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神经元表达发育下调基因9诊断胰腺癌及其对患者预后的预测价值: 2023年; 【目的】探讨神经元表达发育下调基因9(NEDD9)诊断胰腺癌及其预测患者预后的价值。【方法】80例在本院首次就诊并经手术中快速病理活检证实的胰腺癌患者,收集患者胰腺癌组织及癌旁正常组织,采用免疫组化及qPCR技术检测各组织NEDD9的表达情况,分析NEDD9与胰腺癌患者临床特征的关系,探讨NDEE9对胰腺癌患者临床预后的影响。【结果】胰腺癌组织中的NEDD9高表达率为71.25%,显著高于癌旁组织的51.25%(P<0.05),其NEDD9 mRNA水平(0.92±0.17)也显著高于癌旁正常组织(0.33±0.09),差异有统计学意义P<0.05);低表达NEDD9患者的临床分期(Ⅰ~Ⅱ期)、分化程度(高分化)显著优于高表达NEDD9患者,同时淋巴结转移率显著低于高表达患者(均P<0.05);随访结果显示,发生预后不良的患者NEDD9表达水平(1.21±0.31)显著高于预后良好组(0.73±0.25)(P<0.05);二元Logistic回归分析显示,高表达NEDD9是胰腺癌患者预后不佳的独立危险因素,其优势比为2.18(1.16~4.01)。【结论】NEDD9在胰腺癌组织中呈显著高表达,且与患者临床分期及病例分级有相关性,NEDD9高表达是胰腺癌患者预后不佳的独立危险因素。; 徐玉何海涛魏志力查育锋何晓虎周彬周泽刘文涛; 关键词：基因预后

下调基因表达的试剂在制备前列腺癌药物中的应用: 本发明提供了下调基因表达的试剂在制备前列腺癌药物中的应用，属于肿瘤生物学技术领域。本发明发现下调基因Lnc‑RP5‑952N6.1在前列腺癌细胞中的高表达可以有效的抑制前列腺癌细胞的增殖和转移，因此可将下调基因Lnc‑R...; 夏志明侯东省张亚洲周霞; 文献传递

下调基因表达的试剂在制备前列腺癌药物中的应用: 本发明提供了下调基因表达的试剂在制备前列腺癌药物中的应用，属于肿瘤生物学技术领域。本发明发现下调基因Lnc‑RP5‑952N6.1在前列腺癌细胞中的高表达可以有效的抑制前列腺癌细胞的增殖和转移，因此可将下调基因Lnc‑R...; 夏志明侯东省张亚洲周霞; 文献传递

基于RNA-Seq技术挖掘贵州白山羊公羊背最长肌生长发育下调基因被引量：1: 2021年; 旨在探讨性别对贵州白山羊肌肉生长和肉品质影响的分子遗传机制,筛选出公羊背最长肌生长发育相关的下调基因。本研究采集6只同等饲养水平条件下、2周岁龄贵州白山羊背最长肌(公、母羊各3只),然后基于RNA-Seq技术分析背最长肌RNA表达情况,筛选出差异表达下调基因,并进行GO和KEGG信号通路分析,最后选取4个差异表达下调基因进行RT-PCR验证。结果显示,在所有山羊背最长肌样本中共检测到25089个有效基因(FPKM≥1,P<0.05),共筛选出514个在公羊背最长肌中显著下调的基因,其中100个为新注释到的关联基因。对获得的514个差异表达基因mRNA进行GO功能富集分析,可主要分为生物学过程和细胞组分两大类,包含21个亚类。KEGG信号通路分析发现被注释的差异基因共参与145条信号通路,其中参与核糖体信号通路的基因最为富集,共有27个基因被注释到对应的25个核糖体蛋白上。对选取的4个差异表达下调候选基因KLF11、TNS1、SIK2和IGF1R进行验证,RT-PCR结果表明4个候选基因的mRNA表达趋势与RNA-Seq检测结果一致,且差异均比较显著(P<0.05),与测序结果一致,表明RNA-Seq测序结果可靠。综上,本研究基于RNA-Seq技术共获得贵州白山羊公羊背最长肌下调基因514个,其中100个为新发掘基因,参与核糖体信号通路的基因最为富集。初步认为筛选获得的基因可作为探究贵州白山羊肌肉生长发育的候选基因,对贵州白山羊肌肉生长发育的分子改良提供了依据。; 安清明王星吴震洋孟金柱赵园园; 关键词：贵州白山羊背最长肌生长发育

干扰素抗病毒效应基因的鉴定分类与下调基因抗病毒功能研究: 干扰素(Interferon，IFN)是一种重要的细胞因子，在真核生物细胞应对病毒侵染过程中发挥着极其关键的防御作用，而干扰素及其衍生物也被长期用于应对多种病毒感染引起的疾病的治疗。尽管人们已经广泛的研究了干扰素信号通路...; 樊心蕊; 关键词：干扰素抗病毒蛋白信号通路

使用RIB7启动子下调基因表达的假囊酵母属的遗传修饰: 本发明涉及在生物体中生产核黄素的方法，所述生物体被遗传修饰为用RIB7启动子替代编码负面影响核黄素生产的蛋白质的至少一个基因的天然启动子，所述方法包括在合适的培养基中生长所述生物体和从培养基分离核黄素。本发明还涉及属于假...; B·霍夫A·莫尔特S·哈夫纳O·策尔德尔J·L·雷韦尔塔多瓦尔R·莱德斯马-阿马罗R·马丁内斯布埃A·希门尼斯加西亚; 文献传递

牛卵泡发育相关下调基因的筛选被引量：2: 2020年; 为寻找牛卵泡颗粒细胞(GCs)凋亡的关键调控因子,阐明单胎动物卵泡闭锁调控机理,本研究对奶牛优势卵泡与从属卵泡GCs深度测序,筛选卵泡发育相关的下调基因。选取健康荷斯坦奶牛,屠宰后,分别采集卵巢上正常发育的最大卵泡(8~10 mm)与第二大卵泡(5~8mm),并结合雌激素/孕激素确定卵泡优势与否,优势卵泡(DF):E2/P>1;从属卵泡(SF)E2/P<1。分别刮取GCs,提取总RNA并建库,Illumina测序,将获得序列与牛Refseq数据库比对后,利用DESeq2软件对获得的RNA进行差异表达分析,并对其中表达下调的基因进行GO和KEGG信号通路分析,最后通过Real-time PCR对筛选出的表达下调基因进行验证。测序共获得32346个基因,其中194个在DF中表达显著上调,502个表达下调;GO分析结果显示,这些下调基因的生物学功能共分为3大类104组,其中生物学过程相关基因占61.5%,细胞组分有关基因占25.0%,分子功能相关基因占13.5%;KEGG信号通路分析,共发现5条通路,其中基因富集最为显著的是癌症通路;从下调基因中筛选出4个在牛卵泡发育过程中可能会起抑制作用的基因,QRT-PCR结果显示,PPP1R14A、QRFPR和EGR1在DF和SF中的表达趋势与深度测序结果一致,OLA1在DF和SF中的表达趋势与深度测序结果正好相反,但差异不显著。本研究筛选出的4个表达下调基因可能是牛卵泡发育过程中抑制卵泡发育的候选基因。; 赵园园赵成刚安清明武渊勋孟金柱; 关键词：卵泡发育下调基因

基于RNA-seq技术筛选山羊卵泡发育相关下调基因: 2020年; 【目的】对山羊优势卵泡(DF)和从属卵泡(SF)颗粒细胞进行高通量测序,筛选并研究与山羊卵泡发育相关的下调基因。【方法】以1岁龄贵州白山羊为供试对象,在其发情3 d后,采集第一卵泡波中的优势卵泡(DF)和从属卵泡(SF),分别分离其颗粒细胞,提取RNA并进行文库构建、Illumina测序,将获得的序列与山羊的RefSeq数据库进行比对后,用DESeq2软件对获得的RNA进行差异表达分析,并对表达下调的基因进行GO分析和KEGG信号通路分析,最后通过Real-time PCR对筛选出的表达下调基因进行验证。【结果】将测序结果与山羊的RefSeq数据库比对后,共获得了33896个基因。经DESeq2软件对获得的mRNA进行差异表达分析,共获得695个差异表达m-RNA,其中462个表达显著下调,233个表达则显著上调;对462个表达下调基因进行GO分析,共分为2大类39组,其中参与生物学过程(BP)的基因占48.7%;与细胞组分(CC)有关的基因占51.3%。KEGG信号通路分析发现20条通路,其中参与癌症通路基因富集最为显著。从下调基因中筛选出6个可能会抑制山羊卵泡发育的基因,分别为PTX3、LDLR、RGN、NID1、PDLIM5、PRLR。Real-time PCR结果显示,RGN、NID1、PDLIM5、PRLR在SF与DF中的表达趋势与高通量测序结果一致,且RGN在SF颗粒细胞中的表达量极显著高于DF(P<0.01),NID1、PDLIM5在SF颗粒细胞中的表达量显著高于DF(P<0.05);PTX3、LDLR在SF与DF中表达量与高通量测序结果相反。【结论】获得的6个表达下调基因在山羊卵泡发育过程中可能会抑制卵泡的发育,最终导致卵泡闭锁。; 孟金柱李鹏飞许勤智赵园园; 关键词：山羊卵泡发育下调基因高通量测序

MicroRNA-218靶向神经元表达发育下调基因9对胃癌细胞增殖和侵袭的影响被引量：1: 2020年; 目的观察microRNA-218(miR-218)对胃癌细胞SGC-7901增殖和侵袭的影响,并探讨其作用机制。方法体外培养人胃癌细胞SGC-7901,将对数生长期细胞分为空白对照组、阴性对照组和miR-218 mimics组,阴性对照组和miR-218 mimics组细胞分别转染阴性对照序列和miR-218 mimics,空白对照组细胞不进行转染。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测3组细胞中miR-218表达,细胞计数试剂盒-8检测3组细胞培养24、48、72、96 h时的增殖活性;平板细胞克隆形成实验检测3组细胞克隆能力;Transwell实验检测3组细胞侵袭能力;Western blot法检测3组细胞中神经元表达发育下调基因9(NEDD9)蛋白、E-钙黏蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(vimentin)、神经型钙黏附蛋白(N-cadherin)的表达。将SGC-7901细胞分为阴性对照组+NEDD93′非编码区(3′UTR)-Wt组(阴性对照序列、pCHECK2-NEDD93′UTR-Wt共转入SGC-7901细胞)、miR-218 mimics+NEDD93′UTR-Wt组(miR-218 mimics、pCHECK2-NEDD93′UTR-Wt共转入SGC-7901细胞)、阴性对照组+NEDD93′UTR-Mut组(阴性对照序列、pCHECK2-NEDD93′UTR-Mut共转入SGC-7901细胞)、miR-218 mimics+NEDD93′UTR-Mut组(miR-218 mimics、pCHECK2-NEDD93′UTR-Mut共转入SGC-7901细胞),常规培养48 h后收集各组细胞,采用发光检测仪测定各组细胞中荧光素酶活性,分析miR-218与NEDD9的靶向关系。结果与空白对照组和阴性对照组比较,miR-218 mimics组细胞中miR-218表达及培养24、48、72、96 h时细胞增殖抑制率显著升高(P<0.05),NEDD9蛋白表达及细胞克隆形成数量和侵袭细胞数量显著减少(P<0.05);空白对照组与阴性对照组细胞中以上各指标比较差异均无统计学意义(P>0.05)。miR-218 mimics+NEDD93′UTR-Wt组细胞中荧光素酶活性显著低于阴性对照组+NEDD93′UTR-Wt组、阴性对照组+NEDD93′UTR-Mut组和miR-218 mimics+NEDD93′UTR-Mut组(P<0.05)。与空白对照组和阴性对照组比较,miR-218 mimics组细胞中E-cadherin蛋白表达显著升高,; 夏云展李荣振杨金花李琼; 关键词：胃癌增殖

下调基因PTTG1对人胶质瘤细胞SHG44增殖、凋亡、迁移和侵袭能力的影响被引量：13: 2019年; 背景与目的:研究表明垂体瘤转化基因1(pituitary tumor-transforming gene 1,PTTG1)在多种癌症中高表达。该研究旨在探讨其对胶质瘤细胞SHG44增殖、凋亡、迁移和侵袭能力的影响。方法:用PTTG1 siRNA干扰胶质瘤细胞SHG44的基因表达,通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分别在mRNA和蛋白质水平上评估PTTG1沉默效率,进一步检测其对SHG44细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭能力的影响。结果:沉默PTTG1基因表达可以显著抑制SHG44细胞增殖(P<0.05)、迁移(P<0.01)和侵袭(P<0.001)能力,增加细胞凋亡(P<0.05)。结论:下调PTTG1的表达可以降低神经胶质瘤的恶化程度,有望成为临床胶质瘤治疗的新靶点。; 崔立山林婷徐岚溪王冠玲林建斌冯三平曹洋曹颖宋正茂金鑫; 关键词：SHG44 增殖凋亡

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