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- 一种用于定量检测人类免疫缺陷病毒1型的引物探针组及其应用
- 本发明的第一方面，提供了一种用于定量检测人类免疫缺陷病毒1型的引物探针组。根据HIV‑1M和HIV‑1N型基因组的高度保守LTR基因，设计了LTR基因的引物探针组；根据HIV‑1O型基因组的高度保守POL基因，设计了PO...
- 周艳琼林元奎卜庆廷郦月萍徐爱芳武静左中宝黄潇潇郁文燕臧伟庆尤其敏林艺志
- 检测人类免疫缺陷病毒1型的恒温扩增引物探针组、试剂盒及方法
- 本申请实施例属于病原体检测技术领域，涉及一种检测人类免疫缺陷病毒1型的恒温扩增引物探针组、试剂盒及方法，所述恒温扩增引物探针组包括上游引物、下游引物和探针；其中，所述上游引物的核苷酸序列为CATAATTGGAAGAAAT...
- 蒋析文彭春梅董子维秦慧沈丹霓
- 2023年河南省人类免疫缺陷病毒1型感染者治疗前耐药特征分析
- 2024年
- 目的监测河南省2023年未接受抗反转录病毒治疗(ART)的{1}(HIV)-1感染者HIV-1基因亚型分布和治疗前耐药突变情况,为了解河南省HIV-1耐药株传播和制订ART方案提供数据支持。方法收集2023年1月至12月于郑州市第六人民医院就诊的未接受ART的HIV-1感染者的临床资料和耐药情况。本研究为横断面研究。采集患者血浆样本,通过反转录-巢式聚合酶链反应扩增HIV-1部分pol区基因序列及整合酶基因序列。通过REGA HIV-1亚型分析工具确定HIV-1分离株的亚型,使用美国斯坦福大学HIV耐药数据库对其基因耐药突变和抗病毒药物敏感性进行分析。结果1073例未接受ART的HIV-1感染者中,1042例患者的样本被成功扩增,扩增成功率为97.11%,共检测到12种HIV基因亚型,构成比前5位的亚型依次为流行重组型(CRF)07BC[43.76%(456/1042)]、CRF01AE[25.91%(270/1042)]、B[20.92%(218/1042)]、CRF5501B[5.28%(55/1042)]和CRF08BC[1.25%(13/1042)]。HIV-1感染者ART前总耐药突变率为28.89%(301/1042)。其中非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)耐药突变率为20.92%(218/1042),核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)为4.03%(42/1042),蛋白酶抑制剂(PI)为3.84%(40/1042),整合酶抑制剂(INSTI)为2.98%(31/1042)。V179位点[12.96%(135/1042)]是最常见的NNRTI相关突变位点,M184位点[2.40%(25/1042)]是最常见的NRTI相关突变位点,Q58[2.78%(29/1042)]和E157[1.44%(15/1042)]位点分别在PI和INSTI相关突变位点中最为常见。结论河南省未接受ART的HIV-1感染者基因亚型分布呈多样化,耐药率呈中度流行水平,应继续加强ART前耐药的密切监测。
- 刘金瑾赵清霞张晓华位曙光霍玉奇
- 关键词：人类免疫缺陷病毒抗逆转录病毒治疗基因亚型
- 一种筛选、鉴别人类免疫缺陷病毒1型独特重组型毒株和流行重组型毒株的方法
- 本发明公开了一种筛选、鉴别人类免疫缺陷病毒1型独特重组型毒株和流行重组型毒株的方法，其根据HIV‑1易发生断点突变区的扩增片段产生的mosaic图，与已公布的CRFs的mosaic图进行比对，筛选出具有新mosaic图的...
- 曹凯李鑫曹珊
- 云南省抗病毒治疗失败的{1}感染/艾滋病患者中{1}1型pol区多态性位点的分布被引量：1
- 2023年
- 目的探讨人类免疫缺陷病毒感染/艾滋病(HIV/AIDS)患者接受高效抗反转录{1}治疗(HAART)过程中耐药的发生与多态性位点分布规律间的关系。方法纳入2015年6月至2021年12月云南省16个地级行政区成功扩增得到pol区基因序列的HAART失败HIV/AIDS患者,采用人类免疫缺陷病毒(HIV)局部序列排比检索基本工具(BLAST)对序列进行亚型鉴定,MEGA 6.0软件进行亚型验证。将样本序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药位点比对。分析不同耐药程度、治疗方案和HIV-1亚型患者的多态性位点分布情况。采用趋势χ^(2)检验分析不同耐药程度患者多态性位点出现频率变化趋势。统计学比较采用χ^(2)检验并作事后两两比较。结果1453例患者扩增获得序列,耐药检测结果为敏感者954例,潜在或低度耐药者224例,中度耐药者189例,高度耐药者86例。随着HIV-1耐药程度的增加,HIV-1蛋白酶区(PR区)I15V、L19I、D60E和反转录酶区(RT区)E36A、T39D、S48T位点出现频率呈下降趋势(χ^(2)趋势=19.86、9.16、13.66、37.64、18.44、40.86,均P<0.01),PR区V77I和RT区K122E呈上升趋势(χ^(2)趋势=12.19、10.03,均P<0.01)。齐多夫定+拉米夫定+洛匹那韦/利托那韦、齐多夫定+拉米夫定+依非韦伦、齐多夫定+拉米夫定+奈韦拉平和替诺福韦+拉米夫定+依非韦伦治疗组患者PR区E35D、M36I、D60E和RT区S48T、K122E、R211K位点的频率差异均有统计学意义(χ^(2)=22.46、9.32、14.46、26.85、18.92、24.26,均P<0.05)。经两两比较,E35D、M36I、D60E位点在齐多夫定+拉米夫定+洛匹那韦/利托那韦组的频率,S48T在齐多夫定+拉米夫定+依非韦伦组的频率,K122E在齐多夫定+拉米夫定+奈韦拉平组的频率,以及R211K在替诺福韦+拉米夫定+依非韦伦组的频率分别高于其他3组,差异均有统计学意义(均P<0.008)。流行重组型(CRF)08BC、CRF07BC和CRF01AE亚型患者中PR区T12S、I15V、L19I、M36I、V77I、L89M和
- 李健健程鹏刘家法王佳丽杨翠先杨壁珲张米董兴齐
- 关键词：HIV-1抗逆转录病毒治疗多态性位点
- 一种人类免疫缺陷病毒1型核酸测定试剂盒及其操作方法
- 一种人类免疫缺陷病毒1型核酸测定试剂盒及其操作方法，所述试剂盒包括针对下述保守区的三套引物和探针：Gag区、Pol区和Ltr区；三套引物和探针的具体序列与说明书相同。本公开实施例提供的试剂盒的检测范围能够覆盖中国国内的主...
- 占明明
- 人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型检测法及试剂盒
- 本发明涉及人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型检测法及试剂盒，属于分子生物技术领域。具体而言，本发明提供了用于检测人类免疫缺陷病毒1型(HIV‑1)耐药基因型的引物组，用来扩增POL基因区的PR区(A区)和RT区(B区+C区)...
- 周素娟
- 基于随机森林模型的人类免疫缺陷病毒1亚型整合酶抑制剂的虚拟筛选
- 2022年
- 目的:基于计算机辅助药物设计技术中的随机森林模型,筛选出具有潜在成药性和有人类免疫缺陷病毒1亚型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)整合酶抑制活性的化合物,为HIV-1整合酶抑制剂的开发提供参考。方法:使用关键词从ChEMBL、BindingDB数据库检索出与HIV-1整合酶相关的小分子的数据资料,借助MOE软件、Knime软件等工具构建筛选HIV-1整合酶抑制剂的随机森林模型,并对从ChemDiv数据库中筛选出的小分子进行相似度验证,最后使用ADMET lab工具进行成药性分析。结果:从ChEMBL和Binding DB数据库中收集到5459个具有IC_(50)值的小分子,通过随机森林模型和相似性搜索筛选出1267个小分子,将其与作为配体的多替拉韦进行分子对接,得到24个最有小分子,再以ADMET lab软件对其进行成药性分析,最终得到5个成药性较好的小分子,其中最优的2个分子各项吸收指标均较佳,且清除率高、毒性较低。结论:通过随机森林模型的筛选和后续软件工具的虚拟验证,共得到5个具有较好成药性的HIV-1整合酶抑制剂。
- 王震霆卢熙奎伍湘平黄凌于慧敏李靖阳肖坚
- 关键词：分子对接
- 一种人类免疫缺陷病毒1型核酸定量检测试剂盒
- 本发明提供了一种人类免疫缺陷病毒1型核酸定量检测试剂盒，具体地，本发明利用实时荧光聚合酶链式反应技术对HIV‑1 RNA核酸鉴别并且进行定量的检测试剂盒，可广泛应用于HIV{1}引起的艾滋病的窗口期检测、临床诊断、科学研究...
- 蒋析文夏乔李汉荣杨鸿辉廖丽丽王晶晶唐康明
- 人类免疫缺陷病毒1型p24抗原检测技术的研究进展被引量：1
- 2022年
- 人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)-1 p24抗原是HIV感染者体内最早出现的{1}蛋白之一,可作为诊断标志物将检测“窗口期”缩短至14 d左右,在HIV感染的早期诊断、抗{1}治疗监测等过程中至关重要。该文对HIV-1 p24抗原基本结构和检测临床意义进行简要描述,重点介绍国内外现有的基于新型纳米材料等对HIV-1 p24抗原的检测新技术研究,旨在了解基于新型纳米材料、新型化学反应等的生物传感器,以期为新检测技术的建立提供参考。
- 唐卓芸王中浩魏垠昊李冬冬陶传敏
- 关键词：人类免疫缺陷病毒P24抗原
