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中医特禀体质研究的切入点——基因表达芯片技术被引量:1
2017年
随着近年来中医体质学的飞速发展,应用基因表达芯片技术对体质微观机制的揭示也逐渐成为了研究热点,特别在揭示中医特禀体质与过敏性疾病的相关性方面,为特禀体质的预防提供了全新的思路。如能在今后的研究中借鉴表观遗传学等新的现代科学实验技术,将会在此基础上更大地促进中医体质学的发展。
康陆佼张亚军
关键词:基因表达谱芯片技术
Affymetrix基因表达芯片技术筛选胰腺癌异常表达基因的研究被引量:5
2017年
目的:利用基因表达芯片筛选出胰腺癌组织与癌旁正常组织的差异表达基因。方法:收集新疆医科大学第三附属医院2014年1月—2016年6月间手术切除的10例胰腺导管细胞癌组织及其相应癌旁正常组织,用TRIzol法提取总RNA后采用含49395个基因探针的Affymetrix基因表达芯片筛选出差异表达基因,并行GO分析和pathway分析,对部分差异表达基因行实时定量PCR法验证表达情况。结果:样本总RNA检测合格,基因芯片质量评估良好,检测结果可靠且可重复性高。经芯片降噪处理后共检测38079个基因,其中存在差异表达基因共512个,表达上调的基因419个,表达下调的基因93个;共287个差异表达基因编码与3个GO分类(生物学过程、分子功能、细胞组分)相关的蛋白;共29条信号通路存在明显基因差异表达,涉及126个基因。经PCR验证,差异表达基因CPB1、CELA3B、CPA1、POSTN、PLA2G1B、CTRC及SPINK1的表达情况与基因芯片检测结果吻合。结论:胰腺导管细胞癌组织与癌旁正常组织间存在大量差异表达基因,这些基因主要与生物学过程、分子功能及细胞组分相关,且参与了多个细胞信号通路的调控。
易超依马木买买提江.阿布拉丁伟苏雅婷晏冬李海军
关键词:基因表达谱芯片分析技术基因本体
利用基因表达芯片技术研究ALA-PDT对白血病细胞株HL-60的作用机制
2016年
目的:研究探讨5-氨基乙酰丙酸介导的光动力疗法(ALA-PDT)对白血病细胞株HL-60的作用机制。方法:以白血病细胞株HL-60为实验模型。实验分为2组,对照组(未处理组)及ALA+PDT组。利用人全基因基因表达芯片技术研究ALA-PDT后HL-60细胞基因改变情况。结果:人全基因芯片共检测了48 000个基因,用RT-PCR的方法验证了数据的可靠性,对芯片结果产生的数据分析发现:ALA-PDT影响了细胞的多种生命进程,如转录调控,抑制翻译过程;促进一系列应激反应;上调促凋亡基因表达,抑制抗凋亡基因表达,促进凋亡的发生。结论:ALA-PDT通过诱导凋亡的方式杀伤HL-60细胞。多种调控机制参与凋亡的发生:c-Abl和PML基因是上调基因网络中的主导基因,共同参与了凋亡的发生。线粒体途径和TNF途径激活,DEDD2及CDC2L2介导的凋亡通路也占了一定的地位。ERN1、Bcl2、及c-Jun等基因参与其中促进凋亡的发生。
韩晓凤倪蓓文钟济华陈芳源
关键词:5-氨基乙酰丙酸光动力学治疗基因表达谱芯片技术
采用基因表达芯片技术研究锌α2糖蛋白对肥胖小鼠肝脏基因表达的影响被引量:3
2016年
目的采用基因芯片技术研究锌α2糖蛋白(ZAG)对肥胖小鼠肝脏基因表达的影响。方法通过高脂饮食诱导建立肥胖ICR小鼠模型,将21只成模小鼠以随机数字表法分为ZAG干预组(n=8)和高脂饮食组(HFD组,n=13),另取空白对照ICR大鼠10只作为普通饮食组(SF组,n=10)。给予ZAG组小鼠腹腔注射ZAG表达质粒干预及高脂饮食喂养,HFD组小鼠腹腔注射等体积的生理盐水及高脂饮食喂养,SF组小鼠腹腔注射等体积的生理盐水及普通饲料喂养。干预8周后,测定各组小鼠血糖、血脂、胰岛素水平等生化指标。用基因表达芯片观察ZAG组和HFD组小鼠肝脏组织基因表达,尤其是糖脂代谢相关基因表达的变化,并用荧光定量聚合酶链反应(PCR)法进一步对部分差异基因表达进行验证。两样本均值的比较用独立样本的t检验。结果干预8周后,ZAG组小鼠的体重、体脂和空腹血糖水平均较HFD组分别降低了14.5%、57.17%和35.5%,3组间差异有统计学意义(F=7.948、18.941、4.327,均P〈0.05)。基因芯片技术发现ZAG干预后,肥胖小鼠的肝脏组织中共有424个基因表达发生了变化,其中上调基因299个,下调基因125个。与糖脂代谢相关的基因共有6个:烯酰辅酶A(Ehhadh)、3-酮脂酰基CoA硫解酶1(ACAA1)、长链酰基辅酶A合成酶家族成员1(ACSL1)、葡萄糖6磷酸酶(G6P)、过氧化物酶体增殖物激活受体共激活因子1α(PGC-1α)和细胞因子信号抑制因子(SOCS3)。其中PGC-1α和SOCS3基因表达分别升高到HFD组的1.97和4.15倍;而Ehhadh、ACAA1、ACSL1、G6P等基因表达均下调,分别为HFD组的0.35、0.58、0.52和0.33倍。实时荧光定量PCR验证部分基因,结果与基因芯片的检测结果一致。结论ZAG可显著改善肥胖小鼠的糖脂代谢,可能与其抑制肝脏组织ACSL1和G6P表达、促进PGC-1α和GYS2�
刘美娟戴宇飞朱惠娟潘慧李乃适王林杰阳洪波龚凤英
关键词:糖脂代谢
应用基因表达芯片技术研究Rituximab的耐药机制被引量:1
2015年
目的应用基因表达芯片技术检测Rituximab耐药细胞株差异表达基因、富集信号通路及相关生物学行为,初步探讨Rituximab的耐药机制。方法成功构建Rituximab耐药B细胞性非霍奇金淋巴瘤细胞株Jeko-1/R和Raji/R,应用基因表达芯片技术检测耐药细胞株与亲本细胞株的差异表达基因,用KEGG数据库及DAVID软件进行生物信息学分析。结果在两株Rituximab耐药细胞株中,同为上调和同为下调表达的差异基因分别有70个和42个;KEGG通路分析提示Rituximab耐药细胞与亲本细胞相比,MAPK信号通路呈富集;基因本体论(gene ontology,GO)分析提示耐药细胞生物学行为表现主要集中在抗凋亡、促增殖、促血管发育等方面。结论与Rituximab耐药关系最密切的通路可能为MAPK信号通路,其机制可能是Rituximab激活MAPK信号通路后抑制肿瘤细胞凋亡,促进肿瘤细胞增殖及促进肿瘤血管发育,这为预测Rituximab耐药及逆转耐药提供了理论依据。
潘梅芳岑洪谭晓虹王明月
关键词:淋巴瘤RITUXIMAB药物耐药基因表达谱芯片MAPK信号通路
基因表达芯片技术研究肝脏脂肪积累相关基因
非酒精性脂肪肝是一种非常常见的肝脏疾病,近年来,由于人们生活水平的改善,生活方式的改变,脂肪肝的发病率越来越高,尤其是在生活水平高的发达国家及地区。非酒精性脂肪肝进一步恶化则会发展成为肝硬化,甚至肝癌。非酒精性脂肪肝的发...
安超强
关键词:基因表达谱芯片技术非酒精性脂肪肝雷帕霉素
文献传递
基因表达芯片技术进展及其在中药网络药理学研究中的应用被引量:3
2014年
近年来网络药理学为阐明中药复杂化学体系与复杂生物系统的相互作用提供了新的思路,然而由于相关研究所需信息量大,传统的分子生物学技术已难以达到研究需要。全转录组表达芯片通过对基因表达进行高通量检测和分析,为中药复杂体系的作用机制研究提供重要技术支持。文章介绍了基因芯片技术在网络药理学的最新应用进展,以白脉散有效成分组研究为例,介绍了表达芯片技术的基本应用方法,分析了表达芯片技术在中药网络药理学研究中应用的前景。
刘庆山陈小玉庄述娟
关键词:中药网络药理学基因表达谱芯片
基因表达芯片技术研究炎症状态下塞来昔布对关节软骨细胞PGE2相关基因表达的影响
目的:利用Affymetric Human gene1.0基因表达芯片对COX-2选择性抑制剂塞来昔布对关节软骨细胞在炎性状态下PGE2合成相关基因表达的改变进行研究,为塞来昔布的作用机制提供基因学数据,并验证基因表...
孙天闻
关键词:COX-2选择性抑制剂塞来昔布基因表达谱芯片
基因表达芯片技术筛选肾癌细胞OS-RC-2骨转移相关基因
目的建立肾癌细胞OS-RC-2骨转移动物模型,获得病灶肿瘤细胞株,并对两组细胞间的基因表达进行对比分析,筛选差异表达基因。 方法通过胫骨平台向胫骨髓腔内注射OS-RC-2细胞,待局部成瘤后取病灶肿瘤细胞,循环注...
赵晓林
关键词:HSP90
文献传递
基因表达芯片技术筛选涎腺腺样囊性癌ACC-2/BLM细胞耐药相关基因
2011年
目的:应用高通量基因芯片技术对涎腺腺样囊性癌细胞系ACC-2及其多药耐药细胞株ACC-2/BLM的基因表达进行对比分析,筛选差异表达基因。方法:以涎腺腺样囊性癌细胞系ACC-2及其耐药细胞ACC-2/BLM作为研究对象,提取mRNA,逆转录为cDNA,用Cy3和Cy5荧光染料标记,制备成cDNA探针,与表达芯片进行杂交扫描和分析;并应用Real-Time-PCR技术对其中6个基因进行验证。结果:在45 015个基因表达的筛选中,2 294个基因表达差异(2倍以上),其中1 310个基因表达水平上调,984个基因表达水平下调。使用RT-PCR和RealTime PCR技术对其中6个基因表达差异进行验证,验证结果与基因芯片结果一致。结论:涎腺腺样囊性癌ACC-2/BLM细胞耐药性与多个基因相关。
蔡卜磊徐小方秦楠缪叶吴军正
关键词:基因芯片

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成军
作品数:1,456被引量:5,896H指数:36
供职机构:中国人民解放军
研究主题:乙型肝炎病毒 丙型肝炎病毒 反式激活基因 反式激活 HBV
刘妍
作品数:618被引量:1,597H指数:29
供职机构:吉林大学
研究主题:乙型肝炎病毒 丙型肝炎病毒 反式激活 反式激活基因 HBV
王建军
作品数:174被引量:513H指数:16
供职机构:中国人民解放军
研究主题:丙型肝炎病毒 乙型肝炎病毒 反式激活基因 反式激活 克隆化研究
纪冬
作品数:231被引量:891H指数:14
供职机构:中国人民解放军总医院
研究主题:丙型肝炎病毒 乙型肝炎病毒 反式激活基因 抑制性消减杂交技术 反式激活
董菁
作品数:153被引量:679H指数:23
供职机构:厦门大学附属中山医院
研究主题:乙型肝炎病毒 HBV 准种 乙型肝炎 反式激活