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如皋遗传多样性研究
2024年
如皋是江苏省地方优良种质资源。为阐明如皋的遗传多样性和母系起源,采用PCR和测序技术研究了如皋群体的线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)控制区(displacement loop D-loop)序列,并和GenBank数据库中的红原序列构建系统发育树。如线粒体D-loop区序列全长为1231~1232bp,碱基组成为16.4%G、29.3%C、22.8%A和31.5%T;检测到的变异位点数为31个,其中简约性信息位点为24个,单一变异位点为7个。如皋群体共发现的23种单倍型,可以分为A~C、E和G等5个母系单倍群,单倍型分布分别为8、6、5、2和2。序列平均核菩酸差异为7.088,单倍型多样度为0.909±0.023,核苷酸多样度为0.00820±0.00131。从线粒体水平来看,如皋群体母系来源呈多样性,遗传多样性的水平较高,可开发利用的潜力较大。本研究将为如皋种质资源的的进一步评价研究、保存和利用提供参考。
王娟陆俊贤贾晓旭
关键词:如皋黄鸡D-LOOP区母系起源
如皋CEBPA基因克隆、生物信息学分析及表达载体构建
2024年
【目的】试验旨在探究CCAAT/增强子结合蛋白α(CCAAT/enhancer binding protein alpha,CEBPA)基因在如皋中的生物学特征、组织表达水平,并构建其表达载体。【方法】对如皋CEBPA基因CDS区进行克隆并测序,与其他物种进行相似性比对及系统进化树构建,通过生物信息学软件对如皋CEBPA蛋白的理化性质、磷酸化位点、糖基化位点、功能结构域、互作蛋白及二级结构、三级结构进行预测。利用实时荧光定量PCR技术检测CEBPA基因在如皋心脏、肝脏、肺脏、肾脏、十二指肠、空肠、腺胃、肌肉、睾丸中的表达情况。构建CEBPA基因过表达(OE-CEBPA)和干扰载体(CEBPA-sh12,CEBPA-sh167,CEBPA-sh727),并检测各载体活性。【结果】如皋CEBPA基因CDS区序列全长975 bp,共编码324个氨基酸。相似性比对结果显示,如皋与日本鹌鹑、鸿雁、野鸽、野鸭的CEBPA氨基酸序列相似性均>94%,其中与日本鹌鹑的相似性最高,达99.4%;系统进化树结果表明,如皋与日本鹌鹑的亲缘关系较近,与哺乳动物的亲缘关系较远。如皋CEBPA蛋白为亲水不稳定蛋白,存在25个磷酸化位点,含9个N-糖基化位点和109个O-糖基化位点;CEBPA蛋白具有1个转录激活区和1个与DNA结合的亮氨酸拉链结构bZIP;如皋CEBPA蛋白二级结构主要由193个无规则卷曲、93个α-螺旋、25个延伸链和13个β-转角组成,三级结构预测结果与二级结构基本一致;CEBPA蛋白主要与TRIB1、PPARG、RXRA、MAPK9、MAPK10、JUN、ESR1等蛋白互作。CEBPA基因在如皋各组织中均有表达,其中以肝脏中表达量最高。成功构建CEBPA过表达载体和3个干扰载体,将它们分别转染至成纤维细胞,与对照组相比,过表达组(OE-CEBPA)CEBPA基因表达量显著升高(P<0.05),干扰组(CEBPA-sh167)CEBPA基因表达量显著下降(P<0.05)。【结论】试验获得如皋CEBPA基因完整CDS区并成功构建与筛选�
孔瑞红谢可王旭王旭刘吉英王颖洁
关键词:如皋黄鸡生物信息学表达载体构建
如皋miR-1458与TBX6靶向关系验证
2023年
研究旨在探究miR-1458与TBX6的靶向调控关系。试验基于前期建立视酸(Retinoic acid,RA)体外诱导胚胎干细胞(ESCs)向精原干细胞(SSCs)的分化模型,通过RNA-seq测序结果发现ESCs向SSCs分化过程中差异表达的miR-1458,采用miRNA定量检测miR-1458在ESCs/SSCs中的表达量,miR-1458靶基因富集通路分析筛选出富集通路,分析其与生殖细胞发育的相关性。基于前期联合分析RA诱导ESCs的mRNA-seq数据中|log2(fold change)|>8筛选出的与miR-1458互作的差异性mRNA,依据靶基因预测软件数据库在线预测该基因与miR-1458是否存在结合位点,利用qRT-PCR验证两者的关系,同时利用同源重组法将靶基因的3′UTR及点突变序列插入pMIR-REPORT^(TM)双荧光素酶报告载体中,共转染DF-1细胞,通过双荧光素酶报告载体确定miR-1458与TBX6的靶向调控关系。结果显示:ESCs向SSCs分化过程中差异表达miR-1458,miR-1458在生殖细胞分化过程中发挥重要作用;miR-1458与TBX63′UTR存在结合位点;miR-1458和TBX6分别在ESCs和SSCs中呈现此消彼长的表达趋势;miR-1458能够抑制TBX6的表达;miR-1458可靶向TBX63′UTR区调节TBX6的表达。研究表明miR-1458在的ESCs和SSCs中呈现差异性高表达,并且miR-1458能够直接靶向调控TBX63′UTR区从而调节TBX6的表达,为后续研究miR-1458在SSCs形成过程中的机制探究奠定基础。
耿晴晴程富富胡菜武嵘峰吴宇慧赵宗仪赵梓多张亚妮
关键词:如皋黄鸡
一种基于非标定量蛋白质组学技术寻找如皋不同细胞或组织间差异表达蛋白的方法
本发明涉及一种基于非标定量蛋白质组学技术寻找如皋不同细胞或组织间差异表达蛋白的方法,包括以下步骤:(1)不同细胞或组织的组织或细胞蛋白提取;(2)对步骤(1)中得到的不同组的细胞或组织蛋白进行胰酶酶解;(3)酶解后...
左其生靳锴李碧春张亚妮孙红艳
AA肉如皋海马和下丘脑GR和FKBP5的表达及其与应激敏感性的关系
2023年
旨在探究肉海马和下丘脑糖皮质激素受体(glucocorticoid receptor,GR)及其负反馈因子FK-506结合蛋白5(FK-506 binding protein,FKBP5)的表达是否与应激敏感性有关。选用35日龄的AA肉如皋,连续10 d皮下注射皮质酮(corticosterone,CORT),建立慢性应激模型。对应激后AA肉如皋的体重、采食量、行为、血浆生化指标等进行检测,比较应激敏感性的差异。通过qPCR和Western blot检测海马和下丘脑GR和FKBP5的表达,并与血浆CORT水平进行相关分析。结果表明:1)AA肉在CORT处理后体重显著降低,紧张性不动持续时间和血浆CORT水平均显著增加,但如皋变化均不显著;AA肉如皋血液异嗜性粒细胞/淋巴细胞比率在CORT处理后均显著上调,但AA肉显著高于如皋。2)基础状态下,如皋海马和下丘脑GR蛋白表达量显著高于AA肉;CORT处理导致AA肉如皋海马和下丘脑GR蛋白表达显著下调,但应激后如皋GR蛋白表达量仍显著高于AA肉。3)CORT诱导AA肉海马和下丘脑FKBP5 mRNA和蛋白表达均显著上调,而如皋海马和下丘脑FKBP5的上调只发生在蛋白水平,mRNA的表达量没有变化;应激后AA肉FKBP5的蛋白表达量显著高于如皋。4)血浆CORT水平与海马和下丘脑中GR蛋白表达量呈负相关,与FKBP5蛋白表达量呈正相关;海马和下丘脑中GR与FKBP5的蛋白表达量呈负相关。以上结果表明,AA肉如皋应激敏感性的差异与海马和下丘脑GR和FKBP5的表达及其调控有关。
刘杰丛玮赵敏蝶赵茹茜
关键词:肉鸡应激海马下丘脑
42日龄如皋体重间接遗传效应分析被引量:1
2022年
【目的】动物个体遗传物质除了调控自身表型之外,还通过资源分配或行为互动影响同伴性能表现,称之为间接遗传效应。畜禽选育时,遗传模型如果包含了间接遗传效应,不仅有利于改善个体间社会关系,还可以获得更多的遗传进展。研究以饲养于群体笼内如皋为试材,以间接遗传模型评估体重数据,旨在为如皋选育提供支持。【方法】体重数据采集自如皋选育群体,试验于42日龄称重,收集原始数据11983条。数据清洗包括去除超出三倍标准差的离群值、去除翅号遗失个体、去除性别不明个体以及去除单笼养殖量少于4只的记录。系谱数据包含12208只:11735只有体重记录,473只没有体重记录;10560只没有后代,1648只有后代,其中种公208只,种母1440只。以SPSS软件中的单因素方差分析检验环境因素对体重的影响,确定列入固定效应的因子。应用经典动物模型、间接遗传模型分析如皋早期体重方差组分及遗传参数,并检验间接遗传方差是否存在稀释效应。遗传模型中包括一般固定效应、固定回归项、加性遗传效应、间接遗传效应、共同环境效应以及残差。研究中,以单笼养殖量作为固定回归项,将加性遗传效应、间接遗传效应、共同环境效应列为随机项。稀释参数起始值设定为0,依次以0.1幅度递增至1.0,经AIC、BIC筛选,稀释参数宜设定为0。由于残差异质化处理没有改变遗传参数和方差组分,因此残差做同质化处理。以WOMBAT软件分析方差组分及遗传参数,计算结果达到收敛标准。【结果】影响如皋体重的固定效应包括批次、层级、性别;42日龄如皋体重受间接遗传效应影响,加性遗传力为0.54±0.02,总遗传力为0.66±0.06;同笼如皋个体间以互助关系为主,加性遗传与间接遗传选择方向一致,遗传相关系数为0.41;育成期如皋间接�
郭军王克华韩威窦套存王星果胡玉萍马猛曲亮
关键词:如皋黄鸡遗传力体重
如皋不同产蛋时期卵巢卵泡变化规律分析
2022年
为探索不同产蛋时期如皋卵巢卵泡变化规律,选取预产期(16周龄)、产蛋初期(20周龄)、产蛋高峰期(27周龄)、产蛋末期(64周龄)如皋,对输卵管、卵巢重量、等级前卵泡数进行统计,同时卵巢进行组织切片HE染色后对原始、初级、次级卵泡进行了观察和测量统计,对不同阶段卵泡的数量变化进行了比较分析。结果表明:随产蛋时期的推进,卵巢、输卵管重呈上升趋势,4种等级前卵泡数量在产蛋高峰期达最高值;次级卵泡数量在预产期最高,不同直径的次级卵泡数量在产蛋期进程中变化规律有所不同;此外,初级卵泡平均直径在不同产蛋时期亦有差异。
丁悦张金璧周欣怡梁多敏陈宽凤张艳婧谢永锋邱家宝徐世永
关键词:卵巢如皋黄鸡
育成期饲粮代谢能水平对开产时如皋生长发育的影响被引量:4
2022年
本试验旨在研究8~18周龄饲粮代谢能(ME)水平对8周龄至开产时(20周龄)如皋生长性能以及屠体、内脏器官、冠、骨骼、消化道和繁殖器官发育的影响。试验选用8周龄体况良好、体重接近的如皋360只,随机分成3组,每组8个重复,每个重复15只。8~18周龄,试验分别饲喂ME水平为10.88、11.30和11.72 MJ·kg^(-1)、其它营养素水平相同的试验饲粮,18周龄~开产(20周龄),各组试验均饲喂相同营养水平的预产期试验饲粮。试验期12周。结果表明:1)随8~18周龄饲粮ME水平增加,蛋18周龄体重、8~18周龄平均日增重(ADG)和平均日代谢能摄入量(MEi)均显著线性增加(P<0.05),8~18周龄和8~20周龄料重比(F/G)和粗蛋白质转化比(CPCR)均显著线性减小(P<0.05)。2)8~18周龄饲粮ME水平对18和20周龄如皋屠体、内脏器官和消化道发育均无显著影响(P>0.05)。3)18周龄蛋胫骨重和胫骨率均随8~18周龄饲粮ME水平增加先减小后增加(P<0.05)。8~18周龄饲粮ME水平对18周龄冠和股骨以及20周龄冠、胫骨和股骨发育均无显著影响(P>0.05)。4)18周龄蛋卵巢基质指数和小卵泡指数均随8~18周龄饲粮ME水平增加显著线性增加(P<0.05),8~18周龄饲粮ME水平对18周龄其它繁殖器官以及20周龄各繁殖器官发育均无显著影响(P>0.05)。由此可知,8~18周龄饲粮ME水平为11.72 MJ·kg^(-1)时,能显著增加18周龄体重和8~18周龄ADG,改善8~18周龄F/G和CPCR,促进卵巢基质和小卵泡发育,但饲粮ME水平对开产时(20周龄)蛋生长发育指标均无显著影响。本研究表明,将蛋育成期和预产期结合研究具有更重要的实践意义。
卢建王克华王克华王星果王星果李永峰马猛窦套存胡玉萍郭军李尚民
关键词:如皋黄鸡代谢能育成期开产
饲粮粗蛋白质水平对8~20周龄如皋生长发育的影响被引量:4
2022年
本试验旨在研究8~18周龄饲粮粗蛋白质(CP)水平对开产前(8~20周龄)如皋生长性能以及屠体、内脏器官、冠、骨骼、消化道和繁殖器官发育的影响。选用8周龄体况良好、体重接近的如皋600只,随机分成5组,每组8个重复,每个重复15只。8~18周龄,试验分别饲喂CP水平为14.00%、14.75%、15.50%、16.25%和17.00%,代谢能水平相同的试验饲粮;18~20周龄(开产时),试验均饲喂相同营养水平的预产期饲粮。试验期12周(8~20周龄)。结果表明:1)随饲粮CP水平增加,18周龄体重和8~18周龄平均日增重(ADG)均显著线性降低(P<0.05),8~18周龄平均日粗蛋白质摄入量(ADCPI)、粗蛋白质转化比(CPCR)、代谢能转化比(MECR)和料重比(F/G)以及8~20周龄ADCPI和CPCR均显著线性增加(P<0.05)。2)饲粮CP水平为14.75%组18周龄卵巢基部重显著高于饲粮CP水平为14.00%、15.50%和17.00%组(P<0.05)。3)除脚率和腺胃相对重量外,饲粮CP水平对18和20周龄屠体、内脏器官、冠、胫骨、股骨、消化道和繁殖器官发育指标均无显著影响(P>0.05)。由此可见,8~18周龄饲粮CP水平为14.75%时,能显著增加18周龄蛋体重和8~18周龄蛋ADG,改善8~18周龄蛋F/G、CPCR和MECR,促进卵巢基部发育,但除脚率和腺胃相对重量外,饲粮CP水平对开产时(20周龄)蛋生长发育指标均无显著影响。
卢建曲亮曲亮马猛马猛李尚民李永峰郭军王星果窦套存胡玉萍
关键词:如皋黄鸡粗蛋白质育成期
饲粮代谢能水平对3~8周龄如皋生长发育和血清生化指标的影响被引量:7
2022年
本试验旨在研究饲粮代谢能(ME)水平对3~8周龄如皋生长发育和血清生化指标的影响。选用2周龄体况良好、体重接近的如皋900只,随机分成5组,每组6个重复,每个重复30只。各组试验分别饲喂ME水平为11.11、11.51、11.92、12.34和12.78 MJ/kg的试验饲粮。预试期1周,正试期6周。结果表明:1)随饲粮ME水平增加,5和8周龄蛋体重,8周龄跖长,6~8周龄和3~8周龄平均日采食量(ADFI)和平均日粗蛋白质摄入量(ADCPI),3~5周龄和3~8周龄平均日增重(ADG)以及3~5周龄、6~8周龄和3~8周龄平均日代谢能摄入量(ADMEI)均呈先降低后升高的二次曲线变化(P<0.05);8周龄体重变异系数(CV)及3~5周龄和3~8周龄代谢能转化比(MECR)均呈先升高后降低的二次曲线变化(P<0.05);3~5周龄、6~8周龄和3~8周龄料重比(F/G)和粗蛋白质转化比(CPCR)均线性降低(P<0.05)。2)除翅膀率和肝脏率外,饲粮ME水平对屠体、免疫器官和消化道发育指标均无显著影响(P>0.05),肝脏率随饲粮ME水平增加线性降低(P<0.05)。3)股骨长和胫骨强度均随饲粮ME水平增加呈先降低后升高的二次曲线变化(P<0.05)。4)随饲粮ME水平增加,血清尿素氮(UN)含量呈先降低后升高的二次曲线变化(P<0.05),而血清高密度脂蛋白(HDL)和低密度脂蛋白(LDL)含量分别线性升高和降低(P<0.05)。由此可见,3~8周龄如皋饲粮ME水平为11.11和12.78 MJ/kg时能获得较好的生长性能,12.78 MJ/kg饲粮组F/G、CPCR、跖长及血清HDL、LDL和UN含量等指标均表现出优势。
卢建王克华王克华马猛马猛李永峰李尚民郭军王星果窦套存胡玉萍
关键词:如皋黄鸡代谢能生长发育

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王克华
作品数:459被引量:1,815H指数:22
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:蛋鸡 如皋黄鸡 遗传力 蛋品质 体重
曲亮
作品数:298被引量:623H指数:12
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:蛋鸡 遗传育种 遗传力 如皋黄鸡 碱基
窦套存
作品数:289被引量:545H指数:11
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:蛋鸡 遗传育种 遗传力 周龄 碱基
郭军
作品数:260被引量:506H指数:10
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:蛋鸡 遗传育种 遗传力 碱基 产蛋
胡玉萍
作品数:185被引量:199H指数:8
供职机构:中国农业科学院家禽研究所
研究主题:蛋鸡 遗传育种 遗传力 碱基 产蛋