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云南省输入性间日疟原虫多药抗性蛋白1基因突变多态性分析: 2023年; 目的分析云南省输入性间日疟原虫的多药抗性蛋白1基因(Pvmdr1)突变多态性。方法对云南省2020年和2021年诊断为间日疟原虫感染的病例血样进行Pvmdr1全基因扩增及测序,以间日疟原虫Sal‑Ⅰ分离株的序列(GenBank登录号:NC_009915.1)为模板设计PCR反应引物,用MEGA 5.04软件与编码区参比序列(GenBank登录号:XM_001613678.1)进行比对,用DnaSP 6.11.01软件分析单倍型和单核苷酸多态(SNP)位点及其突变类型,并计算核酸多样性指数π、单倍型期望杂合度(He)等,用Network 10.0软件构建中介网络进化图。结果共收集276份输入性间日疟患者血样,其中自缅甸感染病例占99.3%(274/276),自非洲、巴基斯坦感染各占0.4%(1/276)。259份血样扩增获得4392 bp的Pvmdr1全基因序列,提交GenBank获得的登录号为OP559204~OP559462。259条DNA序列π、Ka/Ks比值分别为0.00076和3.6006,共检出22个SNP,包括13个非同义突变和9个同义突变。仅c.4074C>T位点突变在2020、2021年的检出率[15.0%(21/140)、5.9%(7/119)]差异有统计学意义(χ^(2)=5.546,P<0.05)。次等位位点为c.1587A>G(97.9%,253/259),新检出SNP包括c.2499G>T(2.3%,6/259)、c.3358C>T(0.4%,1/259)、c.3832C>T(0.4%,1/259)。c.3064C>T、c.4065A>G、c.3358C>T和c.3832C>T突变位点仅在2021年的患者血样中检出,其中前2个SNP从非洲感染的分离株中检出,后2个SNP从缅甸感染的分离株中检出。259条Pvmdr1完整编码区与参比序列(单倍型Hap_1)比对,识别出26种单倍型(Hap_2~Hap_27),均为参比序列(单倍型Hap_1)的突变型,He为0.8907。其中,Hap_8的检出率最高(18.5%,48/259),非洲感染分离株中仅检出Hap_19。2020、2021年的患者血样中检出的单倍型种类分别有15和22种,当年独有的单倍型分别为4和10种。Hap_10在2020、2021年患者血样中的检出率分别为15.0%(21/140)和3.4%(4/119),差异有统计学意义(χ2=22.264,P<0.05)。不同单倍型的多重突变识别结果显示,4重、5重、6重、7重、9重、10�; 丁红芸董莹徐艳春邓艳刘言吴静陈梦妮张苍林; 关键词：间日疟原虫突变

ABC转运蛋白及其相关的多药抗性研究现状被引量：5: 2022年; ABC(ATP-binding cassette)转运蛋白是一类家族庞大、功能多样的跨膜转运蛋白,其广泛存在于原核和真核生物的各类细胞器中,负责多种物质的跨膜转运,从而调节生物体的一系列生命活动。近年来,越来越多ABC转运蛋白的种类及功能被报道,但是ABC蛋白家族的潜在成员以及功能仍然值得进一步探究和挖掘。该文对不同物种中ABC转运蛋白数量、结构域、功能、研究方法以及其参与调控病原菌多药抗性的研究现状进行综述,并对植物病原菌多药抗性的治理等进行展望。; 孙铭优吴照晨王斌王婷婷李雪明宋佳露刘鹏飞刘西莉; 关键词：ABC转运蛋白蛋白结构基因功能多药抗性

江苏省域草莓灰霉病菌种群多药剂抗性检测被引量：5: 2022年; 本研究旨在阐明江苏省草莓主产区草莓灰霉病菌种群对常用杀菌剂的敏感性。采用区分剂量法测定了2019和2020年采集的236株草莓灰霉病菌(Botrytis cinerea)对13种杀菌剂的抗性,并对菌株抗性频率和多药剂抗性进行了分析。结果表明:所有灰霉菌株对咯菌腈(fludioxonil,Flu)表现敏感,而对多菌灵(carbendazim,Car)、吡唑醚菌酯(pyraclostrobin,Pyra)、扑海因(iprodione,Ipr)、腐霉利(procymidone,Pro)、嘧霉胺(pyrimethanil,Pyr)产生了较高的抗药性,其抗性频率分别为58.05%、55.01%、51.44%、45.80%、33.94%;灰霉病菌种群在地区间对不同药剂的抗药性水平不同,溧水、昆山、姜堰、铜山田间以抗性菌株为优势种群,无锡和常州新北地区以敏感菌株为主;本研究在区分计量浓度下,根据各药剂抑菌率分布状况,将供试药剂分为敏感药剂、敏感性下降药剂和抗性药剂3种类型;本研究共检测到9种抗药性类型:Pyra^(R)(7.32%)、Car^(R)(6.50%)、Pyr^(R)(0.81%)、Car^(R) Pyr^(R)(3.25%)、Car^(R) Pyra^(R)(14.63%)、Car^(R) Bos^(R)(1.63%)、Car^(R) Pyra^(R) Pyr^(R)(23.58%)、Car^(R) Bos^(R) Pyra^(R)(7.31%)、Car^(R) Bos^(R) Pyra^(R) Pyr^(R)(34.15%)。江苏省草莓灰霉病菌种群对多菌灵和吡唑醚菌酯基本丧失了敏感性,对扑海因、腐霉利、啶酰菌胺、戊唑醇等敏感性下降,多药剂抗药性种群以Car^(R) Pyra^(R) Pyr^(R)和Car^(R) Bos^(R) Pyra^(R) Pyr^(R)为主,抗性治理措施中推荐使用不同类型药剂交替防治灰霉病。; 肖婷钱荣明张富荣周斌吴惠秋季森宋俊贤庄义庆杨敬辉; 关键词：草莓灰霉病菌

长沙市122例输入性恶性疟原虫多药抗性基因1拷贝数变异分析: 2022年; 为了解输入性恶性疟原虫多药抗性基因1 (Pfmdr1)拷贝数变异(CNV)情况,对长沙市2016—2019年输入的恶性疟患者滤纸干血斑样品中Pfmdr1与恶性疟原虫微管蛋白基因(Pftub)进行实时荧光定量PCR检测,以Pftub基因为参比基因,计算获得样品的Pfmdr1 CNV值。采用SPSS 23.0统计学软件对检测结果和治疗信息进行统计分析。结果显示,122份血样中有18份发生Pfmdr1 CNV变异,变异率为14.8%(18/122)。2016—2019年血样Pfmdr1 CNV均值分别为1.020±0.076、 1.136±0.403、 1.387±0.657和1.142±0.349。变异血样输入地来源为赤道几内亚、安哥拉、贝宁、塞拉利昂、刚果民主共和国、尼日利亚、喀麦隆、加纳和刚果共和国。输入地为东非、西非和中非的患者血样Pfmdr1 CNV均值分别为0.999±0.073、 1.150±0.368和1.249±0.448。东非和西非、中非相比差异有统计学意义(t=2.663、 3.995,P <0.05)。变异血样的患者平均用药时长为(5.93±0.94) d,长于非变异血样患者的(3.21±1.23) d (t=8.930,P <0.01)。治疗结束后1个月变异血样的患者再燃2例,非变异血样的患者再燃1例(似然比χ^(2)=3.831,P <0.05)。治疗结束后1年变异血样的患者再燃2例,非变异血样的患者再燃1例(似然比χ^(2)=5.372,P <0.05)。血涂片中存在配子体的变异血样5例,非变异血样3例(似然比χ^(2)=10.599,P <0.01)。长沙市输入性恶性疟原虫存在Pfmdr1 CNV变异,变异会造成患者治疗时间延长和原虫不能完全清除。; 田斌廖瑜文岚肖芳张兵申晓君; 关键词：疟疾恶性疟原虫拷贝数变异

植物病原菌对杀菌剂多药抗性的发生现状被引量：10: 2021年; 近年来,随着杀菌剂在农作物病害田间防治中的大量使用,植物病原菌的多药抗性(multidrug resistance,MDR)现象发生越来越普遍。本文综述了在草坪币斑病、灰霉病、小麦叶枯病和苹果青霉病等病害防治中,病原菌对杀菌剂多药抗性发生的情况。以及在紫外诱导和杀菌剂离体驯化下,致病疫霉Phytophthora infestans、立枯丝核菌Rhizoctonia solani、指状青霉Penicillium digitatum的多药抗性发生情况。分析了导致植物病原菌多药抗性产生的外排转运蛋白过表达、解毒酶代谢和靶标位点变化等相关机制,并在此基础上提出了多药抗性预防和治理的策略,以期为田间杀菌剂的高效利用,延缓药剂的抗性风险提供科学参考。; 宋佳露程星凯刘鹏飞刘西莉; 关键词：植物病原菌多药抗性抗性机制抗性治理

我国葡萄灰霉菌对主要杀菌剂的抗药突变型分布与多药抗性机制研究: 由灰葡萄孢（Botrytis cinerea）引起的葡萄灰霉病主要使用化学杀菌剂进行防治，但该病菌已对多种杀菌剂产生不同程度的抗性。本研究对黑龙江省哈尔滨市、辽宁省北镇市、山东省蓬莱市、山西省太谷县、湖北省荆州市和云南省...; 贾爽爽; 关键词：杀菌剂抗药性基因突变多药抗性; 文献传递

厚壳贻贝多药抗性蛋白Abcc--一种新型海洋生物污染检测标记物: 本发明公开了厚壳贻贝多药抗性蛋白Abcc，多药抗性蛋白Abcc为克隆基因，通过基因克隆技术克隆厚壳贻贝Abcc的基因核心片段获得，本发明还公开一种新型海洋生物污染检测标记物，用厚壳贻贝作为检测海洋污染的生物样本，厚壳贻贝...; 祁鹏志董文强任世太郭宝英; 文献传递

河南省输入性恶性疟原虫多药抗性基因1和K13基因的突变分析: 2018年; 目的对河南省2013-2015年输入性恶性疟原虫多药抗性基因1(Pfmdr1)和K13基因进行检测,分析其基因突变情况。方法采集河南省2013-2015年自非洲返乡的被确诊为输入性恶性疟患者的血样,并收集病例的相关信息。提取患者血样中疟原虫基因组DNA,巢式PCR扩增Pfmdr1和K13基因,对扩增序列进行测序、比对,分析基因的突变情况。结果386例输入性恶性疟患者以男性青壮年为主,自26个非洲国家返乡,其中病例数居前3位的输入来源国为安哥拉、赤道几内亚和尼日利亚,其病例数分别占总病例数的22.5%(87/386)、13.7%(53/386)和13.2%(51/386)。386份血样均成功扩增出Pfmdr1和K13基因。测序结果显示,Pfmdr1的86和1246位点的突变率分别为23.6%(91/386)和3.1%(12/386),K13基因的突变率为5.4%(21/386)。21份K13基因突变的血样来自于安哥拉、赤道几内亚和尼日利亚等10个国家,未发现C580Y突变。在来自安哥拉和赤道几内亚的血样中检测到2个与青蒿素抗性相关的突变,分别为R539T和P574L,突变率均为0.3%(1/386)。2013-2015年,Pfmdr1的86位点的突变率分别为28.8%(36/125)、23.4%(32/137)和18.6%(23/124),各年份突变率的差异有统计学意义(χ~2=6.438,P<0.05);1246位点突变率分别为4.0%(5/125)、3.7%(5/137)和1.6%(2/124),各年份突变率的差异无统计学意义(χ~2=1.384,P>0.05);K13基因的突变率分别为3.2%(4/125)、8.8%(12/137)和4.0%(5/124),各年份突变率的差异无统计学意义(χ~2=4.631,P>0.05)。结论Pfmdr1的86和1246位点的突变率分别为23.6%(91/386)和3.1%(12/386),K13基因的突变率为5.4%(21/386),发现了与青蒿素抗性相关的R539T和P574L位点突变。; 杨成运李素华张雅兰周瑞敏刘颖钱丹赵玉玲许汴利张红卫邓艳; 关键词：输入性疟疾恶性疟原虫突变

小麦野生近缘植物多药抗性基因PDR7的生物信息学分析被引量：2: 2018年; 小麦的野生近缘植物,尤其山羊草属中含有丰富的抗病虫基因,是小麦遗传育种的重要基因来源。针对禾谷镰刀菌入侵引起的小麦赤霉病,在山羊草属中尚未找到相应抗性基因。多药抗性基因(pleiotropic drug resistance, PDR)是ABC (ATP-binding cassette)转运蛋白基因三大亚家族中的一个,具有对生物和非生物胁迫的广谱抗性。本研究以D、C、U、M、S染色体基组的山羊草属植物为研究材料,对PDR7基因进行分离鉴定和生物信息学分析。结果表明,这些PDR7基因为半个PDR基因,具有PDR基因的典型结构域,是膜蛋白;同源序列对比和进化分析均表明,在山羊草属植物中,PDR7基因具有高度的保守性。以AePDR7为代表进行了启动子预测,表明AePDR7对禾谷镰刀菌等真菌、脱氧雪腐镰刀烯醇(deoxynivalenol, DON)、生物激素、盐胁迫、冷胁迫、干旱胁迫等均有响应元件,说明其可能是一个广谱抗性基因。; 侯文倩李小梅谢玫瑰张磊穆可卿郭娟蒋克云杜旭烨令狐绍凤常红毯; 关键词：小麦野生近缘植物生物信息学分析

乌拉尔图小麦(Triticum urartu)多药抗性基因TuPDR7的生物信息学分析: 2018年; 多药抗性基因(pleiotropic drug resistance,PDR)是ATP-bindingCassette(ABC)转运蛋白基因三大亚家族中的一个,具有对生物和非生物胁迫的广谱抗性。本研究以乌拉尔图小麦为材料,以小麦TaPDR7基因序列为探针,在乌拉尔图小麦的DNA、CDS和氨基酸序列数据库中搜索到同源序列,命名为TuPDR7,并对其进行生物信息学分析。结果表明,TuPDR7长4140bp,编码1379个氨基酸,预测其蛋白分子量为155.5kD,等电点为6.1,是一个膜蛋白。同源序列比对和三级结构预测显示TuPDR7具有PDR基因典型的结构域。启动子预测表明TuPDR7含有对禾谷镰刀菌等真菌、脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)、生物激素、盐胁迫、冷胁迫、干旱胁迫等的响应元件,说明其可能是一个广谱抗性基因,对于乌拉尔图小麦的抗性研究具有重要意义。; 侯文倩杜旭烨张磊郭娟谢玫瑰李小梅蒋克云; 关键词：生物信息学分析

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