膜受体蛋白(Notch2)、黏着斑蛋白(VCL)、酸敏感离子通道(ASIC2)等7个与乳腺上皮发育相关的基因,并绘制出了成纤维细胞和乳腺上皮细胞全基因组甲基化图谱。说明本试验检测到的差异甲基化基因可能通过表观遗传调控机制参与调节乳腺发育过程。; 孙哲王国栋刘权辉雷志刚黄奔; 关键词：山羊转分化乳腺上皮细胞全基因组甲基化

用于通过核酸甲基化分析检测癌症的方法和系统: 本公开提供了用于筛查或检测肿瘤或跟踪疾病进展的方法和系统，其可以应用于无细胞核酸，诸如无细胞DNA。所述方法可以使用对在已鉴定的基因组区域中的单次测序读取内的甲基化信号的检测作为输入特征来训练机器学习模型，并生成适用于对...; 史瓦妮·马哈詹比利·古尔德彼得·乌尔兹

PROSER2基因在牛中的印记表达和DNA甲基化分析: 2024年; 为了研究牛PROSER2基因的印记状态和表观遗传修饰机制,本研究首先应用荧光定量RT-PCR方法分析PROSER2基因在牛组织和胎盘中的表达,进而应用基于单核苷酸多态性(SNP)的RT-PCR产物直接测序法分析等位基因表达状态,最后采用亚硫酸盐直接测序法对位于PROSER2基因启动子及第1个外显子区域和位于外显子4区域的2个CpG岛的甲基化状态进行了分析。结果显示,PROSER2基因在所有检测的6个组织(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大脑)及胎盘中均广泛表达。PROSER2基因在牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大脑以及胎盘中均为单等位基因表达。根据杂合胎盘父母的基因型,发现PROSER2基因在牛中是父源印记基因,这与其在人中的印记状态一致。对PROSER2基因启动子和第一个外显子处CpG岛区域的甲基化状态进行分析,在牛的心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、大脑和胎盘中均发现1个差异甲基化区,说明DNA的甲基化修饰可能参与PROSER2基因在荷斯坦奶牛中的印记表达。本研究结果可为进一步研究PROSER2基因的功能和印记调控机制提供参考依据。; 张银蛟杨利丹郑云畅李树静余文莉陈玮娜李世杰; 关键词：DNA甲基化基因组印记表观遗传

液相色谱-质谱联用法在DNA甲基化分析中的重要应用: 2024年; 针对DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,对基因表达调控和细胞命运决策具有深远影响。传统的DNA甲基化分析方法存在灵敏度和特异性不足的问题。近年来,质谱技术因其高灵敏度和高准确度,在DNA甲基化分析中显示出巨大的潜力,在基因表达调控、细胞分化以及疾病发生发展等过程中起着至关重要的作用。本文旨在探讨质谱技术在DNA甲基化分析中的应用,包括技术原理、研究意义、国内外研究现状、检测方法的进展与应用,以及分析研究方法的确立,将对LC-MS方法在DNA甲基化修饰分析中的高灵敏度和准确性进行详细讨论,并探讨其在未来表观遗传学研究中的潜在应用价值。; 孙和平; 关键词：DNA甲基化液相色谱-质谱联用

低盐胁迫下三疣梭子蟹Aldh基因的表达及DNA甲基化分析: 2024年; 为探究三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)耐低盐性状的表观遗传调控机制,对三疣梭子蟹(体质量为35.5 g±2.8 g)醛脱氢酶(Aldh)的基因结构、相似性、系统进化、组织表达,以及低盐胁迫下的基因表达、丙二醛(MDA)含量和DNA甲基化模式进行了研究。结果表明:三疣梭子蟹Aldh基因的保守结构域与中华绒螯蟹的保守结构域相似性最高;实时荧光定量PCR分析显示,Aldh基因在三疣梭子蟹各个组织中均有表达,其中在鳃中的表达水平最高,低盐胁迫下该基因的表达水平显著降低(P<0.05),MDA含量显著增加(P<0.05);亚硫酸氢盐测序法(BS-PCR)分析显示,低盐胁迫72 h后该基因的甲基化水平显著增加,与基因表达呈负相关性(P<0.05)。研究表明,低盐环境下DNA甲基化可能通过抑制Aldh基因表达,导致体内MDA浓度升高从而造成组织损伤。本研究结果为三疣梭子蟹耐低盐性状的表观遗传调控机制解析提供了重要参考依据。; 郭俊阳吕建建孙东方周现法刘萍刘萍; 关键词：三疣梭子蟹 DNA甲基化基因表达

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